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Inverted repeat

EIN invertierte Wiederholung (abgekürzt als IR) ist ein Reihenfolge von Nukleotide die stromabwärts (weiter in der DNA) auf dem komplementär Kette wird in die entgegengesetzte Richtung wiederholt.[1] Diese Downstream-Sequenz heißt umgekehrtes Komplement. Die Nukleotide zwischen der Anfangssequenz und dem umgekehrtes Komplement können sich in der Anzahl unterscheiden. Wenn es keine dazwischenliegenden Nukleotide gibt, heißt es a palindromische Sequenz. Ein Beispiel für eine invertierte Wiederholung ist: 5'--TTACGnnnnnnCGTAA--3'. Die großgeschriebenen Nukleotide sind zueinander komplementär.

Von solchen Sequenzen wiederholen kann sich auf wenige Nukleotide oder auf eine vollständige Gen. Sie können über das Chromosom sehr verteilt sein oder direkt hintereinander liegen: dies nennt man a Tandemfolge.[ein] Eine Tandemsequenz kann in . sein Eukaryoten tausendfach über das Genom verstreut.[2] Wiederholungssequenzen von etwa 10-100 Basenpaaren heißen Mini-Satelliten, aber kürzere Wiederholungssequenzen von 2-4 Basenpaaren heißen Mikrosatelliten. Obwohl die meisten Wiederholungssequenzen in der Zentromer und der Telomer auftreten, ein Großteil befindet sich in der nichtkodierende DNA.[3]

Invertierte Wiederholungen kommen in Eukaryoten, Prokaryoten und sogar im Genom von vor Chloroplasten und Mitochondrien. Sie erfüllen eine Reihe wichtiger biologischer Funktionen. Sie definieren die Grenzen von Transposons und geben Sie Regionen an, die selbstkomplementäre Basenpaarung. Diese Aspekte spielen eine wichtige Rolle für die Stabilität des Genoms und tragen zur Zellentwicklung, genetische Vielfalt[4] und Abneigung gegen Mutationen.[5]

Beispiele

Ein weiteres Beispiel für eine invertierte Wiederholung ist:

5’--CCATGnnnnnnCATGG--3’
3’--GGTACnnnnnnGTACC--5’

Eine invertierte Wiederholung sollte nicht mit a . verwechselt werden sofortige Wiederholung, bei der die wiederholte Reihenfolge nicht umgekehrt wird:

5’--TTACGnnnnnnTTACG--3’
3’--AATGCnnnnnnAATGC--5’

Siehe auch