WikiDer > ДЭК (ген)

DEK (gene)
DEK
Протеин DEK PDB 1q1v.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDEK, D6S231E, протоонкоген ДЭК
Внешние идентификаторыOMIM: 125264 MGI: 1926209 ГомолоГен: 2593 Генные карты: DEK
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение DEK
Геномное расположение DEK
Группа6p22.3Начните18,223,860 бп[1]
Конец18,264,548 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DEK 200934 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001134709
NM_003472

NM_025900

RefSeq (белок)

NP_001128181
NP_003463

NP_080176

Расположение (UCSC)Chr 6: 18.22 - 18.26 МбChr 13: 47.08 - 47.11 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Человек DEK ген кодирует DEK белок.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок с одним доменом SAP. Белок связывается с крестообразными и надспиральными ДНК и индуцирует положительные суперспирали в замкнутую кольцевую ДНК. Он также участвует в выборе места монтажа во время мРНК обработка. Хромосомные аберрации, затрагивающие эту область, увеличивают экспрессию этого гена, и наличие антител против этого белка связаны с различными заболеваниями.[6]

Взаимодействия

DEK взаимодействует с участием TFAP2A.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124795 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021377 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Йегле М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6; 9), связанная с конкретным подтипом острого миелоидного лейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и к экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can». Мол. Cell. Биол. 12 (4): 1687–97. Дои:10.1128 / mcb.12.4.1687. ЧВК 369612. PMID 1549122.
  6. ^ а б «Ген Entrez: онкоген DEK DEK (связывание с ДНК)».
  7. ^ Кампильос М., Гарсия М.А., Вальдивьесо Ф., Васкес Дж. (Март 2003 г.). «Активация транскрипции AP-2alpha модулируется онкогеном DEK». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (5): 1571–5. Дои:10.1093 / нар / gkg247. ЧВК 149840. PMID 12595566.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Human Protein DEK