WikiDer > Хордовые геномики
Хордовые геномики это исследование эволюции хордовый клады на основе сравнения геномы из нескольких виды внутри клады. Поле зависит от данных всего генома (всего Последовательность ДНК) организмов. Он использует сравнения синтения блоки транслокация хромосомы, и другие геномные перестройки для определения эволюционной истории клады и реконструкции генома вида-основателя.
Результаты
Филогения
Глубокое ветвление хордовых филогения был уточнен хордовой геномикой.[1] Хордовые геномики демонстрируют, что Ланцетник самые базальные живые клады в пределах хордовых, в то время как Оболочки являются сестры клада Краниата.
Synteny
Сравнение геномов ланцетника Branchiostoma floridae, а рыбы, то курица Gallus gallus, и люди Homo sapiens выявили обширные макро-синтения с небольшой микросинтенией или без нее. То есть по всей кладе хордовых одни и те же гены находятся в кластерах рядом друг с другом, хотя порядок генов в кластерах был перетасован.[2] В геноме человека имеется 135 идентифицируемых сегментов, которые сохраняют синтению с предковыми хордовыми. кариотип.
Анализ синтении показывает, что у последнего общего предка хордовых было 17 хромосом.[3]
Дублирование генома
Многочисленные экспериментальные данные убедительно свидетельствуют о том, что дважды в линии, ведущей к костистость рыбы был продублирован геном предковых хордовых.[4][5][6][7] Сравнение геномов ланцетника Branchiostoma floridae, оболочники Циона кишечника и Oikopleura dioica, то минога Петромизон маринус, то рыбы Fugu rubripes и Gasterosteus aculeatus, то курица Gallus gallus, и человек Homo sapiens подтвердил, что два полногеномные дупликации произошло в ранней истории Позвоночные клады.[8]
использованная литература
- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция хордового кариотипа». Николас Х. Патнэм, и другие. Природа 453 1064-1071, (2008)
- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция хордового кариотипа». Николас Х. Патнэм, и другие. Природа 453 1064-1071, (2008)
- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция хордового кариотипа». Николас Х. Патнэм, и другие. Природа 453 1064-1071, (2008)
- ^ «Анализ генов миноги и миксины показывает сложную историю дупликаций генов во время ранней эволюции позвоночных». Х. Эккрива, и другие., Мол. Биол. Evol. 19, 1440-1450 (2002)
- ^ "Дупликация генома у телесоста рыб Тетраодон нигровиридис выявляет ранний протокариотип позвоночных ". O. Jaillon, и другие., Природа 431, 946-957 (2004)
- ^ «Новые доказательства полногеномных дупликаций в происхождении позвоночных с использованием набора генов амфиоксуса и завершенных геномов животных». Г. Панопулу, и другие. Genome Res. 13, 1056-1066 (2003)
- ^ "Фугу анализ генома дает доказательства дупликации всего генома на ранних этапах эволюции рыб с лучевыми плавниками ». А. Кристоффелс, и другие. Мол. Биол. Evol. 21, 1146-1151 (2004)
- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция хордового кариотипа». Николас Х. Патнэм, и другие. Природа 453 1064-1071, (2008)
 | Эта хордовый-связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |
 | Эта генетика статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |