WikiDer > GAPVD1

GAPVD1
GAPVD1
Идентификаторы
ПсевдонимыGAPVD1, GAPEX5, GAPex-5, RAP6, белок, активирующий GTPase, и домены VPS9 1
Внешние идентификаторыOMIM: 611714 MGI: 1913941 ГомолоГен: 32637 Генные карты: GAPVD1
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение GAPVD1
Геномное расположение GAPVD1
Группа9q33.3Начинать125,261,794 бп[1]
Конец125,367,207 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GAPVD1 212804 s в формате fs.png

PBB GE GAPVD1 214869 x at fs.png

PBB GE GAPVD1 212802 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_025709
NM_001356441

RefSeq (белок)

NP_079985
NP_001343370

Расположение (UCSC)Chr 9: 125,26 - 125,37 МбChr 2: 34,67 - 34,76 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, активирующий ГТФазу, и домены VPS9 1, также известный как GAPVD1, Гапекс-5 и RME-6 это белок который у человека кодируется GAPVD1 ген.[5][6]

Функция

GAPVD1 - это Раб GTPase фактор обмена гуаниновых нуклеотидов необходимо для активации RAB5A во время поглощения апоптотический клетки.[7] GAPVD1 также участвует в деградации рецептор эпидермального фактора роста.[8]Активация Rab5, опосредованная Gapex-5, участвует в стимулированном инсулином образовании плазматической мембраны. фосфатидилинозитол-3-фосфат.[9]

Структура

На основе гомологии последовательностей было показано, что Gapex-5 млекопитающих имеет аминоконцевой Ras ЗАЗОР домен, центральный полипролин (SH3 связывающей) области и карбоксиконцевого Rab ГЭФ домен. Домен RabGEF предложили активировать Rab5[10] и Rab31.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165219 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026867 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: белок, активирующий GTPase GAPVD1 и домены 1 VPS9».
  6. ^ Хункер С.М., Гальвис А., Крук И., Джамбини Х., Вейсага М.Л., Барбьери М.А. (февраль 2006 г.). «Rab5-активирующий белок 6, новый эндосомальный белок, играющий роль в эндоцитозе». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 340 (3): 967–75. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.12.099. PMID 16410077.
  7. ^ Китано М., Накая М., Накамура Т., Нагата С., Мацуда М. (май 2008 г.). «Визуализация активности Rab5 выявляет важные регуляторы созревания фагосом». Природа. 453 (7192): 241–5. Дои:10.1038 / природа06857. PMID 18385674.
  8. ^ Су X, Kong C, Stahl PD (июль 2007 г.). «GAPex-5 опосредует убиквитинирование, перенос и деградацию рецептора эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 282 (29): 21278–84. Дои:10.1074 / jbc.M703725200. PMID 17545148.
  9. ^ Лодхи И.Дж., Бриджес Д., Чанг С.Х., Чжан Ю., Ченг А., Гелетка Л.М., Вайсман Л.С., Салтиель А.Р. (июль 2008 г.). «Инсулин стимулирует производство фосфатидилинозитол-3-фосфата за счет активации Rab5». Мол. Биол. Клетка. 19 (7): 2718–28. Дои:10.1091 / mbc.E08-01-0105. ЧВК 2441665. PMID 18434594.
  10. ^ Су X, Лоди И.Дж., Салтиель А.Р., Шталь ДП (сентябрь 2006 г.). «Стимулируемое инсулином взаимодействие между субстратом 1 рецептора инсулина и p85alpha и активация протеинкиназы B / Akt требует Rab5». J. Biol. Chem. 281 (38): 27982–90. Дои:10.1074 / jbc.M602873200. PMID 16880210.
  11. ^ Лодхи И.Дж., Чанг С.Х., Чанг Л., Волленвейдер Д., Уотсон Р.Т., Иноуэ М., Пессин Дж.Э., Салтиель А.Р. (январь 2007 г.). "Gapex-5, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rab31, который регулирует перемещение Glut4 в адипоцитах". Cell Metab. 5 (1): 59–72. Дои:10.1016 / j.cmet.2006.12.006. ЧВК 1779820. PMID 17189207.

дальнейшее чтение