WikiDer > Циклический нуклеотид-связывающий домен
| Циклический нуклеотид-связывающий домен | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура комплекса CAP-ДНК.[1] | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | cNMP_binding | ||||||||||
| Pfam | PF00027 | ||||||||||
| ИнтерПро | IPR000595 | ||||||||||
| УМНАЯ | SM00100 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00691 | ||||||||||
| SCOP2 | 1cgp / Объем / СУПФАМ | ||||||||||
| CDD | cd00038 | ||||||||||
| |||||||||||
Белки, связывающие циклические нуклеотиды (лагерь или же cGMP) имеют структурный домен примерно из 120 остатков. Наиболее изученным из этих белков является активатор гена прокариотического катаболита (также известный как белок рецептора цАМФ) (ген crp), где известно, что такой домен состоит из трех альфа-спиралей и отличительной восьмицепочечной антипараллельной бета-цилиндрической структуры. В этом домене шесть инвариантных аминокислот, три из которых представляют собой остатки глицина, которые считаются важными для поддержания структурной целостности бета-ствола. cAMP- и cGMP-зависимые протеинкиназы (cAPK и cGPK) содержат две тандемные копии циклического нуклеотид-связывающего домена. CAPK состоят из двух разных субъединиц, каталитической цепи и регуляторной цепи, которая содержит обе копии домена. CGPK - это одноцепочечные ферменты, которые включают две копии домена в их N-концевую часть. Циклические нуклеотид-управляемые ионные каналы позвоночных также содержат этот домен. Два таких катионных канала были полностью охарактеризованы, один обнаружен в стержневых клетках, где он играет роль в передаче визуального сигнала.
Белки человека, содержащие этот домен
CNBD1; CNGA1; CNGA2; CNGA3; CNGB1; CNGB3; HCN1;HCN2; HCN3; HCN4; KCNH1; KCNH2; KCNH3; KCNH4; KCNH5;KCNH6; KCNH7; KCNH8; PNPLA6; PNPLA7; PRKAR1A; PRKAR1B; PRKAR2A;PRKAR2B; PRKG1; PRKG2; RAPGEF2; RAPGEF3; RAPGEF4; RAPGEF6; RCNC2;SLC9A10; SLC9A11;
Рекомендации
- ^ Schultz SC, Shields GC, Steitz TA (август 1991 г.). «Кристаллическая структура комплекса CAP-ДНК: ДНК изогнута на 90 градусов». Наука. 253 (5023): 1001–7. Bibcode:1991Научный ... 253.1001С. Дои:10.1126 / science.1653449. PMID 1653449. S2CID 19723922.
дальнейшее чтение
- Яу, К. В. (1994). «Циклические нуклеотид-управляемые каналы: расширяющееся новое семейство ионных каналов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (9): 3481–3483. Bibcode:1994PNAS ... 91.3481Y. Дои:10.1073 / пнас.91.9.3481. ЧВК 43603. PMID 7513422.