WikiDer > КАРТА

AMAP
КАРТА
Разработчики)Ариэль Шварц (Калифорнийский университет в Беркли), Лиор Пахтер (Калифорнийский университет в Беркли)
Стабильный выпуск
2.0
Операционная системаUNIX, Linux, Mac
ТипИнструмент биоинформатики
ЛицензияОткрытый исходный код
Интернет сайтAMAP скачать

КАРТА это множественное выравнивание последовательностей программа на основе последовательный отжиг.[1] Этот подход состоит в построении множественного выравнивания по одному совпадению за раз, тем самым обходя многие проблемы прогрессивного выравнивания. Параметры AMAP можно использовать для настройки компромисса между чувствительностью и специфичностью.

Программу можно использовать через веб-сервер AMAP или как отдельную программу, которую можно установить вместе с исходным кодом.

Ввод, вывод

Эта программа принимает последовательности в Формат FASTA.

Формат вывода включает: Формат FASTA, Clustal.

использованная литература

  1. ^ S. Schwartz, A .; Пахтер, Л. (19 января 2007 г.). «Множественное выравнивание путем отжига последовательностей». Биоинформатика. 23 (2): e24 – e29. Дои:10.1093 / биоинформатика / btl311.

внешние ссылки