WikiDer > Джон Маккаскилл

John McCaskill

Джон Маккаскилл

Джон С. Маккаскилл (1957 г.р.) - австралийский химик, работающий в самых разных областях, от теоретической биохимии до новых вычислений и искусственной жизни.

биография

После окончания Сиднейский университет в 1978 г. (Р. Г. Гилберт советник) и получив докторскую степень (D. Phil.) в 1982 году в качестве стипендиата Родса в Нью-колледже, Оксфорд, Маккаскилл присоединился к группе лауреатов Нобелевской премии. Манфред Эйген на Институт Макса Планка по биофизической химии в Геттингене, Германия. Он стал профессором теоретической биохимии в Йенский университет имени Фридриха Шиллера в 1992 году, основав междисциплинарную исследовательскую группу по обработке биомолекулярной информации (BioMIP) в Институте молекулярной биотехнологии (imb Jena), области, в которой он был пионером в течение 25 лет, занимая должности в GMD (Национальный исследовательский центр информационных технологий), Общество Фраунгофера, Рурский университет Бохума, то Институт Санта-Фе, а Европейский центр живых технологий на Венецианский университет Ка 'Фоскари.[1]

Исследование

Маккаскилл наиболее известен своей работой над обработка информации в развивающийся и самоорганизующийся молекулярный системы, охватывающие теоретические и экспериментальные подходы, которые включают новые устройства и системы. Его ранняя работа над молекулярная эволюция был теоретическим, используя неравновесный статистическая механика решить уравнения Эйгена молекулярные квазивиды для реалистичного фитнес-пейзажи[2].[3] Он разработал ансамблевый подход к Предсказание структуры РНК, сейчас широко используется,[4] и внес несколько вкладов, как теоретических, так и экспериментальных, в изучение пространственно-разрешенных молекулярная эволюция, включая экспериментальную реализацию пространственно разрешенный капилляр и микрофлюидный поток реакторы [5][6]а также в том числе строительство NGEN и MEREGEN, масштабные реконфигурируемые систолические компьютеры для моделирования пространственной эволюции на основе перепрограммируемых FPGA аппаратное обеспечение[7]

С 2000 года он создал химический микропроцессор технология для электронных программируемая материя через микрохимия, и применил его к разработке новых подходов к искусственные клетки и системы обработки ДНК / РНК, включая in vitro Системы обработки ДНК / РНК, включая Qß РНК, 3SR, ПДД, 3SR-Хищник-Добыча,[8] ЛОВИТЬ [9] и оптические системы ДНК-вычислений на основе магнитных шариков в микрофлюидных реакторах[10]Маккаскилл возглавил международную инициативу по исследованию эволюционирующих искусственных химических ячеек в рамках проекта, финансируемого ЕС. ШАГ, один из первых проектов по изучению восходящего подхода к созданию искусственной живой клетки.[11][12][13].[14] Совсем недавно его исследования привели к разработке новых автономных и программируемых электронно-химических систем, что привело к другим проектам, финансируемым ЕС. ECCell и МИКРЕАГЕНТЫ, а также открытие широкого круга потенциальных приложений в фундаментальных и прикладных исследованиях.

Текущая работа Маккаскилла включает моделирование существенного взаимодействия самоорганизация и эволюция в естественных химических системах и изучении потенциала электронно-химического гибридного Информационные технологии на основе этих свойств. Он подготовил более 100 научных публикаций, читал курсы и защищал кандидатские диссертации по различным дисциплинам, от химии, физики и биологии до информатики, а его многопрофильная работа, охватывающая теорию и эксперимент, была отмечена на приглашенных лекциях на международных конференциях по всему миру. Он был первым директором Европейский центр живых технологий, и с тех пор входит в его научный совет. Хотя основная работа Маккаскилла связана с фундаментальной наукой, она помогла создать несколько начинающих компаний и продолжает включать координацию крупных совместных проектов, способствующих установлению новых связей между наукой и промышленностью.

Рекомендации

  1. ^ Джон, Маккаскилл. "Резюме Маккаскилла" (PDF). biomip.org. Получено 7 августа 2019.
  2. ^ Маккаскилл, Дж. С. (1984). «Порог локализации для макромолекулярных квазивидов из непрерывно распределенных скоростей репликации». Журнал химической физики. 80 (10): 5194–5202. Дои:10.1063/1.446590.
  3. ^ Эйген, Манфред, Маккаскилл, Джон и Шустер, Питер. «Молекулярные квази-виды». Adv. Chem. Phys 75 (1989): 149-263, 1988. DOI: 10.1002 / 9780470141243.ch4
  4. ^ Маккаскилл, Джон (1990). «Равновесная статистическая сумма и вероятности связывания пар оснований для вторичной структуры РНК». Биополимеры. 29 (6–7): 1105–1119. Дои:10.1002 / bip.360290621. HDL:11858 / 00-001M-0000-0013-0DE3-9.
  5. ^ McCaskill, J.S .; Бауэр, Г.Дж. (1993). «Образы эволюции: происхождение волн спонтанной репликации РНК». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 90 (9): 4191–4195. Дои:10.1073 / пнас.90.9.4191. ЧВК 46472. PMID 7683426.
  6. ^ Маккаскилл, Джон (1997). «Пространственно разрешенная молекулярная экология in vitro». Биофизическая химия. 66 (2–3): 145–158. Дои:10.1016 / s0301-4622 (97) 00073-2. PMID 9362557.
  7. ^ Танген, У., Маеке, Ти и Маккаскилл, Дж. «Продвинутое моделирование в конфигурируемом массивно-параллельном оборудовании MereGen». Сочетание биологических и электронных систем. Springer, Berlin, Heidelberg, 2002. 107–118.
  8. ^ Влоцка, Бритта; Маккаскилл, Джон (1996). «Молекулярный хищник и его жертва: сопряженная изотермическая амплификация нуклеиновых кислот» (PDF). Химия и биология. 4 (25–33): 25–33. Дои:10.1016 / с1074-5521 (97) 90234-9. Получено 13 августа 2019.
  9. ^ Эллингер, Томас; Эрихт, Ральф; Маккаскилл, Джон (1998). «Развитие молекулярного взаимодействия in vitro в CATCH, кооперативно связанной системе амплификации». Клеточная химическая биология. 5 (12): 729–241. Дои:10.1016 / с1074-5521 (98) 90665-2. Получено 13 августа 2019.
  10. ^ Маккаскилл, Джон (2001). «Оптическое программирование ДНК-вычислений в микропотоковых реакторах». Биосистемы. 59 (2): 125–138. Дои:10.1016 / s0303-2647 (01) 00099-5. PMID 11267740.
  11. ^ «Святой Грааль искусственной жизни». The Irish Times. 2 сентября 2004 г.
  12. ^ «Бог-Машина. Неужели жизнь должна быть создана заново? (Die Gottes-Maschine. Ist das Leben ganz neu zu erfinden?)». GEO. Август 2009 г.
  13. ^ Лютке-Виссинг, Стефан. "Die geheimen Baupläne der Natur". TIB Leibniz-Informationszentrum. Получено 13 августа 2019.
  14. ^ Реджис, Эд (2008). Что такое жизнь?. Нью-Йорк: Фаррар, Штраус и Жиру. С. 140–141. ISBN 978-0-374-28851-8.

внешняя ссылка