WikiDer > Linepithema humile virus 1 - Википедия
| Linepithema humile virus 1 | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Учебный класс: | Pisoniviricetes |
| Заказ: | Пикорнавиралес |
| Семья: | Dicistroviridae |
| Род: | incertae sedis |
| Вирус: | Linepithema humile virus 1 |
Linepithema humile virus-1 (LHUV-1) - новый вирус, который, как было обнаружено, активно реплицируется в инвазивных Аргентинский муравей (Линепитема униженная) разновидность. Аргентинский муравей чрезвычайно агрессивен по всему миру, вторгаясь со своей мегаколонией на все континенты, кроме Антарктиды. Инвазивность муравьев способствует распространению этого вируса среди других уязвимых популяций медоносных пчел, которые могут быть ответственны за общий коллапс колонии.[1]
Распространенность и распространение вирусов
Было обнаружено, что вирус-1 Linepithema humile (LHUV-1) был занесен аргентинскими муравьями в Новую Зеландию и Австралию. Помимо муравьев, вирус также был зарегистрирован у других видов во всем мире, таких как пчелы. Аргентинские муравьи являются хозяевами и служат резервуаром Вирус деформированного крыла (DWV), который является причиной гибели пчел. Корреляция и прямое взаимодействие между пчелами и аргентинскими муравьями происходит во время вторжения и набегов на ульи. Последовательности DWV, выделенные из Новой Зеландии, оказались сходными со штаммами из местных популяций пчел и ос. Это говорит о том, что муравьи, осы и пчелы разделяют эти штаммы патогенов.[1]
Было обнаружено, что когда происходит нашествие экзотических видов, таких как аргентинский муравей, они становятся массовыми, они, как правило, оказывают значительное влияние благодаря своей способности становиться резервуарами и хозяевами для важных патогенов.[1] Муравьи с участков, где муравьи взаимодействовали с пчелами, имели самую высокую вирусную нагрузку. Там, где муравьи не взаимодействовали с пчелами, мы обнаружили более низкую распространенность DWV по сравнению с другими вирусами.[2]
Исследователи обнаружили, что вирус-1 Linepithema humile (LHUV-1) был обнаружен на участках выборки из последовательности n1000 contig в Аргентине, Австралии и менее чем в половине проверенных участков в Новой Зеландии. Дополнительные образцы муравьев были использованы из Новой Зеландии для изучения вирусов, ранее обнаруженных у пчел, муравьев и других насекомых, и определения корреляции между группами вирусов. Вирусы IAPV, KBV, ABVP, DWV, SINV-1 и SINV-2, причем только последовательности DWV обнаруживаются у медоносных пчел и обыкновенных ос. Кроме того, были обнаружены отрицательные цепи как DWV, так и LHUV-1, что свидетельствует о том, что эти два вируса активно реплицируются у аргентинских муравьев.[1]
Присутствие DWV и LHUV-1 было обнаружено и подтверждено с помощью молекулярных методов, включая ОТ-ПЦР и секвенирование по Сэнгеру.[1] Данные, полученные с помощью секвенирования по Сэнгеру, были идентичны данным для контига метагенома РНК, n6409, который взят из LHUV-1.[1] Одна новозеландская королева аргентинских муравьев оказалась положительной на LHUV-1 с вирусной репликацией, но без DWV. LHUV-1 и DWV реплицируются у аргентинских муравьев. Сообщалось, что вирусы LHUV-1 и DWV, скорее всего, несут ответственность за паразитирование муравьев, а не за переносимые частицы. Было показано, что преобладание этих двух вирусов способствует сокращению популяций аргентинских муравьев и может стать отправной точкой для будущих разработок биоконтроля.[1]
Геномика
Чтобы решить проблему распространенности LHUV-1, L. humile геном был секвенирован. Геномная сборка отсутствовала cox7a который был утерян из генома. В генах, специфичных для L. humile, Были обогащены 99 терминов, включая обонятельные рецепторы, пептидазы, участвующие в производстве яда, гены, связанные с липидной активностью, участвующие в синтез кутикулярных углеводородов (CHC) или катаболизм, и гены метилирования ДНК.[3]
Было обнаружено, что вирус LHUV-1 содержит в своем геноме фрагменты других вирусных семейств.[3] Примечательно, что вирус поддерживает единственную копию Dnmt гены, которые способны подвергаться Метилирование ДНК с помощью инструментария.[3] В дополнение к этому, случаи независимого излучения существуют в различных линиях генома LHUV-1. Сообщалось, что предковые гены имели тенденцию к размножению, что приводило к активации таких генов, как основные белковые гены маточного молочка (MRJPLS), чтобы развиваться и адаптироваться к новым давлениям отбора.[3]
Исследователи обнаружили, что SNP перехода динуклеотидов в отношении метилирования ДНК были в 10 раз более распространены в L. humile. Более того, был сделан вывод, что данные SNP сопоставимы с другими трансверсии. Чтобы исследовать активную репликацию DWV и LHUV-1, модифицированный ОТ-ПЦР был использован для обнаружения РНК-отрицательных цепей обоих вирусов (DWV и LHUV-1).[1] Наличие последовательности contig n6409 было подтверждено секвенированием по Сэнгеру. Это позволило с помощью филогенетического анализа расположить контиг с другими дицистровирусами.
Рекомендации
- ^ а б c d е ж грамм час Себастьен А., Лестер П.Дж., Холл Р.Дж., Ван Дж., Мур Н.Э., Грубер М.А. (сентябрь 2015 г.). «Инвазивные муравьи несут новые вирусы в своем новом диапазоне и образуют резервуары для патогена медоносной пчелы». Письма о биологии. 11 (9): 20150610. Дои:10.1098 / rsbl.2015.0610. ЧВК 4614435. PMID 26562935.
- ^ Грубер М.А., Охлаждение М., Бати Дж. В., Бакли К., Фридлендер А., Куинн О., Рассел Дж. Ф., Себастьен А., Лестер П. Дж. (Июнь 2017 г.). «Одноцепочечные РНК-вирусы, поражающие инвазивного аргентинского муравья Linepithema humile». Научные отчеты. 7 (1): 3304. Bibcode:2017НатСР ... 7.3304G. Дои:10.1038 / s41598-017-03508-z. ЧВК 5468335. PMID 28607437.
- ^ а б c d Смит С.Д., Зимин А., Холт С., Абухейф Е., Бентон Р., Кэш Е. и др. (Апрель 2011 г.). «Проект генома всемирно распространенного и инвазионного аргентинского муравья (Linepithema humile)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (14): 5673–8. Bibcode:2011ПНАС..108.5673С. Дои:10.1073 / pnas.1008617108. ЧВК 3078359. PMID 21282631.