WikiDer > GntR-подобные бактериальные факторы транскрипции
| Бактериальные регуляторные белки, семейство gntR | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура раствора стрептмикового репрессора трара | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | GntR | ||||||||
| Pfam | PF00392 | ||||||||
| Pfam клан | CL0123 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000524 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00042 | ||||||||
| SCOP2 | 1e2x / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии GntR-подобные бактериальные факторы транскрипции площадь семья из факторы транскрипции.
Много бактериальный регулирование транскрипции белки связывать ДНК через спираль-поворот-спираль (HTH) мотив, который можно разделить на подсемейства на основе последовательность сходства. Семейство HTH GntR состоит из множества членов, распределенных среди различных бактериальный группы, регулирующие различные биологические процессы. Он был назван GntR в честь Bacillus subtilis репрессор из глюконат оперон.[1] Члены семьи включают GntR, HutC, KorA, NtaR, FadR, ExuR, FarR, DgoR, PhnF и PlmA.[2] В Кристальная структура белка FadR.[3] В общем, эти белки содержат ДНК-связывающий HTH домен на N-конец, и эффектор-обвязка или олигомеризация домен в C-конец. ДНК-связывающий домен хорошо консервативен в структура для всего семейства GntR, состоящего из 3-спирального сердечника пучка с малым бета-лист (крыло); ГНТР крылатая спираль структура аналогична найденной в нескольких других транскрипционный семейства регуляторов. Области вне ДНК-связывающего домена более вариабельны и, следовательно, используются для определения подсемейств GntR.[4]
Рекомендации
- ^ Хейдон диджей, гость младший (апрель 1991). «Новое семейство бактериальных регуляторных белков». FEMS Microbiol. Латыш. 63 (2–3): 291–5. Дои:10.1016 / 0378-1097 (91) 90101-ф. PMID 2060763.
- ^ Ли, Мартин Х .; Шерер, Майкл; Ригали, Себастьян; Голден, Джеймс У. (1 августа 2003 г.). «PlmA, новый член семейства GntR, выполняет функции поддержания плазмиды в штамме PCC 7120 Anabaena sp.». Журнал бактериологии. 185 (15): 4315–4325. Дои:10.1128 / jb.185.15.4315-4325.2003. ISSN 0021-9193. ЧВК 165748. PMID 12867439.
- ^ van Aalten DM, DiRusso CC, Knudsen J, Wierenga RK (октябрь 2000 г.). «Кристаллическая структура FadR, фактора транскрипции, чувствительного к жирным кислотам, с новой складкой связывания ацилкофермента А». EMBO J. 19 (19): 5167–77. Дои:10.1093 / emboj / 19.19.5167. ЧВК 302096. PMID 11013219.
- ^ Ригали С., Деруо А., Джаннотта Ф., Дусарт Дж. (Апрель 2002 г.). «Подразделение семейства бактериальных регуляторов GntR спираль-поворот-спираль в подсемейства FadR, HutC, MocR и YtrA». J. Biol. Chem. 277 (15): 12507–15. Дои:10.1074 / jbc.M110968200. PMID 11756427.