WikiDer > Список таксонов со статусом Candidatus - Википедия
List of taxa with candidatus status - Wikipedia
Это список таксоны с кандидат положение дел.
Phyla
- Absconditabacteria (ранее Кандидат типа SR1)[1][2][3][4]
- ПБЯ1[5] иначе OD1-ABY1, подгруппа OD1 (Паркубактерии)[6]
- Кандидат типа AC1[3]
- Ацетотермия (ранее Кандидат типа OP1)[5][2][3][4]
- Аэрофобет (ранее кандидат филум CD12 или же BHI80-139)[2][3]
- Aminicenantes (ранее Кандидат типа OP8)[5][2][3][4]
- водоносный горизонт1[2]
- водоносный горизонт2[2]
- Атрибактерии (ранее Кандидат типа OP9 или же JS1)[2][3][4][1][5]
- Беркельбактерии (ранее кандидат филум ACD58)[3][7]
- BRC1[5][3][4]
- КАБИНА-I[3]
- Calescamantes (ранее кандидат филум EM19)[2][3][4]
- Кандидат типа CPR2[3]
- Кандидат типа CPR3[3]
- Тип кандидата NC10[5][3]
- Кандидат типа OP2[3]
- Кандидат типа RF3[3]
- Кандидат типа SAM[3]
- Кандидат типа СПАМ[3]
- Кандидат типа TG2[3]
- Тип кандидата VC2[3]
- Кандидат типа WS1[3]
- Кандидат типа WS2[3][5]
- Кандидат типа WS4[3]
- Тип кандидата WYO[3]
- CKC4[2]
- Cloacimonetes (ранее кандидат филум WWE1)[2][4]
- CPR1[3]
- Dependentiae (ранее кандидат филум TM6)[2][3][5][8]
- EM 3[3]
- "Прим. Эндомикробия" Стингл и другие. 2005 г.[9]
- Ферментибактерии (Hyd24-12)[3][2][10]
- Фервидибактерии (ранее кандидат филум ОктябрьSpa1-106)[3]
- GAL08[2]
- GAL15[3]
- GN01[3]
- GN03[3]
- GN04[3]
- GN05[3]
- GN06[3]
- GN07[3]
- GN08[3]
- GN09[3]
- GN10[3]
- GN11[3]
- GN12[3]
- GN13[3]
- GN14[3]
- GN15[3]
- GOUTA4[2]
- Грацилибактерии (ранее кандидат филум GN02, BD1-5, или же БД1-5 группа)[5][2][3]
- Гуаймас1[5]
- Hydrogenedentes (ранее кандидат филум NKB19)[5][2][3][4]
- Игнавибактерии (ранее кандидат филум ZB1)[4][11]
- JL-ETNP-Z39[2][3]
- Катанобактерии (ранее кандидат филум WWE3)[1][3]
- Казань-3Б-09[2]
- КД3-62[3]
- kpj58rc[3]
- KSA1[3]
- KSA2[3]
- KSB1[3]
- KSB2[3]
- KSB4[3]
- Латесцибактерии (ранее Кандидат типа WS3)[5][2][3][4]
- LCP-89[2]
- LD1-PA38[2]
- Marinamargulisbacteria (ранее кандидатский дивизион ZB3)[12]
Кандидат филума OP10
- Маринимикробия (ранее Морская группа А[5] или тип кандидата SAR406)[2][3][4]
- Мелайнабактерии
- Микрогеноматы (ранее кандидат филум OP11)[5][2][3][4]
- Модулибактерии (ранее кандидат филум KSB3)[3][13]
- MSBL2[3]
- MSBL3[3]
- MSBL4[3]
- MSBL5[3]
- MSBL6[3]
- Nitrospinae[3][4][14]
- НПЛ-УПА2[3]
- NT-B4[3]
- OC31[2]
- Омнитрофика (ранее кандидат филум OP3)[5][2][3][4]
- OP4[3]
- OP6[3]
- OP7[3]
- ОС-К/Группа ОС-К[5][3]
- Паркубактерии (ранее кандидат филум OD1)[2][3][4]
- PAUC34f[2]
- Перегринибактерии (ранее Тип кандидата PER)[3][15][16][17][18]
- Порибактерии[3][4][19]
- RsaHF231[2]
- S2R-29[2]
- Сахарибактерии (ранее Кандидат филума TM7)[2][3][4][20][5][21][22]
- SBR1093[5][3]
- SBYG-2791[2]
- Кандидат типа SC3[5]
- Кандидат типа SC4[5]
- Осадок-1[3]
- Осадок-2[3]
- Осадок-3[3]
- Осадок-4[3]
- SHA-109[2]
- SM2F11[2]
- TA06[2][3]
- Тектомикробия[23]
- TG3
- WCHB1-60[2]
- WD272[2]
- WOR-1[3]
- WOR-3[3]
- WPS-1[3][4]
- WPS-2[3][4]
- WS5[5][3]
- WS6[5][2][3][24]
- ZB2 иначе OD1-ZB2 подгруппа OD1 (Паркубактерии)[6]
- Зиксибактерии[3]
Классы
- "Прим. Зетапротеобактерии" Эмерсон и другие. 2007 г.[9]
Заказы
- "Прим. Nitrosopumilales" Könneke и другие. 2005 г.[9]
Семьи
- "Прим. Midichloriaceae" Montagna и другие. 2013[9]
- "Прим. Nitrosopumilaceae" Könneke и другие. 2005 г.[9]
- "Прим. Procabacteriaceae"
- "Прим. Рабдохламидийные"
Роды
- "Прим. Аккумулибактер" Hesselmann и другие. 1999 г.[9]
- "Прим. Allobeggiatoa" Хинк и другие. 2011 г.[9]
- "Прим. Артромит" Snel и другие. 1995 г.[9]
- "Прим. Бациллоплазма" Костаньшек и другие. 2007 г.[9]
- "Прим. Baumannia" Моран и другие. 2003 г.[9]
- "Прим. Блохмания" Зауэр и другие. 2000 г.[9]
- "Прим. Carsonella" Тао и другие. 2000 г.[9]
- "Прим. Хлоротрикс" Клаппенбах и Пирсон 2004[9]
- "Прим. Competibacter" Crocetti и другие. 2002 г.[9]
- "Прим. Contubernalis" Жилина и другие. 2005 г.[9]
- "Прим. Desulforudis
- "Прим. Эндомикробий" Стингл и другие. 2005 г.[9]
- "Прим. Эпиксеносома"
- "Прим. Гигантаума"
- "Прим. Гломерибактер" Bianciotto и другие. 2003 г.[9]
- "Прим. Клейдоцерия" Кюхлер и другие. 2010 г.[9]
- "Прим. Kuenenia" Шмид и другие. 2000 г.[9]
- "Прим. Либерибактер"
- "Прим. Локиархей"
- "Прим. Люмбрицинкола" Нечитайло и другие. 2009 г.[9]
- "Прим. Магнитобактерии" Мюррей и Stackebrandt 1995[9]
- "Прим. Метанорегула"
- "Прим. Микротрикс"
- "Прим. Нардонелла" Лефевр и другие. 2004 г.[9]
- "Прим. Нитрозоархей" Блейни и другие. 2011 г.[9]
- "Прим. Нитрозопумилус" Könneke и другие. 2005 г.[9]
- "Прим. Пелагибактер" Рапп и другие. 2002 г.[9]
- "Прим. Фотодесмус" Хендри и Dunlap, 2011[9]
- "Прим. Фитоплазма" Фиррао и другие. 2004 г.[9]
- "Прим. Портьера" Тао и Бауманн 2004[9]
- "Прим. Прокабактер" Рог и другие. 2002 г.[9]
- "Прим. Рабдохламидиоз"
- "Прим. Ригерия" Грубер-Водичка и другие. 2011 г.[9]
- "Прим. Рохрколберия" Кюхлер и другие. 2011 г.[9]
- "Прим. Салинибактер" Антон и другие. 2000 г.[9]
- "Прим. Savagella" Томпсон и другие. 2012 г.[9]
- "Прим. Скалиндуа"
- "Прим. Симилихламидиоз" Шаг и другие. 2013[9]
- "Прим. Симбиотрикс" Hongoh и другие. 2007 г.[9]
- "Прим. Тремблая" Тао и другие. 2002 г.[9]
- "Прим. Ксифинематобактер" Vandekerckhove и другие. 2000 г.[9]
Виды и подвиды
Если не указано иное (♦), эти записи взяты из LPSN.[9]
- "Прим. Acaryochloris bahamiensis" Лопес-Легентиль и другие. 2011 г.
- "Прим. Acidianus copahuensis" Джавено и другие. 2013
- "Прим. Ацидулипрофунд буней" Schouten и другие. 2008 г.
- "Прим. Аккумулибактер фосфатис" Hesselmann и другие. 1999 г.
- "Прим. Actinobaculum timonae" Drancourt и другие. 2004 г.
- "Прим. Adiaceo aphidicola" Дарби и другие. 2005 г.
- "Прим. Allobeggiatoa salina" Хинк и другие. 2011 г.
- "Прим. Алисиомикробиум баварикум" Kragelund и другие. 2006 г.
- "Прим. Alysiosphaera europaea" Kragelund и другие. 2006 г.
- "Прим. Amoebinatus massiliae" Greub и другие. 2004 г.
- "Прим. Amoebophilus asiaticus" Рог и другие. 2001 г.
- "Прим. Amphibiichlamydia ranarum" Мартель и другие. 2013
- "Прим. Anadelfobacter veles" Ваннини и другие. 2010 г.
- "Прим. Ancillula trichonymphae" Штрассерт и другие. 2012 г.
- "Прим. Анаммоксоглобус пропионический" Картал и другие. 2007 г.
- "Прим. Aquiluna rubra" Хан 2009
- "Прим. Aquirestis calciphila" Хан и Шауэр 2007
- "Прим. Аркобактер сульфидикус" Wirsen и другие. 2002 г.
- "Прим. Arsenophonus arthropodicus" Дол и другие. 2002 г.
- "Прим. Arsenophonus phytopathogenicus" Брессан и другие. 2012 г.
- "Прим. Arsenophonus triatominarum" Гипса и Дол 1997
- "Прим. Aschnera chinzeii" Хосокава и другие. 2012 г.
- "Прим. Ателоцианобактерии таласса(♦)
- "Прим. Bacteroides massiliae" Drancourt и другие. 2004 г.
- "Прим. Бартонелла анкаши" Blazes и другие. 2013
- "Прим. Бартонелла антекини" Kaewmongkol и другие. 2011 г.
- "Прим. Bartonella breitschwerdtii(♦)
- "Прим. Bartonella bandicootii" Kaewmongkol и другие. 2011 г.
- "Прим. Bartonella durdenii(♦)
- "Прим. Bartonella eldjazairii(♦)
- "Прим. Bartonella mayotimonensis" Линь и другие. 2010 г.
- "Прим. Бартонелла мелофаги(♦)
- "Прим. Bartonella merieuxii" Chomel и другие. 2012 г.
- "Прим. Бартонелла монакси(♦)
- "Прим. Bartonella rudakovii(♦)
- "Прим. Bartonella thailandensis" Сайсонгкорх и другие. 2009 г.
- "Прим. Bartonella volans(♦)
- "Прим. Bartonella woyliei" Kaewmongkol и другие. 2011 г.
- "Прим. Baumannia cicadellinicola" Моран и другие. 2003 г.
- "Прим. Benitsuchiphilus tojoi" Хосокава и другие. 2010 г.
- "Прим. Berkiella aquae" Мехари и другие. 2016 г.
- "Прим. Berkiella cookevillensis" Мехари и другие. 2016 г.
- "Прим. Blochmannia floridanus" Зауэр и другие. 2000 г.
- "Прим. Блохмания геркулесовая" Зауэр и другие. 2000 г.
- "Прим. Блохмания руфипес" Зауэр и другие. 2000 г.
- "Прим. Borrelia tachyglossi" Loh и другие. 2017 г.
- "Прим. Borrelia texasensis" Линь и другие. 2005 г.
- "Прим. Бранхиомонада цистикола" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Brocadia anammoxidans" Jetten и другие. 2001 г.
- "Прим. Brocadia caroliniensis" Магри и другие. 2012 г.
- "Прим. Brocadia fulgida" Картал и другие. 2004 г.
- "Прим. Brocadia sinica" Ху и другие. 2010 г.
- "Прим. Брауния ризоэкола" Грувелл и другие. 2010 г.
- "Прим. Burkholderia andongensis" Lemaire и другие. 2011 г.
- "Прим. Burkholderia calva" Ван Овелен и другие. 2004 г.
- "Прим. Burkholderia crenata(♦)
- "Прим. Burkholderia hispidae" Lemaire и другие. 2012 г.
- "Прим. Burkholderia kirkii" Ван Овелен и другие. 2002 г.
- "Прим. Burkholderia mamillata(♦)
- "Прим. Burkholderia nigropunctata" Ван Овелен и другие. 2004 г.
- "Прим. Burkholderia petitii" Lemaire и другие. 2011 г.
- "Прим. Burkholderia rigidae" Lemaire и другие. 2012 г.
- "Прим. Burkholderia schumannianae" Lemaire и другие. 2012 г.
- "Прим. Burkholderia verschuerenii(♦)
- "Прим. Burkholderia virens(♦)
- "Прим. Caedibacter acanthamoebae" Рог и другие. 1999 г.
- "Прим. Caldiarchaeum subterraneum" Нуноура и другие. 2011 г.
- "Прим. Campylobacter hominis" Лоусон и другие. 1998 г.
- "Прим. Captivus acidiprotistae" Бейкер и другие. 2003 г.
- "Прим. Cardinium hertigii" Жори-Фейн и другие. 2004 г.
- "Прим. Карсонелла руддии" Тао и другие. 2000 г.
- "Прим. Chloracidobacterium thermophilum" Брайант и другие. 2007 г.
- "Прим. Chlorothrix halophila" Клаппенбах и Пирсон 2004
- "Прим. Chryseobacterium massiliae" Greub и другие. 2004 г.
- "Прим. Chryseobacterium timonae" Drancourt и другие. 2004 г.
- "Прим. Clavochlamydia salmonicola" Карлсен и другие. 2008 г.
- "Прим. Cloacamonas acidaminovorans" Пеллетье и другие. 2008 г.
- "Прим. комитанцы" Якоби и другие. 1996 г.
- "Прим. Competibacter phosphatis" Crocetti и другие. 2002 г.
- "Прим. Consessoris aphidicola" Дарби и другие. 2005 г.
- "Прим. Contubernalis alkalaceticum" Жилина и другие. 2005 г.
- "Прим. Криптопродотис политропус" Феррантини и другие. 2009 г.
- "Прим. Curculioniphilus buchneri" Toju и другие. 2009 г.
- "Прим. Cyrtobacter приходит" Ваннини и другие. 2010 г.
- "Прим. Cyrtobacter zanobii" Boscaro и другие. 2013
- "Прим. Defluviella procrastinata" Boscaro и другие. 2013
- "Прим. Desulforudis audaxviator" Чивийский и другие. 2008 г.
- "Прим. Desulfovibrio trichonymphae" Сато и другие. 2009 г.
- "Прим. Devosia euplotis" Ваннини и другие. 2004 г.
- "Прим. Ecksteinia adelgidicola" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Ehrlichia walkerii" Brouqui и другие. 2003 г.
- "Прим. Endobugula glebosa" Lim и Haygood 2004
- "Прим. Эндобугула сертула" Haygood и Дэвидсон 1997
- "Прим. Endolissoclinum faulkneri" Кван и другие. 2012 г.
- "Прим. Endoecteinascidia frumentensis" Перес-Матос и другие. 2007 г.
- "Прим. Endomicrobium pyrsonymphae" Стингл и другие. 2005 г.
- "Прим. Endomicrobium trichonymphae" Стингл и другие. 2005 г.
- "Прим. Эндонуклеобактерные батимодиолы" Зелински и другие. 2009 г.
- "Прим. Эндорифтия персефона" Робидарт и другие. 2008 г.
- "Прим. Endowatersipora palomitas" Андерсон и Haygood 2007
- "Прим. Endowatersipora rubus" Андерсон и Haygood 2007
- "Прим. Entotheonella palauensis" Шмидт и другие. 2000 г.
- "Прим. Epiflobacter spp." Ся и другие. 2008 г.
- "Прим. Erwinia dacicola" Capuzzo и другие. 2005 г.
- "Прим. Evansia muelleri" Кюхлер и другие. 2013
- "Прим. Flaviluna lacus" Хан 2009
- "Прим. Fodinabacter communificans" Бертин и другие. 2011 г.
- "Прим. Francisella noatunensis subsp. эндоцилиофора" Schrallhammer и другие. 2011 г.
- "Прим. Frankia datiscae" Persson и другие. 2011 г.
- "Прим. Fritschea bemisiae" Эверетт и другие. 2005 г.
- "Прим. Fritschea eriococci" Эверетт и другие. 2005 г.
- "Прим. Gillettellia cooleyia" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Gilliamella apicola" Мартинсон и другие. 2012 г.
- "Прим. Гломерибактер гигаспорарум" Bianciotto и другие. 2003 г.
- "Прим. Горция инфекционная" Boscaro и другие. 2012 г.
- "Прим. Haliscomenobacter calcifugiens" Хан и Шауэр 2007
- "Прим. Halomonas phosphatis" Нгуен и другие. 2012 г.
- "Прим. Гамильтонелла дефенса" Моран и другие. 2005 г.
- "Прим. Helicobacter bovis" Де Гроот и другие. 1999 г.
- "Прим. Helicobacter heilmannii" О'Рурк и другие. 2004 г.
- "Прим. Helicobacter suis" Де Гроот и др. (включает штаммы, ранее известные как Helicobacter heilmannii тип один)
- "Прим. Heliomonas lunata" Асао и другие. 2012 г.
- "Прим. Hemipteriphilus asiaticus" Bing и другие. 2013
- "Прим. Hemobacterium ranarum" Чжан и Рикихиса 2004 (ранее известный как Эгипетелла ранарум)
- "Прим. Hepatincola porcellionum" Ван и другие. 2004 г.
- "Прим. Hepatobacter penaei" Нуман и другие. 2013
- "Прим. Hepatoplasma crinochetorum" Ван и другие. 2004 г.
- "Прим. Ходжкиния цикадикола" McCutcheon и другие. 2009 г.
- "Прим. Holdemania massiliensis(♦)
- "Прим. Ishikawaella capsulata" Хосокава и другие. 2006 г.
- "Прим. Isobeggiatoa divolgata" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Jettenia asiatica" Quan и другие. 2008 г.
- "Прим. Kinetoplastibacterium blastocrithidii" Du и другие. 1994 г.
- "Прим. Kinetoplastibacterium crithidii" Du и другие. 1994 г.
- "Прим. Kleidoceria schneideri" Кюхлер и другие. 2010 г.
- "Прим. Kopriimonas aquarianus" Куинн и другие. 2012 г.
- "Прим. Корархеум криптофилум" Элкинс и другие. 2008 г.
- "Прим. Корибактер универсальный" сторожить и другие. 2009 г.
- "Прим. Kuenenia stuttgartiensis" Шмид и другие. 2000 г.
- "Прим. Ларискелла артроподарум" Мацуура и другие. 2012 г.
- "Прим. Легионелла чонии" Парк и другие. 2004 г.
- "Прим. Liberibacter americanus" Тейшейра и другие. 2005 г. - одна причина Болезнь озеленения цитрусовых
- "Прим. Liberibacter africanus" Робертс и другие. 2015 - одна причина Болезнь озеленения цитрусовых
- "Прим. Liberibacter africanus"Корриг. Jagoueix и другие. 1994 (ранее "Ca. Liberobacter africanum)
- "Прим. Liberibacter africanus subsp. capensis" Гарнье и другие. 2000 г.
- "Прим. Liberibacter asiaticus"Корриг. Jagoueix и другие. 1994 (ранее "Ca. Liberobacter asiaticum) - одна из причин Болезнь озеленения цитрусовых
- "Прим. Liberibacter europaeus" Раддади и другие. 2011 г.
- "Прим. Liberibacter psyllaurous" Хансен и другие. 2008 г.
- "Прим. Liberibacter solanacearum" Liefting и другие. 2009 г. - причина Псиллиды желтые и Чип зебры
- "Прим. Лимнолуна рубра" Хан 2009
- "Прим. Macropleicola appendiculatae" Кёльш и другие. 2009 г.
- "Прим. Macropleicola muticae" Кёльш и другие. 2009 г.
- "Прим. Magnetobacterium bavaricum" Весна и другие. 1993 г.
- "Прим. Magnetoglobus multicellularis" Абреу и другие. 2007 г.
- "Прим. Magnospira bakii" Снайдр и другие. 1999 г.
- "Прим. Maribeggiatoa vulgaris" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Marispirochaeta associata" Шивани и другие. 2016 г.
- "Прим. Marithioploca araucae" Салман и другие
- "Прим. Маритрикс Сесилис" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Мезохламидии элодеи" Корсаро и другие. 2013
- "Прим. Metachlamydia lacustris" Корсаро и другие. 2010 г.
- "Прим. Methanogranum caenicola" Иино и другие. 2013
- "Прим. Methanomethylophilus alvus" Borrel и другие. 2012 г.
- "Прим. Methanoregula boonei" Bräuer и другие. 2006 г.
- "Прим. Метилацидифилум инфернорум" Hou и другие. 2008 г.
- "Прим. Метиломирабилис оксифера" Эттвиг и другие. 2010 г.
- "Прим. Micrarchaeum acidiphilum(♦)
- "Прим. Микротрикс калида" Левантези и другие. 2006 г.
- "Прим. Microthrix parvicella" Blackall и другие. 1996 г.
- "Прим. Мидихлория митохондрии" Sassera и другие. 2006 г.
- "Прим. Monilibacter batavus" Kragelund и другие. 2006 г.
- "Прим. Моранелла эндобия" McCutcheon и фон Долен 2011
- "Прим. Mycoplasma aoti" Баркер и другие. 2011 г.
- "Прим. Mycoplasma corallicola" Neulinger и другие. 2009 г.
- "Прим. Mycoplasma haematoparvum" Сайкс и другие. 2005 г.
- "Прим. Mycoplasma haemobos" Тагава и другие. 2008 г.
- "Прим. Mycoplasma haemodidelphidis" Мессик и другие. 2002 г.
- "Прим. Микоплазма гемофелис" Neimark и другие. 2001 (синоним Haemobartonella felis)
- "Прим. Mycoplasma haemolamae" Мессик и другие. 2002 г.
- "Прим. Mycoplasma haemomacaque" Maggi и другие. 2013
- "Прим. Микоплазма гемоминутум" Фоли и Педерсен 2001 (ранее "Haemobartonella felis малая форма (Hfsm) ")
- "Прим. Mycoplasma haemomuris" Neimark и другие. 2001 (синоним Haemobartonella muris)
- "Прим. Mycoplasma haemomuris subsp. мускулы" Харасава и другие. 2015 г.
- "Прим. Mycoplasma haemomuris subsp. ратти" Харасава и другие. 2015 г.
- "Прим. Mycoplasma haemosuis" Neimark и другие. 2001 (синоним Eperythrozoon suis и Mycoplasma suis)
- "Прим. Mycoplasma haemovis" Горнок и другие. 2009 г.
- "Прим. Mycoplasma haemozalophi" Волохов и другие. 2011 г.
- "Прим. Mycoplasma kahanei" Neimark и другие. 2002 г.
- "Прим. Mycoplasma ravipulmonis" Neimark и другие. 1998 г.
- "Прим. Mycoplasma turicensis" Вилли и другие. 2006 г.
- "Прим. Mycoplasma wenyonii" Neimark и другие. 2001 (синоним Eperythrozoon wenyonii)
- "Прим. Nebulobacter yamunensis" Boscaro и другие. 2012 г.
- "Прим. Neoehrlichia arcana" Гофтон и другие. 2016 г.
- "Прим. Neoehrlichia australis" Гофтон и другие. 2016 г.
- "Прим. Neoehrlichia lotoris" Ябсли и другие. 2008 г.
- "Прим. Neoehrlichia mikurensis" Кавахара и другие. 2004 г.
- "Прим. Nitrosoarchaeum koreensis" Ким и другие. 2011 г.
- "Прим. Nitrosoarchaeum limnia" Блейни и другие. 2011 г.
- "Прим. Nitrosocaldus yellowstonii" де ла Торре и другие. 2008 г.
- "Прим. Nitrosopelagicus brevis(♦)
- "Прим. Nitrosopumilus koreensis" Парк и другие. 2012 г.
- "Прим. Nitrosopumilus maritimus" Könneke и другие. 2005 г.
- "Прим. Nitrosopumilus salaria" Мозье и другие. 2012 г.
- "Прим. Nitrosopumilus sediminis" Парк и другие. 2012 г.
- "Прим. Nitrososphaera gargensis" Hatzenpichler и другие. 2008 г.
- "Прим. Nitrososphaera viennensis" Tourna и другие. 2011 г.
- "Прим. Nitrospira bockiana" Лебедева и другие. 2008 г.
- "Прим. Nitrospira defluvii" Spieck и другие. 2006 г.
- "Прим. Nitrosotalea devanaterra" Лехтовирта-Морлей и другие. 2011 г.
- "Прим. Nitrotoga arctica" Алави и другие. 2007 г.
- "Прим. Nostocoida limicola" Blackall и другие. 2000 (штаммы Бен 17, Бен 18, Бен 67, Бен 68 и Бен 74 сейчас Tetrasphaera jenkinsii, штамм Бен 70 Tetrasphaera vanveenii, а штаммы Ver 1 и Ver 2 Tetrasphaera veronensis)
- "Прим. Odyssella thessalonicensis" Birtles и другие. 2000 г.
- "Прим. Ovobacter propellens" Фенчел и Тар 2004
- "Прим. Paenicardinium endonii" Ноэль и Атибалентя 2006
- "Прим. Parabeggiatoa communis" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Paracaedibacter acanthamoebae" Рог и другие. 1999 г.
- "Прим. Симбиоз Paracaedibacter" Рог и другие. 1999 г.
- "Прим. Paraholospora nucleivisitans" Эшбах и другие. 2009 г.
- "Прим. Parilichlamydia carangidicola" Шаг и другие. 2013
- "Прим. Parvarchaeum acidophilus(♦)
- "Прим. Pasteuria aldrichii" Гиблин-Дэвис и другие. 2011 г.
- "Прим. Pasteuria usgae" Гиблин-Дэвис и другие. 2003 г.
- "Прим. Пелагибактер убик" Рапп и другие. 2002 г.
- "Прим. Пептострептококк massiliae" Drancourt и другие. 2004 г.
- "Прим. Phlomobacter fragariae" Зрейк и другие. 1998 г.
- "Прим. Фотодесмус катоптрон" Хендри и Dunlap, 2011
- "Прим. Фитоплазма 16SrII-U" Ян и другие. 2016 г.
- "Прим. Фитоплазма аллокасуарина" Marcone и другие. 2004 г.
- "Прим. Фитоплазма американская" Ли и другие. 2006 г.
- "Прим. Фитоплазма астерис" Ли и другие. 2004 г.
- "Прим. Phytoplasma aurantifolia" Зрейк и другие. 1995 г.
- "Прим. Phytoplasma australiense" Дэвис и другие. 1997 г.
- "Прим. Фитоплазма баланита" Победить и другие. 2013
- "Прим. Phytoplasma brasiliense" Монтано и другие. 2001 г.
- "Прим. Фитоплазма карие" Ароча и другие. 2005 г.
- "Прим. Phytoplasma castaneae" Юнг и другие. 2002 г.
- "Прим. Фитоплазма cirsii" Сафарова и другие. 2016 г.
- "Прим. Фитоплазма вьюнок" мартини и другие. 2012 г.
- "Прим. Phytoplasma costaricanum" Ли и другие. 2011 г.
- "Прим. Фитоплазма цинодонтис" Marcone и другие. 2004 г.
- "Прим. Phytoplasma fragariae" Валюнас и другие. 2006 г.
- "Прим. Фитоплазма fraxini" Гриффитс и другие. 1999 - причина Сиреневый ведьм-метла
- "Прим. Phytoplasma graminis" Ароча и другие. 2005 г.
- "Прим. Фитоплазма Hispanicum" Дэвис и другие. 2016 г.
- "Прим. Phytoplasma japonicum" Саваянаги и другие. 1999 г.
- "Прим. Фитоплазма lycopersici" Ароча и другие. 2007 г.
- "Прим. Phytoplasma malaysianum" Неджат и другие. 2013
- "Прим. Фитоплазма мали" Seemüller и Шнайдер 2004
- "Прим. Фитоплазма meliae" Фернандес и другие. 2016 г.
- "Прим. Phytoplasma omanense" Аль-Саади и другие. 2008 г.
- "Прим. Phytoplasma oryzae" Юнг и другие. 2003 г.
- "Прим. Фитоплазма пальмовая" Харрисон и другие. 2014 г.
- "Прим. Phytoplasma phoenicium" Вердин и другие. 2003 г.
- "Прим. Фитоплазма пини" Шнайдер и другие. 2005 г.
- "Прим. Phytoplasma pruni" Дэвис и другие. 2013
- "Прим. Phytoplasma prunorum" Seemüller и Шнайдер 2004
- "Прим. Phytoplasma pyri" Seemüller и Шнайдер 2004
- "Прим. Фитоплазма рамни" Marcone и другие. 2004 г.
- "Прим. Фитоплазма руби" Малембик-Махер и другие. 2011 г.
- "Прим. Фитоплазма руби" Франова и другие. 2016 г.
- "Прим. Phytoplasma solani" Quaglino и другие. 2013
- "Прим. Фитоплазма spartii" Marcone и другие. 2004 г.
- "Прим. Фитоплазма sudamericanum" Дэвис и другие. 2012 г.
- "Прим. Phytoplasma tamaricis" Чжао и другие
- "Прим. Фитоплазма трехлистная" Хируки и Ван 2004
- "Прим. Фитоплазма ulmi" Ли и другие. 2004 г.
- "Прим. Фитоплазма vitis" Марзорати и другие. 2006 г. - причина Flavescence dorée
- "Прим. Фитоплазма зизифи" Юнг и другие. 2003 г.
- "Прим. Piscichlamydia salmonis" Драги и другие. 2004 г.
- "Прим. Planktoluna difficilis" Хан 2009
- "Прим. Planktomarina temperata" Гибель и другие. 2011 г.
- "Прим. Планктофила лимнетика" Jezbera и другие. 2009 г.
- "Прим. Портьера алейродидарум" Тао и Бауманн 2004
- "Прим. Prevotella massiliensis" Drancourt и другие. 2004 г.
- "Прим. Procabacter acanthamoebae" Рог и другие. 2002 г.
- "Прим. Profftia tarda" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Profftia virida" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Протохламидия амебофила" Collingro и другие. 2005 г.
- "Прим. Puchtella pedicinophila" Фукацу и другие. 2009 г.
- "Прим. Puniceispirillum marinum" ой и другие. 2010 г.
- "Прим. Purcelliella pentastirinorum" Брессан и другие. 2009 г.
- "Прим. Региелла инсектикола" Моран и другие. 2005 г.
- "Прим. Renichlamydia lutjani" Корсаро и Работа, 2012
- "Прим. Rhabdochlamydia crassificans" Корсаро и другие. 2006 г.
- "Прим. Rhabdochlamydia porcellionis" Костаньшек (морфология соответствует описанию Хламидии изоподий)
- "Прим. Rhizobium massiliae" Greub и другие. 2004 г.
- "Прим. Родолуна лимнофила" Хан 2009
- "Прим. Родолуна планктоническая" Хан 2009
- "Прим. Риккетсия амблиоммия" Лабруна и другие. 2004 г.
- "Прим. Rickettsia andeanae" Цзян и другие. 2005 г.
- "Прим. Rickettsia asemboensis" Цзян и другие. 2013
- "Прим. Rickettsia barbariae" Мура и другие. 2008 г.
- "Прим. Риккетсия хебейская" Yaxue и другие. 2011 г.
- "Прим. Риккетсия венгерская" Горнок и другие. 2010 г.
- "Прим. Риккетсия hoogstraalii"Маттила и др. 2007 г.[25]
- "Прим. Риккетсия Келли" Ролайн и другие. 2006 г.
- "Прим. Риккетсия королевская" Анстед и Чилтон 2013
- "Прим. Риккетсия котлания" Sréter-Lancz и другие. 2006 г.
- "Прим. Риккетсия свободная" Медианников и другие. 2012 г.
- "Прим. Принципиальная риккетсия" Медианников и другие. 2006 г.
- "Прим. Риккетсия сенегальская«Медианников, Обади-Ладрикс и Рауль, 2015 г.[26]
- "Прим. Риккетсия тарасевичья" Шпынов и другие. 2003 г.
- "Прим. Риккетсия тасманская" Иззард и другие. 2009 г.
- "Прим. Риккетсия вини" Паломар и другие. 2012 г.
- "Прим. Riegeria galateiae" Грубер-Водичка и другие. 2011 г.
- "Прим. Ризия педикулликола" Сасаки-Фукацу и другие. 2006 г.
- "Прим. Rohrkolberia cinguli" Кюхлер и другие. 2011 г.
- "Прим. Roseomonas massiliae" Greub и другие. 2004 г.
- "Прим. Руфия Великолепная" Ньютон и другие. 2007 г.
- "Прим. Скалиндуа арабика" Woebken и другие. 2008 г.
- "Прим. Scalindua brodae" Шмид и другие. 2003 г.
- "Прим. Scalindua pacifica" Черт возьми и другие. 2003 г.
- "Прим. Scalindua profunda" Ван Де Фоссенберг и другие. 2008 г.
- "Прим. Скалиндуа Ричардсии" Fuchsman и другие. 2012 г.
- "Прим. Scalindua sorokinii" Кайперс и другие. 2003 г.
- "Прим. Scalindua Wagneri" Шмид и другие. 2003 г.
- "Прим. Serratia symbiotica" Моран и другие. 2005 г.
- "Прим. Similichlamydia latridicola" Шаг и другие. 2013
- "Прим. Snodgrassella alvi" Мартинсон и другие. 2012 г.
- "Прим. Snodgrassella alvi" Мартинсон и другие. 2012 г.
- "Прим. Содалис мелофаги" Хрудимский и другие. 2012 г.
- "Прим. Sodalis pierantonius" Oakeson и другие. 2014 г.
- "Прим. Sphaeronema italicum" Kragelund и другие. 2006 г.
- "Прим. Stammerula tephritidis" Mazzon и другие. 2008 г.
- "Прим. Стефания аделгидикола" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Streptomyces philanthi" Кальтенпот и другие. 2006 г.
- "Прим. Sulcia muelleri" Моран и другие. 2005 г.
- "Прим. Sulfurovum sediminum" Парк и другие. 2012 г.
- "Прим. Symbiothrix dinenymphae" Hongoh и другие. 2007 г.
- "Прим. Synechococcus spongiarum" Usher и другие. 2004 г.
- "Прим. Tammella caduceiae" Hongoh и другие. 2007 г.
- "Прим. Tenderia electrophaga" Эдди и другие. 2016 г.
- "Прим. Thermochlorobacter aerophilum" Лю и другие. 2012 г.
- "Прим. Тиобиос зоотамниколи" Ринке и другие. 2006 г.
- "Прим. Thiodictyon syntrophicum" Peduzzi и другие. 2012 г.
- "Прим. Тиоглобус сингулярный" Маршалл и Моррис, 2013
- "Прим. Thiomargarita joergensenii" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Thiomargarita nelsonii" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Thiophysa hinzei" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Тиопилула агрегата" Салман и другие. 2011 г.
- "Прим. Тиотурбо Даникус" Муйзер и другие. 2005 г.
- "Прим. Тремблая фенакола" Грувелл и другие. 2010 г.
- "Прим. Тремблая принцепс" Тао и другие. 2002 г.
- "Прим. Troglogloea absoloni" Костаньшек и другие. 2013
- "Прим. Узинура диаспидикола" Грувелл и другие. 2007 г.
- "Прим. Валлотия кулейя" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Валлотия поздняя" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Валлотия вирида" Toenshoff и другие. 2012 г.
- "Прим. Veillonella atypica" Drancourt и другие. 2004 г.
- "Прим. Vesicomyosocius okutanii" Кувахара и другие. 2007 г.
- "Прим. Vestibaculum illigatum" Стингл и другие. 2004 г.
- "Прим. Vidania fulgoroideae" Гонелла и другие. 2011 г.
- "Прим. Волинелла африканская" Бор и другие. 2003 г.
- "Прим. Xenohaliotis californiensis" Фридман и другие. 2000 г.
- "Прим. Xiphinematobacter americani" Vandekerckhove и другие. 2000 г.
- "Прим. Xiphinematobacter brevicolli" Vandekerckhove и другие. 2000 г.
- "Прим. Xiphinematobacter rivesi" Vandekerckhove и другие. 2000 г.
- "Прим. Зиндерия инсектикола" McCutcheon и Моран, 2010
Бывшие таксоны Candida
- Арматимонадеты, ранее кандидат филум OP10[5][27][28]
- Caldiserica, ранее кандидат филума OP5[5][29]
- Elusimicrobia, ранее группа термитов 1[30]
- Lentisphaerae, ранее vadinBE97[5][31]
Смотрите также
- Не культивируемые бактериальные филы и метагеномика
- Открытая номенклатура, система обозначений, используемая в таксономии для обозначения суждения таксономиста о сходстве таксонов.
- Глоссарий научного нейминга
- incertae sedis, таксон неопределенного положения в классификации
- номен дубиум, имя неизвестного или сомнительного приложения
Рекомендации
- ^ а б c Обнять LA; и другие. (2016). «Новый взгляд на древо жизни». Природная микробиология. Статья 16048 (5): 16048. Дои:10.1038 / nmicrobiol.2016.48. PMID 27572647.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак «ARB-Silva: обширная база данных рибосомных РНК». Команда разработчиков ARB. Получено 2 января, 2016.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au средний ау топор ай az ба bb до н.э bd быть парень bg бх би Ъ bk бл бм млрд бо бп бк br bs bt бу bv чб bx к bz ок cb cc CD ce ср cg ch ci cj «Браузер таксономии». NCBI. Получено 2 января 2016.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s «Браузер иерархии». Проект базы данных рибосом. Получено 2 января, 2016.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у Раппе, Майкл С .; Джованнони, Стивен Дж. (2003). «Культурное микробное большинство». Ежегодный обзор микробиологии. 57: 369–94. Дои:10.1146 / annurev.micro.57.030502.090759. PMID 14527284.
- ^ а б Кенли А. Хиллер, Кеннет Х. Форман, Дэвид Вейсман, Дженнифер Л. Боуэн: проницаемые реактивные барьеры, разработанные для смягчения последствий эвтрофикации, изменяют состав бактериального сообщества и окислительно-восстановительные условия водоносного горизонта. В: Appl Environ Microbiol v.81 (20); 2015 окт; pp.7114–7124. DOI: 10.1128 / AEM.01986-15. ЧВК 4579450. PMID 26231655.
- ^ Райтон KC; и другие. (2014). «Метаболические взаимозависимости между филогенетически новыми ферментерами и респираторными организмами в безграничном водоносном горизонте». Журнал ISME. 8 (7): 1452–1463. Дои:10.1038 / ismej.2013.249. ЧВК 4069391. PMID 24621521.
- ^ Yeoh YK; и другие. (2015). «Сравнительная геномика кандидатного типа TM6 предполагает, что паразитизм широко распространен и является наследственным в этой линии». Мол Биол Эвол. 33 (4): 915–927. Дои:10.1093 / molbev / msv281. ЧВК 4776705. PMID 26615204.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль Parte, A.C; Euzéby, J.P. (2017). «Имена включены в категорию Candidatus». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре. Получено 4 января 2018.
- ^ Киркегор, Расмус Хансен; Дуэхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Ниерихло, Марта; Карст, Серен Майкл; Альбертсен, Мадс; Нильсен, Пер Халькьер (01.10.2016). «Геномное понимание членов кандидата филума Hyd24-12, часто встречающегося в мезофильных анаэробных варочных котлах». Журнал ISME. 10 (10): 2352–2364. Дои:10.1038 / ismej.2016.43. ISSN 1751-7370. ЧВК 5030696. PMID 27058503.
- ^ Подосокорская О.А.; и другие. (2013). "Характеристика Melioribacter roseus ген. nov., sp. nov., новая факультативно анаэробная термофильная целлюлолитическая бактерия из класса Игнавибактерии, и предложение нового бактериального филума Игнавибактерии". Environ. Микробиол. 15 (6): 1759–71. Дои:10.1111/1462-2920.12067. PMID 23297868.
- ^ NCBI: Кандидатский дивизион ZB3 (класс), Cyanobacteria / Melainabacteria group
- ^ Сэкигучи Y; и другие. (2015). «Первые сведения о геноме членов кандидата бактериального филума, ответственного за накопление сточных вод». PeerJ. 3: e740. Дои:10.7717 / peerj.740. ЧВК 4312070. PMID 25650158.
- ^ Lucker S; и другие. (2013). "Геном Nitrospina gracilis освещает метаболизм и эволюцию основного окислителя нитритов в морской среде ». Передний. Микробиол. 4: 27. Дои:10.3389 / fmicb.2013.00027. ЧВК 3578206. PMID 23439773.
- ^ Кристофер Т. Браун, Лаура А. Хуг, Брайан К. Томас и другие.; и другие. (2015). «Необычная биология в группе, включающей более 15% доменных бактерий». Природа. 523 (7559): 208–11. Bibcode:2015Натура.523..208Б. Дои:10.1038 / природа14486. PMID 26083755.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- ^ NCBI: Candidatus Peregrinibacteria (тип)
- ^ UniProt: Таксономия - Candidatus Peregrinibacteria (ФИЛУМ)
- ^ Картик Анантараман, Кристофер Т. Браун, Дэвид Бурштейн, Синди Кастель: Анализ пяти полных последовательностей генома представителей класса Peribacteria в недавно признанном бактериальном типе Peregrinibacteria. В: PeerJ 4 (8): e1607; Янв 2016; DOI: 10.7717 / peerj.1607
- ^ Fieseler L; и другие. (2004). "Открытие нового типа-кандидата" Poribacteria "у морских губок". Прикладная и экологическая микробиология. 70 (6): 3724–32. Дои:10.1128 / AEM.70.6.3724-3732.2004. ЧВК 427773. PMID 15184179.
- ^ Albertsen M; и другие. (2013). «Последовательности генома редких, некультивируемых бактерий, полученные путем объединения нескольких метагеномов с дифференцированным охватом». Nat. Биотехнология. 31 (6): 533–8. Дои:10.1038 / nbt.2579. PMID 23707974.
- ^ Hugenholtz P; и другие. (1998). «Влияние культурно-независимых исследований на формирующееся филогенетическое представление о бактериальном разнообразии». Журнал бактериологии. 180 (18): 4765–74. Дои:10.1128 / JB.180.18.4765-4774.1998. ЧВК 107498. PMID 9733676.
- ^ Марси Y; и другие. (2007). «Рассечение биологической« темной материи »с помощью одноклеточного генетического анализа редких и некультивируемых микробов TM7 изо рта человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 104 (29): 11889–94. Дои:10.1073 / pnas.0704662104.
- ^ Wilson MC; и другие. (2014). «Таксон экологических бактерий с большим и отличным метаболическим репертуаром» (PDF). Природа. 506 (7486): 58–62. Bibcode:2014 Натур.506 ... 58Вт. Дои:10.1038 / природа12959. PMID 24476823.
- ^ Дойка М.А.; и другие. (2000). «Расширение известного разнообразия и распространения некультивируемых филогенетических бактерий в окружающей среде». Прикладная и экологическая микробиология. 66 (4): 1617–21. Дои:10.1128 / AEM.66.4.1617-1621.2000. ЧВК 92031. PMID 10742250.
- ^ Маттила, Дж. Т., Н. И. Буркхард, Г. Дж. Хатчесон, У. Г. Мундерло и Т. Дж. Куртти. 2007. Выделение клеточных линий и риккетсиозного эндосимбионта от мягкого клеща. Carios capensis (Нойман) (Acari: Argasidae: Ornithodorinae). Журнал медицинской энтомологии 44: 1091–1101. «Мы предлагаем назвать изолят RCCE3 Candidatus. Риккетсия hoogstraalii в честь Гарри Хугстрал кто так много сделал для наших знаний о клещах ".
- ^ О. Медианников О., Обади-Ладрикс М, Рауль Д. (2015). «Candidatus 'Rickettsia senegalensis' у кошачьих блох в Сенегале». Новые микробы Новый зараз. 3: 24–8. Дои:10.1016 / j.nmni.2014.10.005. ЧВК 4337942. PMID 25755888.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь): «Мы выделили три штамма риккетсиозов, и генетический анализ показал, что эти штаммы представляют собой вероятный новый вид, условно названный Candidatus. Риккетсия сенегальская здесь."
- ^ Tamaki H; и другие. (2010). "Armatimonas rosea ген. nov., sp. nov., грамотрицательная аэробная хемогетеротрофная бактерия нового бактериального типа Armatimonadetes phyl. nov., формально названный кандидатом типа OP10 ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 61 (Pt 6): 1442–7. Дои:10.1099 / ijs.0.025643-0. PMID 20622056.
- ^ Ли KCY; и другие. (2010). "Chthonomonas calidirosea ген. nov., sp. nov., аэробный пигментированный термофильный микроорганизм нового класса бактерий Chthonomonadetes classis. nov., недавно описанного типа Armatimonadetes, первоначально обозначенного как подразделение-кандидат OP10 " (PDF). Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 61 (Pt 10): 2482–90. Дои:10.1099 / ijs.0.027235-0. PMID 21097641.
- ^ Мори К; и другие. (2009). "Caldisericum изгнанник ген. nov., sp. nov., анаэробная термофильная нитчатая бактерия нового бактериального типа Caldiserica phyl. nov., первоначально названный типом-кандидатом OP5, и описание Caldisericaceae fam. nov., Caldisericales ord. ноя и Caldisericia classis nov ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 59 (Pt 11): 2894–8. Дои:10.1099 / ijs.0.010033-0. PMID 19628600.
- ^ Гейссинджер О; и другие. (2009). "Ультрамикробактерии Elusimicrobium minutum ген. nov., sp. nov., первый культурный представитель группы термитов 1 типа ". Прикладная и экологическая микробиология. 75 (9): 2831–40. Дои:10.1128 / AEM.02697-08. ЧВК 2681718. PMID 19270135.
- ^ Cho JC; и другие. (2004). "Lentisphaera araneosa ген. nov., sp. nov, прозрачный экзополимер, продуцирующий морские бактерии, и описание нового бактериального типа, Lentisphaerae ". Экологическая микробиология. 6 (6): 611–21. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2004.00614.x. PMID 15142250.