WikiDer > Цифровая автоматизированная система идентификации

Digital Automated Identification System
Цифровая автоматизированная система идентификации (DAISY)
Разработчики)Марк А. О'Нил
Стабильный выпуск
2.1.0 / 1 февраля 2016 г.; 4 года назад (2016-02-01)
Написано вC[нужна цитата]
Операционная системаLinux
ПлатформаIA-32 x86-64 РУКА
Доступно ванглийский
ЛицензияПроприетарный коммерческое программное обеспечение
Интернет сайтwww.tumblingdice.co.Великобритания/ ромашка

Цифровая автоматизированная система идентификации (DAISY) - это автоматическая идентификация видов система оптимизирована для быстрого скрининга беспозвоночных (например, насекомых) неспециалистами (например, паратаксономисты).

Он был разработан доктором Марк О'Нил в середине 1990-х гг. Развитие поддерживалось финансированием Дарвиновская инициатива в 1997 г.[1] и BBSRC.[2] В права интеллектуальной собственности были приобретены компанией О'Нила, Tumbling Dice Ltd, в феврале 2000 г.[3] по окончании гранта финансируется Дарвинский проект. Система претерпела дальнейшее развитие, в результате чего был создан образец, доступный в сети и способный работать с группами практически в реальном времени (например, ястребиная моль) которые содержат несколько сотен таксоны. На серверном оборудовании ПК среднего и высокого уровня (например, блейд-сервер) идентификация возможна менее чем за секунду для группы из 300 таксонов. Распараллеливание критических кодов классификатора DAISY (с использованием либо FPGA технология или общего назначения GPU технологии программирования, такие как CUDA) даст прирост производительности на порядок. Это означает, что DAISY можно использовать для идентификации в реальном времени внутри групп, содержащих тысячи таксонов (например, настоящие мухи).

Результаты DAISY для отдельных таксонов насекомых
таксонтип изображенияструктураобучающие изображенияразновидностьуспех(%)
Белиз СфингидыRGBкрыло7055897
Ксилофаны sp.RGBкрыло5433099
Паразитические осымононуклеозкрыло5594795
Бабочки ВеликобританииRGBкрыло8185798
Макро-мотыльки ВеликобританииRGBкрыло7443798
ГусеницыRGBголова91793
ГусеницыRGBтело5081099
Вредители мягких фруктовRGBтело26342391
Результаты DAISY для других задач классификации изображений
описаниетип изображенияструктураобучающие изображенияклассыуспех(%)
Консервные банкиRGBметка315100
Промышленные объектыRGBнеоткрытый объект15514100
Фораминиферы тестыRGBнеоткрытый объект198895
Пыльцевые зернаRGBнеоткрытый объект66011299
Паукимононуклеозгениталии102691
Человеческие лицамононуклеознеприкрытое лицо4004199

DAISY использовался в нескольких исследовательских проектах О'Нила.[4] и другие, а также в научно-популярных статьях на телевидении и в журналах. Проект также был предметом недавней статьи в Наука.[5]

В 2011 году первая установка DAISY с возможностью масштабирования до сотен таксонов была установлена ​​в Музей естественной истории В Лондоне. Этот сервер предлагал оба VNC и веб-сервис на основе интерфейсов и смогла выгрузить вычислительные операции с интенсивным сопоставлением с образцом на NVIDIA GPU запрограммирован с использованием CUDA. Эта установка была способна идентифицировать виды с учетом набора данных из 300+ таксонов менее чем за секунду в среде с несколькими пользователями.

Совсем недавно под эгидой Innovate UK финансирования, DAISY был значительно изменен для удовлетворения потребностей в добывающих операциях в нефтегазовом секторе, в частности биостратиграфия. Полученная в результате система GeoDAISY представляет собой значительный технологический прогресс. Он способен глубокое обучение, инкапсуляция знаний, на основе шаблонов сбор данных и (на основе изображений) поиск контента и может эффективно обрабатывать обучающие наборы, состоящие из миллионов шаблонов, на стандартном оборудовании, используя сочетание интеллектуального кэширования данных и OpenMP. Более подробная информация о GeoDAISY и обоснование его разработки доступны в виде официальных документов на сайте Кувыркающиеся кости LinkedIn страница.

  • Показаны примеры изображений, классифицированных с помощью DAISY

Смотрите также

  • Leafsnap[6]
  • iPflanzen[7]
  • PlantNet[8]
  • Растения (программное обеспечение)[9]
  • Плантатор[10]
  • NatureGate[11]

Рекомендации

  1. ^ «Автоматизация идентификации насекомых для инвентаризации биоразнообразия Коста-Рики». Дарвиновская инициатива. Defra. Получено 15 декабря 2010.
  2. ^ "Обзор ромашки" (PDF). Компания Tumbling Dice Ltd. 2007 г.. Получено 14 декабря 2010.
  3. ^ «Ромашка». Кувыркающиеся кости. Получено 14 декабря 2010.
  4. ^ Уотсон, Анна Т.; О'Нил, Марк А.; Китчинг, Ян Дж. (2003). «Качественное исследование, посвященное автоматизированной идентификации живых макролепидоптер с использованием системы цифровой автоматической идентификации (DAISY)». Систематика и биоразнообразие. 1: 287–300. Дои:10.1017 / S1477200003001208.
  5. ^ Рид, Сара (2010). "Толкая DAISY". Наука. 328: 1628–1629. Дои:10.1126 / science.328.5986.1628. PMID 20576867.
  6. ^ Leafsnap
  7. ^ iPflanzen
  8. ^ PlantNet
  9. ^ Растения
  10. ^ Плантатор
  11. ^ NatureGate

внешняя ссылка