WikiDer > Док9

Dock9
DOCK9
Белок DOCK9 PDB 1wg7.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDOCK9, ZIZ1, ZIZIMIN1, Dock9, выделитель цитокинеза 9
Внешние идентификаторыOMIM: 607325 MGI: 106321 ГомолоГен: 41026 Генные карты: DOCK9
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человек)[1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение DOCK9
Геномное расположение DOCK9
Группа13q32.3Начинать98,793,429 бп[1]
Конец99,086,625 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DOCK9 212538 в формате fs.png

PBB GE DOCK9 215041 s в формате fs.png

PBB GE DOCK9 215238 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001081039
NM_001128307
NM_001128308
NM_134074
NM_001347596

RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr 13: 98.79 - 99.09 МбChr 14: 121,54 - 121,8 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Док9 (Dнаставник ож cytokинес.9), также известный как Зизимин1, является большим (~ 230 кДа) белок участвует в внутриклеточный сети сигнализации.[5] Это член подсемейства DOCK-D ДОК семья факторы обмена гуаниновых нуклеотидов которые действуют как активаторы малых G белки. Dock9 активирует малый белок G Cdc42.

Открытие

Dock9 был обнаружен с помощью аффинити протеомный подход, разработанный для идентификации новых активаторов малого G-белка Cdc42 в фибробласты.[6] Последующий северное пятно Анализ показал, что Dock9 выражается в основном в мозг, сердце, скелетные мышцы, почка, плацента и легкое. Более низкие уровни были обнаружены в двоеточие, вилочковая железа, печень, тонкий кишечник И в лейкоциты из периферической крови.

Структура и функции

Dock9 имеет аналогичную структуру из двух ядер домены (известный как DHR1 и DHR2), которые используются всеми членами семейства DOCK. В C-терминал Домен DHR2 функционирует как атипичный домен GEF для малых G-белков (см. Dock180: структура и функции), а домен DHR1, как известно, в некоторых белках подсемейства DOCK-A / B / C участвует в их привлечении к плазматическая мембрана. В отличие от белков DOCK-A / B / C белки DOCK-D (включая Dock9) содержат N-концевой домен гомологии плекстрина (PH) это опосредует их привлечение к мембране.[7] Dock9 вместе с другими членами подсемейства DOCK-C / D может активировать Cdc42 in vitro и in vivo через свой домен DHR2.[6] Однако Dock9 принимает автоматическое запрещение, которое маскирует домен DHR2 в его состоянии покоя.[7] Механизм, с помощью которого преодолевается это аутоингибирование, все еще неясен, хотя в некоторых других белках DOCK, которые также подвергаются аутоингибированию, требуется взаимодействие с адаптерные белки Такие как ELMO.[8][9] Dock9 также сообщил димериз, в условиях покоя, через его домены DHR2, и это исследование предполагает, что другие белки семейства DOCK также могут вести себя таким же образом.[10] Недавний анализ хромосомный регион, связанный с восприимчивостью к биполярное расстройство показал, что однонуклеотидный полиморфизм в DOCK9 ген способствуют риску и серьезности этого состояния.[11]


Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000088387 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025558 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ "Entrez Gene: DOCK9, посвященный цитокинезу 9".
  6. ^ а б Меллер Н., Ирани-Тегерани М., Киоссес В.Б. и др. (Сентябрь 2002 г.). «Зизимин1, новый активатор Cdc42, обнаруживает новый домен GEF для белков Rho». Nat. Cell Biol. 4 (9): 639–47. Дои:10.1038 / ncb835. PMID 12172552.
  7. ^ а б Меллер Н., Уэстбрук М.Дж., Шеннон Д.Д. и др. (Январь 2008 г.). «Функция N-конца зизимина-1: аутоингибирование и нацеливание на мембрану». Biochem. J. 409 (2): 525–33. Дои:10.1042 / BJ20071263. ЧВК 2740492. PMID 17935486.
  8. ^ Лу М., Кинчен Дж. М., Россман К. Л. и др. (Август 2004 г.). «Домен PH ELMO функционирует в транс, чтобы регулировать активацию Rac через Dock180». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (8): 756–62. Дои:10.1038 / nsmb800. PMID 15247908.
  9. ^ Лу М., Кинчен Дж. М., Россман К. Л. и др. (Февраль 2005 г.). «Модель стерического ингибирования для регуляции обмена нуклеотидов через семейство Dock180 GEF». Curr. Биол. 15 (4): 371–77. Дои:10.1016 / j.cub.2005.01.050. PMID 15723800.
  10. ^ Меллер Н., Ирани-Тегерани М., Ратников Б.И. и др. (Сентябрь 2004 г.). «Новый фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Cdc42, зизимин1, димеризуется через Cdc42-связывающий домен CZH2». J. Biol. Chem. 279 (36): 37470–76. Дои:10.1074 / jbc.M404535200. PMID 15247287.
  11. ^ Detera-Wadleigh SD, Liu CY, Maheshwari M, et al. (Октябрь 2007 г.). «Вариация последовательности в DOCK9 и неоднородность при биполярном расстройстве». Психиатр. Genet. 17 (5): 274–86. Дои:10.1097 / YPG.0b013e328133f352. PMID 17728666.

дальнейшее чтение