WikiDer > ERGIC2
Белок 2 промежуточного компартмента эндоплазматического ретикулума-Гольджи (ERGIC2) [5] это ген, расположенный у человека хромосома 12p11. Кодирует белок из 377 аминокислотных остатков. Белок ERGIC2 также известен как PTX1, CDA14 или Erv41.
Биологическая функция белка ERGIC2 неизвестна, хотя первоначально он был идентифицирован как кандидат в супрессор опухоли рака простаты.[6] и было показано, что он вызывает остановку роста и старение клеток, подавляет образование колоний в мягком агаре и снижает инвазивный потенциал клеточной линии рака простаты человека (клетки PC-3).[7] В настоящее время считается, что это молекула-шаперон, участвующая в белковом торговля людьми между промежуточным компартментом эндоплазматической сети и Гольджи (ERGIC) и Гольджи. Белок содержит два гидрофобных трансмембранных домена, которые помогают закрепить молекулу на мембране ER, так что его большой люминальный домен ориентирован внутри просвета ER, а N- и C-концы обращены к цитозоль. ERGIC2 образует комплекс с двумя другими белками, ERGIC3 и ERGIC32, приводя к челноку для транспортировки белков между ER и Golgi.[8] Было показано, что он взаимодействует с рядом белков, таких как бета-амилоид,[9] фактор элонгации белка 1альфа,[10] и отоферлин.[11] Следовательно, он может играть важную роль в клеточных функциях, помимо того, что он является компонентом челнока для транспортировки белков. Недавно было сообщено о вариантном транскрипте ERGIC2.[12] Он имеет делецию четырех оснований на стыке экзонов 8 и 9, что приводит к мутации со сдвигом рамки считывания после кодона № 189. Вариант транскрипта кодирует усеченный белок из 215 остатков, который теряет 45% люминального домена и трансмембранного домена около С-конца. Это эффективно отменяет его функцию переносчика белка. Похожий вариант встречается и у броненосцев. Так что это не случайная мутация. Функция этого усеченного белка неизвестна.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000087502 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030304 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Энтрез Джин: ERGIC2 ERGIC и Гольджи 2».
- ^ Квок SC, Лю X, Даскал I (2001). «Молекулярное клонирование, экспрессия, локализация и организация гена PTX1, ядерного белка человека, который подавляется при раке простаты». ДНК клетки биол. 20 (6): 349–57. Дои:10.1089/10445490152122460. PMID 11445006.
- ^ Лю X, Даскал I, Квок СК (2003). «Влияние экспрессии PTX1 на рост и онкогенность линии клеток рака предстательной железы PC-3». ДНК клетки биол. 22 (7): 469–74. Дои:10.1089/104454903322247343. PMID 12932305.
- ^ Бреуза Л., Хальбайзен Р., Йено П. и др. (2004). «Протеомика мембран эндоплазматического ретикулума-промежуточного компартмента Гольджи (ERGIC) из клеток HepG2, обработанных брефельдином А, позволяет идентифицировать ERGIC-32, новый циклический белок, который взаимодействует с Erv46 человека». J. Biol. Chem. 279 (45): 47242–53. Дои:10.1074 / jbc.M406644200. PMID 15308636.
- ^ Нельсон Т.Дж., Алкон Д.Л. (2007). «Защита от апоптоза, вызванного бета-амилоидом, с помощью пептидов, взаимодействующих с бета-амилоидом». J Biol Chem. 282 (43): 31238–49. Дои:10.1074 / jbc.M705558200. PMID 17761669.
- ^ Ян Ю.Ф., Чжоу М.Ю., Фан Ц.И., Чен С.Ф., Лю ПК, Лю С.К., Цзэн Т.Л. (2008). «Возможное взаимодействие CDA14 и фактора элонгации белка 1альфа». Biochim Biophys Acta. 1784 (2): 312–8. Дои:10.1016 / j.bbapap.2007.10.006. PMID 17980171.
- ^ Зак М., Брес А., Брандт Н., Франц С., Рут П., Пфистер М., Книппер М., Блин Н. (2012). «Ergic2, мозговой специфический взаимодействующий партнер отоферлина». Cell Physiol Biochem. 29 (5–6): 941–8. Дои:10.1159/000188338. PMID 22613993.
- ^ Квок СК, Кумар С., Дай Г. (2014). «Характеристика варианта транскрипта ERGIC2». ДНК клетки биол. 33 (2): 73–78. Дои:10.1089 / dna.2013.2225. PMID 24303950.
дальнейшее чтение
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Kwok SC, Лю X, Mangel P, Daskal I (2006). «Слитый белок PTX1 (ERGIC2) -VP22 активирует бета-интерферон в клеточной линии PC-3 рака простаты». ДНК клетки биол. 25 (9): 523–9. Дои:10.1089 / dna.2006.25.523. PMID 16989575.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |