WikiDer > CompuCell3D
CompuCell3D это трехмерное программное обеспечение C ++ среда решения проблем для моделирования проблем биосложности, интеграции нескольких математических моделей [морфогенеза]. К ним относятся сотовая модель Поттса (CPM), которые могут моделировать кластеризацию клеток, рост, деление, смерть, адгезию, а также ограничения объема и площади поверхности; а также решатели уравнений в частных производных для моделирования реакция – диффузия внешних химических полей и автоматов клеточного типа для дифференциация. За счет интеграции этих моделей CompuCell3D позволяет моделировать клеточные реакции на внешние химические поля, такие как секреция или рассасывание, и такие ответы, как хемотаксис и гаптотаксис.
CompuCell3D способствует экспериментированию и тестированию биологических моделей, предоставляя гибкий и расширяемый пакет с множеством различных уровней контроля. Высокоуровневое управление возможно через CompuCellPlayer, интерактивный графический интерфейс, основанный на Qt потоки, которые выполняются параллельно с вычислительным сервером. Такие функции, как масштабирование, вращение, воспроизведение и приостановка моделирования, установка цветов и просмотр поперечных сечений, доступны через проигрыватель с образцом снимка экрана, показанным ниже.
Расширение серверной части возможно с помощью XML на основе предметно-ориентированный язык Biologo, который после лексического анализа и генерации прозрачно преобразуется в расширения C ++, которые можно компилировать и динамически загружать во время выполнения. Бэкэнд использует объектно-ориентированный шаблоны проектирования которые способствуют расширяемости, уменьшая связь между независимо работающими модулями. Дополнительные функции могут быть инкапсулированы с помощью подключаемых модулей, которые динамически загружаются во время выполнения через ссылку на файл конфигурации XML.
CompuCell3D может моделировать несколько различных явлений, в том числе развитие птичьих конечностей, in vitro развитие капилляров, сортировка клеток на основе адгезии, Dictyostelium discoideum, и потоки жидкости. Платформа доступна из Веб-сайт CompuCell3D
 | Эта научное программное обеспечение статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |