WikiDer > Ku80

Ku80
XRCC5
Белок XRCC5 PDB 1jeq.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыXRCC5, KARP-1, KARP1, KU80, KUB2, Ku86, NFIV, Ku80, исправление с помощью рентгеновских лучей, дополняющее дефектную репарацию в клетках китайского хомячка 5, перекрестное восстановление с помощью рентгеновских лучей, дополняющее 5
Внешние идентификаторыOMIM: 194364 MGI: 104517 ГомолоГен: 40681 Генные карты: XRCC5
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение XRCC5
Геномное расположение XRCC5
Группа2q35Начните216,107,464 бп[1]
Конец216,206,303 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE XRCC5 208642 s в формате fs.png

PBB GE XRCC5 208643 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7520

22596

Ансамбль

ENSG00000079246

ENSMUSG00000026187

UniProt

P13010

P27641

RefSeq (мРНК)

NM_021141

NM_009533
NM_001357519
NM_001357520

RefSeq (белок)

NP_066964

NP_033559
NP_001344448
NP_001344449

Расположение (UCSC)Chr 2: 216.11 - 216.21 МбChr 1: 72.31 - 72.39 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ku80 это белок что у людей кодируется XRCC5 ген.[5] Вместе, Ku70 и Ku80 составляют Ку гетеродимер, который привязан к ДНК двухниточный разрыв заканчивается и требуется для негомологичное соединение концов (NHEJ) путь Ремонт ДНК. Это также необходимо для V (D) J рекомбинация, который использует путь NHEJ для обеспечения разнообразия антигенов у млекопитающих. иммунная система.

В дополнение к своей роли в NHEJ, Ku требуется для теломер сохранение длины и подавление субтеломерного гена.[6]

Ку был первоначально идентифицирован, когда пациенты с системная красная волчанка были обнаружены высокие уровни аутоантитела к белку.[7]

Номенклатура

Ku80 упоминается под несколькими именами, включая:

  • Аутоантигенный белок р80 волчанки Ku
  • АТФ-зависимая ДНК-геликаза 2 субъединица 2
  • Восстановление с помощью рентгеновских лучей в дополнение к восстановлению дефектов в клетках китайского хомячка 5
  • Рентгеноремонтный кросс-комплемент 5 (XRCC5)

Эпигенетическая репрессия

Уровень экспрессии белка Ku80 может быть подавлен с помощью эпигенетический гиперметилирование промоутер регион гена XRCC5 который кодирует Ku80.[8] При исследовании 87 подобранных пар первичных опухолей немелкоклеточный рак легкого и соседняя нормальная легочная ткань, 25% опухолей имели потеря гетерозиготности в локусе XRCC5 и аналогичный процент опухолей имели гиперметилирование промоторной области XRCC5. Низкая экспрессия белка Ku80 была значительно связана с низкой экспрессией мРНК и с XRCC5 гиперметилирование промотора, но не с LOH гена.[8]

Старение

Мутанты мыши с гомозиготными дефектами Ku80 обнаруживают раннее начало старение.[9][10] Мыши Ku80 (- / -) проявляют патологию, связанную со старением (остеопения, атрофическая кожа, гепатоцеллюлярная дегенерация, гепатоцеллюлярные включения, очаги гиперпластичности печени и возрастная смертность). Кроме того, мыши Ku80 (- / -) демонстрируют сильно уменьшенную продолжительность жизни и размер. Потеря только одного аллеля Ku80 у Ku (- / +) гетерозиготных мышей вызывает ускоренное старение скелетных мышц, хотя постнатальный рост является нормальным.[11] Анализ уровня белка Ku80 у человека, коровы и мыши показал, что уровни Ku80 сильно различаются между видами, и что эти уровни сильно коррелируют с долголетие вида.[12] Эти результаты предполагают, что путь репарации ДНК NHEJ, опосредованный Ku80, играет значительную роль в репарации двухцепочечных разрывов, которые в противном случае вызывали бы раннее старение (см. Теория повреждений ДНК старения).

Клиническое значение

Редкий микроспутник полиморфизм в этом гене связан с раком у пациентов различной радиочувствительность.[5]

Дефицит при раке

Дефицит экспрессии гена репарации ДНК увеличивает риск рака (см. Недостаточная репарация ДНК при канцерогенезе). Было обнаружено, что экспрессия белка Ku80 недостаточна при меланоме.[13] Кроме того, низкая экспрессия Ku80 была обнаружена в 15% случаев аденокарциномы и 32% клеток плоскоклеточного типа. немелкоклеточный рак легких, и это коррелировало с гиперметилированием XRCC5 промоутер.[8]

Ku80, по-видимому, является одним из 26 различных белков репарации ДНК, которые эпигенетически репрессируются при различных формах рака (см. Эпигенетика рака).

Взаимодействия

Ku80 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000079246 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026187 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: рентгеновское восстановление XRCC5, дополняющее дефектную репарацию в клетках китайского хомячка 5 (повторное соединение двухцепочечного разрыва; Ku-аутоантиген, 80 кДа)».
  6. ^ Бултон С.Дж., Джексон С.П. (март 1998 г.). «Компоненты Ku-зависимого негомологичного пути соединения концов участвуют в поддержании длины теломера и сайленсинге теломеров». EMBO J. 17 (6): 1819–28. Дои:10.1093 / emboj / 17.6.1819. ЧВК 1170529. PMID 9501103.
  7. ^ «Ген Entrez: восстановление XRCC6 с помощью рентгеновских лучей, дополняющее дефектное восстановление в клетках китайского хомячка 6 (аутоантиген Ku, 70 кДа)».
  8. ^ а б c Ли М.Н., Цзэн Р.С., Сюй Х.С., Чен Дж.Й., Цао Ц., Хо В.Л., Ван Ю.К. (2007). «Эпигенетическая инактивация генов контроля хромосомной стабильности BRCA1, BRCA2 и XRCC5 при немелкоклеточном раке легкого». Clin. Рак Res. 13 (3): 832–8. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2694. PMID 17289874.
  9. ^ Фогель Х., Лим Д.С., Карсенти Г., Файнголд М., Хасти П. (1999). «Удаление Ku86 вызывает раннее начало старения у мышей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (19): 10770–5. Дои:10.1073 / пнас.96.19.10770. ЧВК 17958. PMID 10485901.
  10. ^ Рейлинг Э., Долле М.Э., Юсеф С.А., Ли М., Нагараджа Б., Рудберген М., де Вит П, де Брюин А., Хоймейкерс Дж. Х., Видж Дж., Ван Стиг Х., Хэсти П. (2014). «Прогероидный фенотип дефицита Ku80 преобладает над дефицитом ДНК-PKCS». PLOS ONE. 9 (4): e93568. Дои:10.1371 / journal.pone.0093568. ЧВК 3989187. PMID 24740260.
  11. ^ Дидье Н., Урде С., Амтор Х, Марацци Г., Сассун Д. (2012). «Утрата единственного аллеля Ku80 приводит к дисфункции предшественников и ускоренному старению скелетных мышц». ЭМБО Мол Мед. 4 (9): 910–23. Дои:10.1002 / emmm.201101075. ЧВК 3491824. PMID 22915554.
  12. ^ Лоренцини А., Джонсон Ф. Б., Оливер А., Трезини М., Смит Дж. С., Хдеиб М., Селл С., Кристофало В.Дж., Стамато Т.Д. (2009). «Значительная корреляция долголетия видов с распознаванием двухцепочечных разрывов ДНК, но не с длиной теломер». Мех. Старение Дев. 130 (11–12): 784–92. Дои:10.1016 / j.mad.2009.10.004. ЧВК 2799038. PMID 19896964.
  13. ^ Корабёвска М., Черны М., Стахура Дж., Бергер Х., Кордон-Кардо С., Бринк У. (2002). «Дифференциальная экспрессия ДНК негомологичных белков Ku70 и Ku80 с присоединением концов при прогрессировании меланомы». Мод. Патол. 15 (4): 426–33. Дои:10.1038 / modpathol.3880542. PMID 11950917.
  14. ^ а б Гелл Д., Джексон С.П. (сентябрь 1999 г.). «Картирование белок-белковых взаимодействий внутри ДНК-зависимого протеинкиназного комплекса». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (17): 3494–502. Дои:10.1093 / nar / 27.17.3494. ЧВК 148593. PMID 10446239.
  15. ^ Джин С., Харбанда С., Майер Б., Куфе Д., Уивер Д. Т. (октябрь 1997 г.). «Связывание Ku и c-Abl в области гомологии киназы каталитической субъединицы ДНК-зависимой протеинкиназы». J. Biol. Chem. 272 (40): 24763–6. Дои:10.1074 / jbc.272.40.24763. PMID 9312071.
  16. ^ а б c Матеос Д., Руис М. Т., Прайс Г. Б., Заннис-Хаджопулос М. (октябрь 2002 г.). «Ku-антиген, ориджин-специфический связывающий белок, который связывается с белками репликации, необходим для репликации ДНК млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1578 (1–3): 59–72. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00497-9. PMID 12393188.
  17. ^ а б Барлев Н.А., Полторацкий В., Оуэн-Хьюз Т., Ин Си, Лю Л., Уоркман Дж. Л., Бергер С.Л. (март 1998 г.). «Подавление активности гистонацетилтрансферазы GCN5 через связывание бромодомена и фосфорилирование Ku-ДНК-зависимым протеинкиназным комплексом». Мол. Cell. Биол. 18 (3): 1349–58. Дои:10.1128 / mcb.18.3.1349. ЧВК 108848. PMID 9488450.
  18. ^ Ян Ч.Р., Йе С., Лесков К., Одегаард Э., Сюй Х.Л., Чанг С., Кинселла Т.Дж., Чен DJ, Бутман Д.А. (май 1999 г.). «Выделение Ku70-связывающих белков (KUBs)». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (10): 2165–74. Дои:10.1093 / nar / 27.10.2165. ЧВК 148436. PMID 10219089.
  19. ^ Синглтон Б.К., Торрес-Арзаюс М.И., Rottinghaus ST, Taccioli GE, Jeggo PA (май 1999 г.). «С-конец Ku80 активирует каталитическую субъединицу ДНК-зависимой протеинкиназы». Мол. Cell. Биол. 19 (5): 3267–77. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3267. ЧВК 84121. PMID 10207052.
  20. ^ Song K, Jung D, Jung Y, Lee SG, Lee I (сентябрь 2000 г.). «Взаимодействие Ku70 человека с TRF2». FEBS Lett. 481 (1): 81–5. Дои:10.1016 / s0014-5793 (00) 01958-x. PMID 10984620. S2CID 22753893.
  21. ^ Ко Л., Кардона Г. Р., Чин В. В. (май 2000 г.). «Белок, связывающий рецептор тироидного гормона, белок, содержащий мотив LXXLL, функционирует как общий коактиватор». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (11): 6212–7. Дои:10.1073 / пнас.97.11.6212. ЧВК 18584. PMID 10823961.
  22. ^ Ко Л, Чин WW (март 2003 г.). «Коактиватор ядерного рецептора, рецептор-связывающий белок тироидного гормона (TRBP), взаимодействует с связанной с ним ДНК-зависимой протеинкиназой и стимулирует его». J. Biol. Chem. 278 (13): 11471–9. Дои:10.1074 / jbc.M209723200. PMID 12519782.
  23. ^ Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». J. Biol. Chem. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
  24. ^ Balajee AS, Geard CR (март 2001 г.). «Образование связанного с хроматином комплекса PCNA, вызванное повреждением ДНК, происходит независимо от продукта гена ATM в клетках человека». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (6): 1341–51. Дои:10.1093 / nar / 29.6.1341. ЧВК 29758. PMID 11239001.
  25. ^ Шильд-Поултер С., Поуп Л., Гиффин В., Кочан Дж. К., Нгзее Дж. К., Трайкова-Андонова М., Хаче Р. Дж. (Май 2001 г.). «Связывание Ku-антигена с гомеодоменными белками способствует их фосфорилированию ДНК-зависимой протеинкиназой». J. Biol. Chem. 276 (20): 16848–56. Дои:10.1074 / jbc.M100768200. PMID 11279128.
  26. ^ О'Коннор М.С., Safari A, Лю Д., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «Белковый комплекс человека Rap1 и модуляция длины теломер». J. Biol. Chem. 279 (27): 28585–91. Дои:10.1074 / jbc.M312913200. PMID 15100233.
  27. ^ Чай В., Форд Л. П., Ленерц Л., Райт В. Е., Шей Дж. В. (декабрь 2002 г.). «Человеческий Ku70 / 80 физически связывается с теломеразой через взаимодействие с hTERT». J. Biol. Chem. 277 (49): 47242–7. Дои:10.1074 / jbc.M208542200. PMID 12377759.
  28. ^ Адам Л., Бандйопадхьяй Д., Кумар Р. (январь 2000 г.). «Передача сигналов интерферона-альфа способствует перераспределению p95Vav из ядра в цитоплазму и образованию мультисубъединичного комплекса, включающего Vav, Ku80 и Tyk2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 267 (3): 692–6. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1978. PMID 10673353.
  29. ^ Кармакар П., Сноуден С.М., Рамсден Д.А., Бор В.А. (август 2002 г.). «Гетеродимер Ku связывается с обоими концами белка Вернера, и функциональное взаимодействие происходит на N-конце Вернера». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (16): 3583–91. Дои:10.1093 / nar / gkf482. ЧВК 134248. PMID 12177300.
  30. ^ Ли Б., Комай Л. (сентябрь 2000 г.). «Функциональное взаимодействие между Ku и белком синдрома Вернера в процессинге концов ДНК». J. Biol. Chem. 275 (37): 28349–52. Дои:10.1074 / jbc.C000289200. PMID 10880505.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для перекрестно комплементарного белка репарации рентгеновскими лучами человека 5