WikiDer > DDX1

DDX1
DDX1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDDX1, DBP-RB, UKVH5d, DEAD / H-box геликаза 1, DEAD-box геликаза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 601257 MGI: 2144727 ГомолоГен: 3627 Генные карты: DDX1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение DDX1
Геномное расположение DDX1
Группа2п24.3Начните15,591,178 бп[1]
Конец15,631,111 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DDX1 201241 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004939

NM_134040

RefSeq (белок)

NP_004930

NP_598801

Расположение (UCSC)Chr 2: 15.59 - 15.63 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX1 является фермент что у людей кодируется DDX1 ген.[4][5]

Функция

Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом. Основываясь на паттернах их распространения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также росте и делении клеток. Этот ген кодирует DEAD-бокс-белок неизвестной функции. Он показывает высокие уровни транскрипции в 2 линиях клеток ретинобластомы и в тканях нейроэктодермального происхождения.[5]

Взаимодействия

DDX1 был показан взаимодействовать с участием ГНРПК.[6]Также было предварительно показано, что DDX1 взаимодействует с hCLE / C14orf166 / RTRAF и HSPC117 в комплексе связывания кэпа, который активирует трансляцию мРНК. [7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000079785 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ Шмид С.Р., Линдер П. (февраль 1992 г.). "Семейство белков D-E-A-D предполагаемых РНК-геликаз". Молекулярная микробиология. 6 (3): 283–91. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01470.x. PMID 1552844. S2CID 45727289.
  5. ^ а б «Ген Entrez: DDX1 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) полипептид 1».
  6. ^ Чен ХК, Лин В.Ч., Цай Ю.Г., Ли СК, Чанг С.Дж. (октябрь 2002 г.). «РНК-геликаза DDX1, взаимодействующая с поли (A) РНК и гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином K» (PDF). Журнал биологической химии. 277 (43): 40403–9. Дои:10.1074 / jbc.M206981200. PMID 12183465. S2CID 25252628.
  7. ^ Чо WJ, Юн WJ, Moon CH, Cha SJ, Song H, Cho HR, Jang SJ, Chung DK, Jeong CS, Park JW (ноябрь 2002 г.). «Молекулярное клонирование нового шапероноподобного белка, индуцированного рабдовирусной инфекцией, с последовательностью, сходной с семейством бактериальных внеклеточных белков, связывающих растворенные вещества 5». Журнал биологической химии. 277 (44): 41489–96. Дои:10.1074 / jbc.M207104200. PMID 12183466.

дальнейшее чтение