WikiDer > LACTB

LACTB
LACTB
Идентификаторы
ПсевдонимыLACTB, G24, MRPL56, бета-лактамаза
Внешние идентификаторыOMIM: 608440 MGI: 1933395 ГомолоГен: 12755 Генные карты: LACTB
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение LACTB
Геномное расположение LACTB
Группа15q22.2Начинать63,121,833 бп[1]
Конец63,142,061 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001288585
NM_032857
NM_171846

NM_030717

RefSeq (белок)

NP_001275514
NP_116246
NP_741982

NP_109642

Расположение (UCSC)Chr 15: 63.12 - 63.14 МбChr 9: 66.96 - 66.98 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Сериновый бета-лактамазоподобный белок LACTB, митохондриальный является фермент что у людей кодируется LACTB ген.[5][6] Этот ген кодирует белок массой 54 кДа, имеющий значительное сходство последовательностей с сериновыми протеазами связывающий пенициллин белок и бета-лактамаза суперсемейство, встречающееся у бактерий.[7] Он участвует в регуляции метаболических цепей. Обнаружена причинная связь между LACTB и ожирение.[8] При раке груди LACTB выполняет функцию подавления опухолей, модулируя метаболизм липидов.[9]

Структура

Ген

В LACTB ген расположен в хромосома 15q22.1, состоящий из 8 экзоны. Альтернативная сварка приводит к множественным вариантам транскрипта, кодирующим разные белки изоформы.

Протеин

LACTB имеет сходство последовательностей с бета-лактамазой /пенициллин-связывающее семейство белков серин протеазы которые участвуют в бактериальных клеточная стенка метаболизм. В N-концевой 97 аминокислота сегмент LACTB не является частью консервативного домена связывающего пенициллин белка и, следовательно, может отвечать за органелла нацеливание.[7][10]

Функция

LACTB широко экспрессируется в разных млекопитающее ткани, с преобладающей экспрессией в человеческих скелетные мышцы. Он локализуется в митохондриальное межмембранное пространство.[10] LACTB может полимеризоваться в стабильную нити занимая митохондриальное межмембранное пространство. Предполагается, что эти филаменты играют роль в субмитохондриальной организации и, следовательно, возможно влияют на организацию митохондриального метаболона.[10]

Клиническое значение

Было обнаружено, что LACTB может вызывать ожирение с помощью анализа коэкспрессии генов, основанного на данных, интегрированных из нескольких источников. Это было подтверждено in vivo сверхэкспрессией LACTB в трансгенные мыши, что привело к фенотипу ожирения.[8] LACTB также был признан подавитель опухолей благодаря его влиянию на метаболизм митохондриальных фосфолипидов и модуляции состояния дифференцировки клеток.[11]

Взаимодействия

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103642 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032370 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Смит Т.С., Саутан К., Эллингтон К., Кэмпбелл Д., Тью Д.Г., Дебук С. (ноябрь 2001 г.). «Идентификация, геномная организация и экспрессия мРНК LACTB, кодирующего серин-бета-лактамазоподобный белок с аминоконцевым трансмембранным доменом». Геномика. 78 (1–2): 12–4. Дои:10.1006 / geno.2001.6643. PMID 11707067.
  6. ^ «Энтрез Ген: лактамаза LACTB, бета».
  7. ^ а б Пейтсаро Н., Полянските З., Туймала Дж., Пёрн-Арес И., Лиобикас Дж., Шпеер О., Линдхольм Д., Томпсон Дж., Эрикссон О. (2008). «Эволюция семейства сериновых ферментов активного центра многоклеточных животных из пенициллин-связывающих белков: новый аспект бактериального наследия». BMC Эволюционная биология. 8: 26. Дои:10.1186/1471-2148-8-26. ЧВК 2266909. PMID 18226203.
  8. ^ а б Chen Y, Zhu J, Lum PY, Yang X, Pinto S, MacNeil DJ, Zhang C, Lamb J, Edwards S, Sieberts SK, Leonardson A, Castellini LW, Wang S, Champy MF, Zhang B, Emilsson V, Doss S , Ghazalpour A, Horvath S, Drake TA, Lusis AJ, Schadt EE (март 2008 г.). «Изменения в ДНК выясняют молекулярные сети, вызывающие заболевания». Природа. 452 (7186): 429–35. Дои:10.1038 / природа06757. ЧВК 2841398. PMID 18344982.
  9. ^ Эрикссон, Уве; Лаловски, Мацей; Линдхольм, Дэн (2017). «Комментарий: LACTB - это опухолевый супрессор, который модулирует метаболизм липидов и состояние клеток». Границы физиологии. 8: 396. Дои:10.3389 / fphys.2017.00396. ISSN 1664-042X. ЧВК 5462942. PMID 28642719.
  10. ^ а б c Polianskyte Z, Peitsaro N, Dapkunas A, Liobikas J, Soliymani R, Lalowski M, Speer O, Seitsonen J, Butcher S, Cereghetti GM, Linder MD, Merckel M, Thompson J, Eriksson O (ноябрь 2009 г.). «LACTB - это белок, образующий нити, локализованный в митохондриях». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (45): 18960–5. Дои:10.1073 / pnas.0906734106. ЧВК 2767363. PMID 19858488.
  11. ^ Кецесова и другие. 2017. LACTB - это опухолевый супрессор, который модулирует метаболизм липидов и состояние клеток. Природа 543: 681-686
  12. ^ Лу Дж.Б., Яо XX, Сю Дж.С., Ху Ю.В. (январь 2016 г.). «МикроРНК-125b-5p ослабляет индуцированную липополисахаридом продукцию хемоаттрактантного белка-1 моноцитами путем нацеливания на ингибирование LACTB в макрофагах THP-1». Архивы биохимии и биофизики. 590: 64–71. Дои:10.1016 / j.abb.2015.11.007. PMID 26603571.

дальнейшее чтение