WikiDer > Факторы инициации архей

Archaeal initiation factors

Факторы инициации архей находятся белки которые используются во время перевод шаг синтез белка в археи. Основные функции, которые выполняют эти белки, включают: рибосомная РНК/мРНК признание, доставка инициатора Мет-тРНКяВстретились, тРНКи, связанная с метионином, до 40 рибосома, и вычитка комплекс инициации.[1]

Сохранение факторов инициации архей

Из трех сфер жизни археи, эукариоты, и бактерииколичество TIF архей находится где-то между эукариотами и бактериями; эукариоты имеют наибольшее количество TIF, а бактерии, упростив процесс, имеют только три TIF.[1] Мало того, что количество TIF в архее находится между количеством бактерий и эукариот, но и факторы инициации архей, как видно, имеют как свойства эукариотических, так и прокариотических факторов инициации.[2] Два основных TIF, IF1 / IF1A и IF2 / IF5B, консервативны во всех трех сферах жизни.[1] Существует также полууниверсальный TIF, обнаруженный у всех архей и эукариот, который называется SUI1, но только у некоторых видов бактерий (YciH). У архей и эукариот эти TIF ​​помогают исправить идентификацию инициирующего кодона, в то время как его функция у бактерий неизвестна.[1] Между эукариотами и археями a / eIF2 (тример) и aIF6 в архее консервативны у эукариот как TIFs eIF2 (тример) и eIF6.[1]

Список факторов инициирования

  • aIF1: SUI1 (eIF1) гомолог.[3]
  • aIF1A: IF1/eIF1A гомолог.[3] Играет роль в занятии сайта А рибосомы, помогая однозначному размещению тРНКи в сайте Р большой субъединицы рибосомы.[1]
  • aIF2: тримерный, eIF2 гомолог.[3] Связывается с небольшой субъединицей 40S рибосома чтобы помочь начать перевод мРНК в белки.[4] Можно заменить на eIF2.[2]
  • aIF5A: EF-P/eIF5A гомолог. Содержит гипузин, как и эукариотический.[5] Фактически фактор удлинения.[6]
  • aIF5B: IF2/eIF5B гомолог.[3] Присоединяйтесь к рибосомным субъединицам (малым и большим), чтобы сформировать полную одиночную (мономерную) мРНК связанную рибосомную единицу на поздних стадиях инициации.[1]
  • aIF6: eIF6 гомолог. Разделяет две рибосомные субъединицы.[3]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм Эрнандес, Греко; Джагус, Розмари (2016-08-10). «Эволюция трансляционной инициации: от архей до эукарии». Эволюция механизма синтеза белка и его регуляция. Эрнандес, Греко, Ягус, Розмарин. Швейцария. Дои:10.1007/978-3-319-39468-8_4. ISBN 9783319394688. OCLC 956539514.
  2. ^ а б Дмитриев, Сергей Е .; Столбоушкина Елена А .; Теренин, Илья М .; Андреев, Дмитрий Е .; Гарбер, Мария Б .; Шацкий, Иван Н. (2011). «Фактор инициации трансляции архей aIF2 может заменять эукариотический eIF2 при сканировании рибосом во время образования 48S комплекса млекопитающих». Журнал молекулярной биологии. 413 (1): 106–114. Дои:10.1016 / j.jmb.2011.08.026. PMID 21884705.
  3. ^ а б c d е Benelli, D; Лондей, П. (январь 2011 г.). «Инициирование трансляции в архее: консервативные и доменные особенности». Сделки биохимического общества. 39 (1): 89–93. Дои:10.1042 / BST0390089. PMID 21265752.
  4. ^ Гогои, Прерана; Канауджиа, Шанкар Прасад (2018). «Архейский и эукариальный фактор инициации трансляции 1 различаются петлями, взаимодействующими с их РНК». Письма FEBS. 592 (9): 1602–1610. Дои:10.1002/1873-3468.13044. PMID 29608219. S2CID 4559350.
  5. ^ Dever, TE; Gutierrez, E; Шин, Б.С. (2014). «Гипузинсодержащий фактор трансляции eIF5A». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии. 49 (5): 413–25. Дои:10.3109/10409238.2014.939608. ЧВК 4183722. PMID 25029904.
  6. ^ Росси, Д; Kuroshu, R; Zanelli, CF; Валентини, SR (2013). «eIF5A и EF-P: два уникальных фактора трансляции теперь движутся одним и тем же путем». Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК. 5 (2): 209–22. Дои:10.1002 / wrna.1211. PMID 24402910.