WikiDer > Аскорбат пероксидаза

Ascorbate peroxidase

Аскорбат пероксидаза (или же APX) является членом семьи гем-содержащие пероксидазы. Гем пероксидазы катализировать H2О2-зависимое окисление широкого круга различных, обычно органических, субстратов в биологии.

Структура аскорбатпероксидазы в комплексе с аскорбатом (синим цветом); гистидиновый лиганд (красный) координируется с железом гемовой группы (также красным). Изображение взято из PDB 1OAF и создано с помощью Pymol

Обзор

Об активности аскорбат-зависимой пероксидазы впервые сообщили в 1979 г.[1],[2] более 150 лет после первого наблюдения активности пероксидазы в растениях хрена[3] и почти 40 лет спустя после открытия тесно связанных цитохром с пероксидаза фермент.[4]

Пероксидазы подразделяются на три типа (класс I, класс II и класс III): аскорбатпероксидазы - это фермент пероксидазы класса I.[5] APX катализируют H2О2-зависимое окисление аскорбат в растениях, водорослях и некоторых цианобактериях.[6] APX имеет высокую идентичность последовательности для цитохром с пероксидаза, который также является ферментом пероксидазы класса I. В физиологических условиях непосредственный продукт реакции, радикал монодегидроаскорбат, восстанавливается обратно до аскорбата с помощью редуктазы монодегидроаскорбат (монодегидроаскорбатредуктаза (НАДН)) фермент. В отсутствие редуктазы два монодегидроаскорбатных радикала быстро диспропорционируют до дегидроаскорбиновой кислоты и аскорбат. APX является неотъемлемым компонентом глутатион-аскорбатный цикл.[7]

Специфичность субстрата

Ферменты APX проявляют высокую специфичность к аскорбату как донору электронов, но большинство APX также окисляют другие органические субстраты, которые более характерны для пероксидаз класса III (например, пероксидаза хрена), в некоторых случаях со скоростью, сопоставимой со скоростью самого аскорбата. Это означает, что определение фермента как APX непросто, но обычно применяется, когда удельная активность для аскорбата выше, чем для других субстратов.

Механизм

Большая часть информации о механизме поступает из работы с цитозольными ферментами гороха и сои. Механизм окисления аскорбата достигается с помощью окисленного промежуточного соединения I, которое впоследствии восстанавливается субстратом в две последовательные стадии переноса одного электрона (уравнения [1] - [3], где HS = субстрат и S• = одна электронно-окисленная форма субстрата).

APX + H2О2 → Соединение I + H2O [1]
Соединение I + HS → Соединение II + S• [2]
Соединение II + HS → APX + S• + H2O [3]

В аскорбатпероксидазе Соединение I является временным (зеленым) видом и содержит железо с высокой валентностью виды (известные как феррильный гем, FeIV) и порфирин пи-катион-радикал,[8],[9] содержится в пероксидазе хрена. Соединение II содержит только феррил-гем.

Структурная информация

О структуре цитозольного APX гороха сообщалось в 1995 году.[10] Связывающее взаимодействие цитозольного APX сои с его физиологическим субстратом, аскорбатом[11],[12] и с рядом других подложек[13] также известны.

Приложения в сотовой визуализации

Оба гороха APX[14] и соя APX[15] были использованы в исследованиях электронной микроскопии для визуализации клеток.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Келли GJ, Latzko E (1979). «Растворимая аскорбатпероксидаза: обнаружение в растениях и оценка использования in vitamim C». Naturwissenschaften. 66 (12): 617–619. Дои:10.1007 / bf00405128. PMID 537642.
  2. ^ Гроден Д., Бек Е. (1979). "ЧАС2О2 разрушение аскорбат-зависимыми системами из хлоропластов ». Биохим. Биофиз. Acta. 546 (3): 426–435. Дои:10.1016/0005-2728(79)90078-1. PMID 454577.
  3. ^ Planche, LA. (1810) Бык. Фарм., 2, 578
  4. ^ Альтшул AM, Абрамс Р., Хогнесс Т.Р. (1940). «Цитохром с пероксидаза» (PDF). J. Biol. Chem. 136: 777–794.
  5. ^ Велиндер КГ (1992). «Надсемейство растительных, грибковых и бактериальных пероксидаз». Curr. Мнение. Chem. Биол. 2 (3): 388–393. Дои:10.1016 / 0959-440x (92) 90230-5.
  6. ^ Ворон Е.Л. (2003). «Понимание функционального разнообразия и субстратной специфичности пероксидаз гемма: чему мы можем научиться у аскорбатпероксидазы?». Nat. Prod. Представитель. 20 (4): 367–381. Дои:10.1039 / B210426C. PMID 12964833.
  7. ^ Noctor G, Foyer CH (июнь 1998 г.). «Аскорбат и глутатион: держать активный кислород под контролем». Анну Рев Завод Физиол Растение Мол Биол. 49: 249–279. Дои:10.1146 / annurev.arplant.49.1.249. PMID 15012235.
  8. ^ Паттерсон WR; Poulos TL; Гудин, ДБ (1995). «Идентификация катионного радикала порфирина в соединении I аскорбатпероксидазы». Биохимия. 34 (13): 4342–4345. Дои:10.1021 / bi00013a024. PMID 7703248.
  9. ^ Джонс, ДК; Dalton DA; Rosell FI; Raven, E (1998). «Пероксидазы гема I класса: характеристика аскорбатпероксидазы сои». Arch. Biochem. Биофизы. 360 (2): 173–178. Дои:10.1006 / abbi.1998.0941. PMID 9851828.
  10. ^ Паттерсон, WR; Поулос, Т.Л. (1995). «Кристаллическая структура рекомбинантной цитозольной аскорбатпероксидазы гороха». Биохимия. 34 (13): 4331–4341. Дои:10.1021 / bi00013a023. PMID 7703247.
  11. ^ Sharp, KH; Мьюис, М; Moody, PCE; Ворон, EL (2003). «Кристаллическая структура комплекса аскорбатпероксидаза-аскорбат». Nat. Struct. Биол. 10 (4): 303–307. Дои:10.1038 / nsb913. PMID 12640445.
  12. ^ Макдональд И.К .; Бадьял СК; Гамсари Л., Муди; ПК, Raven EL (2006). «Взаимодействие аскорбатпероксидазы с субстратами: механистический и структурный анализ». Биохимия. 45 (25): 7808–7817. Дои:10.1021 / bi0606849. PMID 16784232.
  13. ^ Gumiero, AG; Мерфи, EJ; Меткалф, CL; Moody, PCE; Ворон, EL (2010). «Анализ взаимодействий связывания субстрата в ферментах пероксидазы гема: структурная перспектива». Arch. Biochem. Биофизы. 500 (1): 13–20. Дои:10.1016 / j.abb.2010.02.015. PMID 20206594.
  14. ^ Martell JD, Deerinck TJ, Sancak Y, Poulos TL, Mootha VK, Sosinsky GE, Ellisman MH, Ting AY (2012). «Разработана аскорбатпероксидаза как генетически кодируемый репортер для электронной микроскопии». Природа Биотехнологии. 30 (11): 1143–1148. Дои:10.1038 / nbt.2375. ЧВК 3699407. PMID 23086203.
  15. ^ Лам С.С., Мартелл Д.Д., Камер К.Дж., Деринк Т.Дж., Эллисман М.Х., Мутха В.К., Тинг А.Ю. (2015). «Направленная эволюция APEX2 для электронной микроскопии и бесконтактной маркировки». Природные методы. 12 (1): 51–54. Дои:10.1038 / nmeth.3179. ЧВК 4296904. PMID 25419960.

внешняя ссылка