WikiDer > ОНИОМ - Википедия
ONIOM - Wikipedia
В ОНИОМ (наша собственная n-слойная интегрированная молекулярная орбиталь и молекулярная механика) вычислительный подход, разработанный Морокумой и соавторами. ONIOM - это гибридный метод, позволяющий ab initio или же полуэмпирический методы, применяемые к различным частям молекулы / системы и объединенные для получения надежных геометрия и энергия при сокращении вычислительного времени.[1][2][3]
Вычислительный подход ONIOM оказался особенно полезным для биомолекулярные системы [4] а также для комплексы переходных металлов и катализаторы.[5]
Коды, поддерживающие ONIOM
Смотрите также
- QM / MM
- Стерические эффекты (ONIOM для разделения стерических и электронных эффектов)
внешняя ссылка
Рекомендации
- ^ С. Дапприх; И. Комароми; К.С. Бюн; К. Морокума и М.Дж. Фриш (1999). «Новая реализация ONIOM в Gaussian98. Часть I. Расчет энергий, градиентов, частот колебаний и производных электрического поля». Журнал молекулярной структуры: ТЕОХИМА. 461-462: 1–21. Дои:10.1016 / S0166-1280 (98) 00475-8.
- ^ Вревен, Т; Морокума, К. (2006). «Глава 3 Гибридные методы: ONIOM (QM: MM) и QM / MM». Годовые отчеты по вычислительной химии. 2: 35–51. Дои:10.1016 / S1574-1400 (06) 02003-2. ISBN 9780444528223.
- ^ Свенссон, Матс; Humbel, StéPhane; Froese, Роберт Д. Дж .; Мацубара, Тошиаки; Зибер, Стефан; Морокума, Кейджи (1996). «ONIOM: Многослойный интегрированный метод MO + MM для оптимизации геометрии и одноточечных прогнозов энергии. Тест на реакции Дильса-Альдера и Pt (P (t-Bu) 3) 2+ H2Oxidative Addition». Журнал физической химии. 100 (50): 19357. Дои:10.1021 / jp962071j.
- ^ Сенн, Н; Тиль, W (2007). «QM / MM исследования ферментов». Современное мнение в области химической биологии. 11 (2): 182–7. Дои:10.1016 / j.cbpa.2007.01.684. PMID 17307018.
- ^ Анаников, Валентин П .; Мусаев, Джамаладдин Г .; Морокума, Кейджи (2010). «Реальный размер лигандов, реагентов и катализаторов: исследования структуры, реакционной способности и селективности с помощью ONIOM и других гибридных вычислительных подходов ☆». Журнал молекулярного катализа A: химический. 324 (1–2): 104–119. Дои:10.1016 / j.molcata.2010.03.015.