WikiDer > Белок CsrA

CsrA protein
CsrA
PDB 1vpz EBI.jpg
Димер CsrA из кишечная палочка.[1]
Идентификаторы
СимволCsrA
PfamPF02599
ИнтерПроIPR003751

Регулятор накопления углерода A (CsrA) является РНК привязка белок. Гомологи CsrA обнаружены у большинства видов бактерий, в псевдомонады они называются репрессор вторичных метаболитов (RsmA и RsmE).[2] Белки CsrA обычно связываются с Последовательность Шайна-Далгарно из информационные РНК и либо подавляют трансляцию, либо способствуют распаду мРНК.[3]

CsrA оказывает регулирующее влияние на гликоген биосинтез и катаболизм, гликолиз,[3] биопленка формирование[4] и проверка кворума.[5]

Взаимодействия

Консенсусная вторичная структура и первичная последовательность для мишеней связывающего РНК CsrA белка.

Белок CsrA связывается с Стебель-петля Мотив РНК. Способности белка ингибировать трансляцию связанных мРНК можно противодействовать экспрессией таких мРНК, как CsrB, CsrC, РсмЗ, RsmY и RsmX которые содержат несколько копий мотива РНК. Эти РНК изолируют CsrA, что делает возможной трансляцию ранее ингибированных связанных мРНК. Исследование, посвященное специфическому связыванию CsrA в Сальмонелла транскриптом идентифицировал 467 сайтов связывания.[6]

Рекомендации

  1. ^ Gutiérrez, P; Ли, У; Осборн, MJ; Померанцева, Е; Лю, Q; Геринг, К. (май 2005 г.). «Структура раствора белка регулятора накопления углерода CsrA из Escherichia coli». Журнал бактериологии. 187 (10): 3496–501. Дои:10.1128 / JB.187.10.3496-3501.2005. ЧВК 1112004. PMID 15866937.
  2. ^ Тиммерманс, Дж; Ван Мелдерен, Л. (сентябрь 2010 г.). «Посттранскрипционная глобальная регуляция с помощью CsrA у бактерий». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 67 (17): 2897–908. Дои:10.1007 / s00018-010-0381-z. PMID 20446015. S2CID 23366724.
  3. ^ а б Лю, MY; Gui, G; Wei, B; Престон Дж. Ф., 3-й; Окфорд, L; Юксель, У; Giedroc, DP; Ромео, Т. (11 июля 1997 г.). «Молекула РНК CsrB связывается с глобальным регуляторным белком CsrA и противодействует его активности в Escherichia coli». Журнал биологической химии. 272 (28): 17502–10. Дои:10.1074 / jbc.272.28.17502. PMID 9211896.
  4. ^ Джексон, DW; Сузуки, К; Окфорд, L; Симецка, JW; Hart, ME; Ромео, Т. (январь 2002 г.). «Формирование и распространение биопленок под действием глобального регулятора CsrA Escherichia coli». Журнал бактериологии. 184 (1): 290–301. Дои:10.1128 / jb.184.1.290-301.2002. ЧВК 134780. PMID 11741870.
  5. ^ Sonnleitner, E; Ромео, А; Bläsi, U (апрель 2012 г.). «Малые регуляторные РНК в Pseudomonas aeruginosa». РНК Биология. 9 (4): 364–71. Дои:10.4161 / rna.19231. PMID 22336763.
  6. ^ Холмквист Э., Райт П.Р., Ли Л., Бишлер Т., Барквист Л., Рейнхардт Р., Бекофен Р., Фогель Дж. (2016). «Глобальные паттерны распознавания РНК посттранскрипционных регуляторов Hfq и CsrA, выявленные с помощью УФ-сшивания in vivo». EMBO J. 35 (9): 991–1011. Дои:10.15252 / embj.201593360. ЧВК 5207318. PMID 27044921.