WikiDer > БПТФ

BPTF
БПТФ
Белок BPTF PDB 2f6j.png
Доступные конструкции
PDBПоиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыБПТФ, FAC1, FALZ, NURF301, фактор транскрипции пальца бромодомена PHD, NEDDFL
Внешние идентификаторыOMIM: 601819 MGI: 2444008 ГомолоГен: 114397 Генные карты: БПТФ
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение BPTF
Геномное расположение BPTF
Группа17q24.2Начните67,825,503 бп[1]
Конец67,984,378 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE BPTF 209271 в формате fs.png

PBB GE BPTF 207186 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004459
NM_182641

NM_001080832
NM_176850
NM_001359590

RefSeq (белок)

NP_004450
NP_872579

н / д

Расположение (UCSC)Chr 17: 67,83 - 67,98 МбChr 11: 107.03 - 107.13 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица фактора ремоделирования нуклеосом BPTF это белок что у людей кодируется БПТФ ген.[5][6][7][8]

Этот ген был идентифицирован по реактивности кодируемого им белка к моноклональному антителу, полученному против гомогенатов мозга пациентов с болезнью Альцгеймера. Анализ исходного белка (фетальный реактивный клон 1 Alz-50 или FAC1), идентифицированный как белок из 810 аминокислотных остатков, содержащий ДНК-связывающий домен и мотив цинкового пальца, предположил, что он может играть роль в регуляции транскрипции. Высокие уровни FAC1 были обнаружены в мозге плода и у пациентов с нейродегенеративными заболеваниями. Белок, кодируемый этим геном, на самом деле намного больше, чем первоначально предполагалось, и он также содержит С-концевой бромодомен, характерный для белков, которые регулируют транскрипцию во время пролиферации. Кодируемый белок очень похож на самую большую субъединицу комплекса Drosophila NURF (фактор ремоделирования нуклеосом). У Drosophila комплекс NURF, который катализирует скольжение нуклеосом по ДНК и взаимодействует со специфическими для последовательности факторами транскрипции, необходим для ремоделирования хроматина, необходимого для транскрипции. Полностью описаны два альтернативных транскрипта, кодирующие разные изоформы.[8]

Взаимодействия

BPTF был показан взаимодействовать с участием МАЗ.[9]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171634 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040481 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Баузер Р. (март 1997 г.). «Присвоение человеческого гена FAC1 хромосоме 17q24 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 38 (3): 455–7. Дои:10.1006 / geno.1996.0657. PMID 8975731.
  6. ^ Джонс М. Х., Хамана Н., Симанэ М. (апрель 2000 г.). «Идентификация и характеристика BPTF, нового фактора транскрипции бромодомена». Геномика. 63 (1): 35–9. Дои:10.1006 / geno.1999.6070. PMID 10662542.
  7. ^ Wysocka J, Swigut T, Xiao H, Milne TA, Kwon SY, Landry J, Kauer M, Tackett AJ, Chait BT, Badenhorst P, Wu C, Allis CD (июль 2006 г.). "Палец PHD NURF связывает триметилирование лизина 4 гистона H3 с ремоделированием хроматина". Природа. 442 (7098): 86–90. Bibcode:2006 Натур 442 ... 86 Вт. Дои:10.1038 / природа04815. PMID 16728976. S2CID 4389087.
  8. ^ а б «Ген Entrez: фактор транскрипции пальца PHD бромодомена BPTF».
  9. ^ Jordan-Sciutto, K L; Драгич Дж.М. Caltagarone J; Зал D J; Баузер Р. (март 2000 г.). «Фетальный белок клона 1 Alz-50 (FAC1) взаимодействует с Myc-ассоциированным белком цинкового пальца (ZF87 / MAZ) и изменяет его транскрипционную активность». Биохимия. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 39 (12): 3206–15. Дои:10.1021 / bi992211q. ISSN 0006-2960. ЧВК 3667205. PMID 10727212.

внешние ссылки

дальнейшее чтение