| Год | Номинальная работа | Категория | Результат | Ref. |
|---|
| 1993 | Московский международный кинофестиваль | Золотой Георгий Победоносец | Cronos | Назначен |
| Кинофестиваль в Гаване | Лучшая первая работа | Выиграл |
| Кинофестиваль в Ситжесе | Лучший фильм | Назначен |
| Лучший сценарий | Выиграл |
| 1994 | Брюссельский международный фестиваль фантастических фильмов | Серебряный ворон | Выиграл |
| 1995 | Премия Ассоциации латинских критиков развлечений | Лучшая первая работа | Выиграл |
| 1997 | Кинофестиваль в Ситжесе | Лучший фильм | Мимика | Назначен |
| 1998 | Премия ALMA | Выдающийся латиноамериканский режиссер художественного фильма | Назначен |
| 2002 | Кинофестиваль в Ситжесе | Почетная награда "Машина времени" | Выиграл |
| 2004 | Премия Imagen | Премия за творческие достижения | Выиграл |
| Лучший режиссер - фильм | Хеллбой | Выиграл |
| 2005 | Премия Брэма Стокера | Лучший сценарий | Назначен |
| 2006 | Награды Ассоциации кинокритиков Остина | Лучший зарубежный фильм | Лабиринт Пана | Выиграл |
| Премия Дублинского кружка кинокритиков | Лучший режиссер | Назначен |
| 2007 | Премия Империи | Лучший режиссер | Назначен |
| Награды Ассоциации кинокритиков Остина | Лучший фильм | Назначен |
| Лучший оригинальный сценарий | Выиграл |
| Fantasporto | Лучший международный фэнтези-фильм | Выиграл |
| Приз кинокритиков Австралии | Лучший фильм на иностранном языке | Назначен |
| Премия Лондонского круга критиков | Директор года | Назначен |
| Сценарист года | Назначен |
| Премия Национального общества кинокритиков | Лучший режиссер | Назначен |
| Премия Общества кинокритиков онлайн | Лучший режиссер | Назначен |
| Лучший оригинальный сценарий | Выиграл |
| Международный кинофестиваль в Палм-Спрингс | Лучший фильм на иностранном языке | Выиграл |
| Премия Ассоциации латинских критиков развлечений | Лучший фильм | Выиграл |
| Премия Imagen | Лучший режиссер - фильм | Выиграл |
| 2008 | Премия Бодила | Премия Бодила за лучший неамериканский фильм | Выиграл |
| Премия туманности | Лучший сценарий | Выиграл |
| Премия Империи | Награда за вдохновение | Назначен |
| 2013 | Голливудский кинофестиваль | Голливудская кинопремия | Тихоокеанский рубеж | Назначен |
| 2014 | Премия Рэя Брэдбери | Выдающаяся драматическая презентация | Назначен |
| 2017 | Премия Ассоциации кинокритиков Лос-Анджелеса | Лучший режиссер | Форма воды | Выиграл |
| Премия Детройтского общества кинокритиков | Лучший режиссер | Назначен |
| Лучший сценарий | Назначен |
| Премия Бостонского общества кинокритиков | Лучший режиссер | Второе место |
| Премия ассоциации кинокритиков Вашингтона, округ Колумбия | Лучший режиссер | Назначен |
| Лучший оригинальный сценарий | Назначен |
| Премия круга кинокритиков Сан-Франциско | Лучший режиссер | Выиграл |
| Лучший оригинальный сценарий | Назначен |
| Премия Общества кинокритиков Сан-Диего | Лучший режиссер | Назначен |
| Премия Чикагской ассоциации кинокритиков | Лучший режиссер | Назначен |
| Лучший оригинальный сценарий | Назначен |
| Ассоциация кинокритиков Далласа – Форт-Уэрта | Лучший режиссер | Выиграл |
| Лучший сценарий | Назначен |
| Премия ассоциации кинокритиков Сент-Луис Гейтвей | Лучший режиссер | Выиграл |
| Лучший сценарий | Выиграл |
| Премия Круга кинокритиков Флориды | Лучший режиссер | Назначен |
| Лучший сценарий | Назначен |
| Премия Общества кинокритиков онлайн | Лучший режиссер | Второе место |
| Лучший оригинальный сценарий | Назначен |
| 2018 | Международная премия AACTA | Лучшее направление | Назначен |
| Премия Общества кинокритиков Хьюстона | Лучший режиссер | Назначен |
| Премия Гильдии продюсеров Америки | Лучший театральный фильм | Выиграл |
| Премия Лондонского кружка кинокритиков | Директор года | Назначен |
| Премия Гильдии режиссеров Америки | Выдающаяся режиссура - Художественный фильм | Выиграл |