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	Baum des Lebens öffnen
	Öffne Lebensbaum am Knoten Eukaryoten
Art	Biodiversitätsdatenbank
Sprache	Englisch
Etabliert	September 2015
Status	Aktiv
Verknüpfung	opentreeoflife.org
Portal	Medien ; Biologie

Open Tree of Life

Baum des Lebens öffnen ist ein Online- phylogenetisch Familienstammbaum - eine gemeinsame Anstrengung, finanziert von der Nationale Wissenschaftsstiftung.^[1]^[2] Der erste Entwurf mit 2,3 Millionen Arten wurde im September 2015 veröffentlicht.^[3]

Das interaktive Diagramm ermöglicht es dem Benutzer, taxonomische Klassifikationen, phylogenetische Bäume zu vergrößern und Informationen zu Knoten abzufragen. Für einzelne Arten werden auch die Quellen- und Referenztaxonomie angezeigt.

Ansatz

Das Projekt verwendet einen "Supertree"-Ansatz, bei dem ein einzelner phylogenetischer Stammbaum aus einer Kombination kleinerer phylogenetischer Bäume zusammengesetzt wird. Dieser Stammbaum (eingesehen unter tree.opentreeoflife.org^[4]) wird aus einem erweiterten Taxonomie und ein zusammengesetzter Satz veröffentlichter phylogenetischer Schätzungen.

Die Taxonomie ist eine Kombination mehrerer wichtiger Klassifikationen, die von anderen Projekten erstellt wurden; es wurde mit einem Software-Tool namens "Smasher" erstellt.^[5] Die resultierende Taxonomie wird als Open Tree Taxonomy (OTT) bezeichnet und kann online eingesehen werden.^[6]

Geschichte

Das Projekt startete im Juni 2012 mit einer dreijährigen NSF-Preis für Forscher von zehn Universitäten. Im Jahr 2015 wurden Forscherinnen und Forscher aus drei Institutionen mit einem zweijährigen Zusatzpreis ausgezeichnet.

Siehe auch

Baum des Lebens Webprojekt

Quellen, Anmerkungen und/oder Verweise

↑(und) Hinchliff, C. E., Smith, SA, Allman, JF, Burleigh, JG, Chaudhary, R., Coghill, LM, Crandall, KA, Deng, J., Drew, BT, Gazis, R., Gude, K., Hibbett, DS, Katz, LA, Laughinghouse, HD, 4., McTavish, EJ, Midford, PE, Owen, CL, Ree, RH, Rees, JA, Soltis, DE, Williams, T., Cranston, KA (Oktober 2015).Synthese von Phylogenie und Taxonomie zu einem umfassenden Lebensbaum. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America112 (41): 12764–9.. PMID: 26385966. PMC: 4611642 DOI:10.1073/pnas.1423041112.
↑(und) Den Baum des Lebens zusammenbauen, visualisieren und analysieren. Nationale Wissenschaftsstiftung (NSF). Zugegriffen unter 11. Februar 2016.
↑(und) Pennisi, Elizabeth, Erster umfassender Lebensbaum zeigt, wie verwandt Sie mit Millionen von Arten sind. Wissenschaftsmagazin (21. September 2015). Zugegriffen unter 24. Juni 2020.
↑(und) offener Baum. Zugegriffen unter 24. Juni 2020.
↑(und) Rees, Jonathan A., Cranston, Karen (2017). Automatisierte Zusammenstellung einer Referenztaxonomie für die phylogenetische Datensynthese. Datenjournal zur Biodiversität5 (5): e12581.. PMID: 28765728. PMC: 5515096 DOI:10.3897/BDJ.5.e12581.
↑(und) Open Tree Taxonomie: zelluläre Organismen. baum.opentreeoflife.org. Zugegriffen unter 27. Juni 2020.

[1] (und) Hinchliff, C. E., Smith, SA, Allman, JF, Burleigh, JG, Chaudhary, R., Coghill, LM, Crandall, KA, Deng, J., Drew, BT, Gazis, R., Gude, K., Hibbett, DS, Katz, LA, Laughinghouse, HD, 4., McTavish, EJ, Midford, PE, Owen, CL, Ree, RH, Rees, JA, Soltis, DE, Williams, T., Cranston, KA (Oktober 2015).Synthese von Phylogenie und Taxonomie zu einem umfassenden Lebensbaum. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America112 (41): 12764–9.. PMID: 26385966. PMC: 4611642 DOI:10.1073/pnas.1423041112.

[2] (und) Den Baum des Lebens zusammenbauen, visualisieren und analysieren. Nationale Wissenschaftsstiftung (NSF). Zugegriffen unter 11. Februar 2016.

[3] (und) Pennisi, Elizabeth, Erster umfassender Lebensbaum zeigt, wie verwandt Sie mit Millionen von Arten sind. Wissenschaftsmagazin (21. September 2015). Zugegriffen unter 24. Juni 2020.

[4] (und) offener Baum. Zugegriffen unter 24. Juni 2020.

[5] (und) Rees, Jonathan A., Cranston, Karen (2017). Automatisierte Zusammenstellung einer Referenztaxonomie für die phylogenetische Datensynthese. Datenjournal zur Biodiversität5 (5): e12581.. PMID: 28765728. PMC: 5515096 DOI:10.3897/BDJ.5.e12581.

[6] (und) Open Tree Taxonomie: zelluläre Organismen. baum.opentreeoflife.org. Zugegriffen unter 27. Juni 2020.

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