WikiDer > Актинобактерии

Actinobacteria

Актинобактерии
Actinomyces israelii.jpg
Сканирующая электронная микрофотография из Actinomyces israelii.
Научная классификация е
Домен:Бактерии
(без рейтинга):Террабактерии
Тип:Актинобактерии
Гудфеллоу, 2012
Классы
Синонимы
  • Actinobacteraeota Орен и др. 2015 г.
  • Актинобактерии Стакебрандт, Рейни и Уорд-Рейни 1997
  • Актиномицеты Красильников 1949

В Актинобактерии являются типом Грамположительные бактерии. Они могут быть земной или же водный.[1] Они имеют большое экономическое значение для людей, потому что сельское хозяйство и леса зависят от их вклада в почва системы. В почве они помогают разлагать в органическая материя мертвых организмов, так что молекулы могут быть снова поглощены растения. Хотя эту роль также играет грибы, Актинобактерии намного меньше и, вероятно, не занимают экологическая ниша. В этой роли колонии часто разрастаются мицелия, как гриб, и название важного отряда типа, Актиномицеты (актиномицеты), отражает то, что долгое время они считались грибами. Некоторые почвенные актинобактерии (например, Frankia) жить симбиотически с растениями, чьи корни пронизывают почву, фиксация азота для растений в обмен на доступ к некоторым из растений сахариды. Другие виды, такие как многие представители рода Микобактерии, важные патогены.

Помимо большого интереса к актинобактериям из-за их роли в почве, о них еще многое предстоит узнать. Хотя в настоящее время они рассматриваются в первую очередь как почвенные бактерии, они могут быть более многочисленными в пресных водах.[2] Актинобактерии являются одним из доминирующих типов бактерий и содержат один из крупнейших родов бактерий, Streptomyces.[3] Streptomyces и другие актинобактерии вносят основной вклад в биологические буферизация почв.[4] Они также являются источником многих антибиотики.

Хотя некоторые из самых крупных и сложных бактериальных клеток принадлежат к актинобактериям, группа морских Actinomarinales была описана как обладающая самыми маленькими свободноживущими клетками. прокариотический клетки.[5]

Немного Сибирский или же Антарктика Актинобактерии считаются самым старым живым организмом на Земле, замороженным в вечной мерзлоте около полумиллиона лет назад.[6][7] Симптомы жизни были обнаружены CO
2
выпуск из мерзлоты пробы 640 тыс. лет назад и моложе. [8]

Общий

Большинство актинобактерий, имеющих медицинское или экономическое значение, относятся к подклассу Actinobacteridae, и принадлежат к порядку Актиномицеты. Хотя многие из них вызывают заболевания у людей, Streptomyces известен как источник антибиотики.

Из тех актинобактерий, которых нет в Actinomycetales, Гарднерелла является одним из самых изученных. Классификация Гарднерелла является спорным, и MeSH каталогизирует его как грамположительные, так и Грамотрицательный организм.[9]

Актинобактерии, особенно Streptomyces spp., признаны продуцентами многих биоактивных метаболитов, полезных для человека в медицине, таких как антибактериальные препараты,[10] противогрибковые,[11] противовирусные препараты, антитромботические средства, иммуномодификаторы, противоопухолевые препараты и ингибиторы ферментов; и в сельском хозяйстве, включая инсектициды, гербициды, фунгициды и вещества, способствующие росту растений и животных.[12][13] Антибиотики, полученные из актинобактерий, которые имеют важное значение в медицине, включают аминогликозиды, антрациклины, хлорамфеникол, макролиды, тетрациклины и т. Д.

Актинобактерии обладают высоким содержание гуанина и цитозина в их ДНК.[14] Содержание G + C в актинобактериях может достигать 70%, хотя некоторые из них могут иметь низкое содержание G + C.[15]

Анализ глютамин синтетаза последовательность была предложена для филогенетического анализа актинобактерий.[16]

Филогения

Филогения основана на высвобождении 123 LTP на основе 16S рРНК Проект "Все виды живого дерева".[17]

Рубробактер Сузуки и другие. 1989

Thermoleophilidae

Gaiella occulta Альбукерке и другие. 2012

Термолеофилум Зарилла и Перри 1986

Solirubrobacterales

Кориобактерии

Acidimicrobiales

Nitriliruptoridae

Euzebya tangerina Курахаши и другие. 2010

Нитрилируптор алкалифилус Сорокин и другие. 2009

Актинобактерии

Acidothermus Cellulolyticus Мохагеги и другие. 1986

Catenulisporineae

Motilibacter peucedani Ли 2012

Streptomyces Ваксман и Хенрици 1943 исправить. Витт и Стакебрандт 1991 [вкл. Китасатоспора & Streptacidiphilus]

Geodermatophilaceae

Франкинеи

Накамурелловые

Кинеококк Ёкота и другие. 1993

Кинеоспориозные

Angustibacter luteus Тамура и другие. 2010

Micrococcineae [вкл. Актиномицетовые & Бифидобактерии]

Propionibacterineae

Nocardioidaceae 2

Thermobispora bispora (Henssen 1957) Wang et al. 1996 г.

Streptosporangineae

Арабобактерии

Pseudonocardiaceae [вкл. Актинополиспора]

Коринебактерии

Jiangellaceae

Micromonosporaceae

Актинокатениспора Thawai и другие. 2006 исправление. Со и Ли 2009

Phytomonospora endophytica Ли и др. 2011 г.

Гликомицетовые

Таксономия

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)[18] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI).[19]

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Сервин Дж. А., Гербольд К. В., Скопхаммер Р. Г., Озеро Дж. А (январь 2008 г.). «Свидетельства, исключающие корень древа жизни из актинобактерий». Мол. Биол. Evol. 25 (1): 1–4. Дои:10.1093 / молбев / мсм249. PMID 18003601.
  2. ^ Гай Р., Родригес-Валера Ф., МакМахон К.Д. и др. (2011). Лопес-Гарсия П. (ред.). «Метагеномика водной толщи в нетронутом верхнем течении реки Амазонки». PLOS ONE. 6 (8): e23785. Bibcode:2011PLoSO ... 623785G. Дои:10.1371 / journal.pone.0023785. ЧВК 3158796. PMID 21915244.
  3. ^ К. Майкл Хоган .. 2010. Бактерии. Энциклопедия Земли. ред. Сидни Драгган и Си Джей Кливленд, Национальный совет по науке и окружающей среде, Вашингтон, округ Колумбия В архиве 2011-05-11 на Wayback Machine
  4. ^ Ningthoujam, Debananda S .; Санасам, Сучитра; Tamreihao, K; Нимайчанд, Салам (ноябрь 2009 г.). «Антагонистическая активность местных изолятов актиномицетов против грибковых патогенов риса». Африканский журнал микробиологических исследований. 3 (11): 737–742.
  5. ^ Гай Р., Мизуно С.М., Пиказо А., Камачо А., Родригес-Валера Ф (2013). «Метагеномика открывает новую группу актинобактерий с низким содержанием GC и ультрамалых морских актинобактерий». Научные отчеты. 3: 2471. Bibcode:2013НатСР ... 3Э2471Г. Дои:10.1038 / srep02471. ЧВК 3747508. PMID 23959135.
  6. ^ Сассман: самые старые растения, Хранитель, 2 мая 2010 г.
  7. ^ «Быть ​​умным - это нормально • старейшее живое существо в мире: эти». Архивировано из оригинал на 2018-07-13. Получено 2018-07-13.
  8. ^ Johnson, S. S .; Hebsgaard, M. B .; Christensen, T. R .; Мастепанов, М .; Nielsen, R .; Munch, K .; Бренд, Т .; Gilbert, M. T. P .; Zuber, M. T .; Bunce, M .; Ronn, R .; Гиличинский, Д .; Froese, D .; Виллерслев, Э. (2007). «Древние бактерии демонстрируют доказательства восстановления ДНК». Труды Национальной академии наук. 104 (36): 14401–14405. Bibcode:2007PNAS..10414401J. Дои:10.1073 / pnas.0706787104. ЧВК 1958816. PMID 17728401.
  9. ^ Гарднерелла в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
  10. ^ Махаджан, Великобритания (2012). «Антибактериальные средства от актиномицетов - обзор». Границы биологических наук. 4: 240–53. Дои:10.2741 / e373.
  11. ^ Gupte, M .; Kulkarni, P .; Гангули, Б. (2002). «Противогрибковые антибиотики». Appl. Microbiol. Биотехнология. 58 (1): 46–57. Дои:10.1007 / s002530100822. PMID 11831475. S2CID 8015426.
  12. ^ Брессан, W (2003). «Биологический контроль патогенных грибов семян кукурузы с помощью актиномицетов». Биоконтроль. 48 (2): 233–240. Дои:10.1023 / а: 1022673226324. S2CID 29320215.
  13. ^ Атта, М.А. (2009). «Биосинтез антибиотика антимицина-А, продуцируемый Streptomyces Sp. AZ-AR-262: систематика, ферментация, очистка и биологическая активность». Austral. J. Basic и Appl. Наука. 3: 126–135.
  14. ^ Ventura, M .; Canchaya, C .; Tauch, A .; Chandra, G .; Фитцджеральд, Г. Ф .; Chater, K. F .; ван Зиндерен, Д. (5 сентября 2007 г.). «Геномика актинобактерий: прослеживание эволюционной истории древнего типа». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 71 (3): 495–548. Дои:10.1128 / MMBR.00005-07. HDL:11381/1721088. ЧВК 2168647. PMID 17804669.
  15. ^ Гай Р., МакМахон К.Д., Родригес-Валера Ф (2012). «Нарушение парадигмы: космополитичные и многочисленные пресноводные актинобактерии имеют низкий GC». Отчеты по экологической микробиологии. 4 (1): 29–35. Дои:10.1111 / j.1758-2229.2011.00274.x. PMID 23757226.
  16. ^ Hayward D, van Helden PD, Wiid IJ (2009). «Эволюция последовательности глутаминсинтетазы в микобактериях и их использование в качестве молекулярных маркеров для видообразования актинобактерий». BMC Evol. Биол. 9: 48. Дои:10.1186/1471-2148-9-48. ЧВК 2667176. PMID 19245690.
  17. ^ Проект "Все виды живого дерева".«Релиз 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2016-03-20.
  18. ^ J.P. Euzéby. «Актинобактерии». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2016-03-20.
  19. ^ Сэйерс; и другие. «Актинобактерии». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2016-03-20.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка