WikiDer > LIMK1

LIMK1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3С95, 5L6W, 5ХВК, 5HVJ
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMK1, LIMK, LIMK-1, киназа 1 домена LIM
Внешние идентификаторы	OMIM: 601329 MGI: 104572 ГомолоГен: 1738 Генные карты: LIMK1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	74,122,525 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	134,688,598 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• трансферазная активность; • связывание нуклеотидов; • связывание с белками теплового шока; • связывание ионов металлов; • киназная активность; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность гетеродимеризации белков; • Связывание АТФ; • активность протеинкиназы; • активность протеин-серин / треонинкиназы; • активность преобразователя сигнала;
Сотовый компонент	• мембрана; • очаговая адгезия; • цитоплазма; • ядро клетки; • аппарат Гольджи; • цитозоль; • ядерное пятнышко; • проекция нейрона; • ламеллиподиум; • проекция клетки;
Биологический процесс	• Путь передачи сигналов рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе; • фосфорилирование; • развитие нервной системы; • отрицательная регуляция активности убиквитин-протеинтрансферазы; • Передача сигнала белка Rho; • положительная регуляция сборки пучка актиновых филаментов; • организация актинового цитоскелета; • преобразование сигнала; • положительная регуляция удлинения аксона; • фосфорилирование белков; • положительное регулирование сборки напряженного волокна;
	Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
	3984
	16885
	ENSG00000106683
	ENSMUSG00000029674
	P53667
	P53668
	NM_016735; NM_001204426; NM_002314
	NM_010717; NM_001305875
	NP_001191355; NP_002305
	NP_001292804; NP_034847
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

LIMK1

LIM доменная киназа 1 является фермент что у людей кодируется LIMK1 ген.^[5]^[6]

Функция

Существует около 40 известных эукариотических белков LIM, названных так в честь LIM домены в них содержатся. LIM домены высоко консервативны цистеин-богатые структуры, содержащие 2 цинковые пальцы. Хотя цинковые пальцы обычно действуют, связываясь с ДНК или же РНК, мотив LIM, вероятно, опосредует белок-белковые взаимодействия. LIM киназа-1 и LIM киназа-2 принадлежат к небольшому подсемейству с уникальной комбинацией 2 N-концевой Мотивы LIM, центральный PDZ домен, а C-терминал протеинкиназа домен. LIMK1, вероятно, является компонентом внутриклеточного сигнального пути и может участвовать в развитии мозга.^[7]

Клиническое значение

LIMK1 гемизиготность участвует в нарушении зрительно-пространственного конструктивного познания Синдром Вильямса.^[7]

Взаимодействия

LIMK1 был показан взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Скотт Р.В., Олсон М.Ф. (2007). «Киназы LIM: функция, регуляция и связь с заболеванием человека». J. Mol. Med. 85 (6): 555–68. Дои:10.1007 / s00109-007-0165-6. PMID 17294230. S2CID 8881246.
Мизуно К., Окано И., Охаши К., Нуноуэ К., Кума К., Мията Т., Накамура Т. (1994). «Идентификация кДНК человека, кодирующей новую протеинкиназу с двумя повторами мотива LIM / двойной цинковый палец». Онкоген. 9 (6): 1605–12. PMID 8183554.
Окано И., Хираока Дж., Отера Х, Нуноуэ К., Охаши К., Ивашита С., Хираи М., Мизуно К. (1995). «Идентификация и характеристика нового семейства серин / треониновых киназ, содержащих два N-концевых мотива LIM». J. Biol. Chem. 270 (52): 31321–30. Дои:10.1074 / jbc.270.52.31321. PMID 8537403.
Франгискакис Дж. М., Юарт А. К., Моррис К. А., Мервис С. Б., Бертран Дж., Робинсон Б. Ф., Кляйн Б. П., Энсинг Г. Дж., Эверетт Л. А., Грин Э. Д., Прёшель С., Гутовски Н. Дж., Нобл М., Аткинсон Д. Л., Одельберг С. Дж., Китинг М. . «Гемизиготность LIM-киназы 1 связана с нарушением зрительно-пространственного конструктивного познания». Клетка. 86 (1): 59–69. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80077-X. PMID 8689688. S2CID 17786888.
Nebl G, Meuer SC, Samstag Y (1996). «Дефосфорилирование серина 3 регулирует ядерную транслокацию кофилина». J. Biol. Chem. 271 (42): 26276–80. Дои:10.1074 / jbc.271.42.26276. PMID 8824278.
Хираока Дж., Окано И., Хигучи О, Ян Н., Мидзуно К. (1996). «Самоассоциация LIM-киназы 1, опосредованная взаимодействием между N-концевым доменом LIM и C-концевым доменом киназы». FEBS Lett. 399 (1–2): 117–21. Дои:10.1016 / S0014-5793 (96) 01303-8. PMID 8980133. S2CID 2815035.
Ян Н, Хигучи О, Охаши К., Нагата К., Вада А., Кангава К., Нисида Э, Мидзуно К. (1998). «Фосфорилирование кофилина с помощью LIM-киназы 1 и его роль в Rac-опосредованной реорганизации актина». Природа. 393 (6687): 809–12. Дои:10.1038/31735. PMID 9655398. S2CID 4326365.
Ван Дж. Ю., Френзель К. Э., Вэнь Д., Фоллс Д. Л. (1998). «Трансмембранные нейрегулины взаимодействуют с LIM киназой 1, цитоплазматической протеинкиназой, участвующей в развитии зрительно-пространственного познания». J. Biol. Chem. 273 (32): 20525–34. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20525. PMID 9685409.
Эдвардс, округ Колумбия, Джилл Г.Н. (1999). «Структурные особенности LIM-киназы, которые контролируют действие на актиновый цитоскелет». J. Biol. Chem. 274 (16): 11352–61. Дои:10.1074 / jbc.274.16.11352. PMID 10196227.
Сотиропулос А., Гинеитис D, Коупленд Дж., Трейсман Р. (1999). «Регулируемая сигналом активация сывороточного фактора ответа опосредуется изменениями в динамике актина». Клетка. 98 (2): 159–69. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81011-9. PMID 10428028. S2CID 15781260.
Бах I, Родригес-Эстебан С., Каррьер С., Бхушан А., Кронес А., Роуз Д. В., Гласс С. К., Андерсен Б., Изписуа Бельмонте Дж. К., Розенфельд М. Г. (1999). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Nat. Genet. 22 (4): 394–9. Дои:10.1038/11970. PMID 10431247. S2CID 22326394.
Маэкава М., Ишизаки Т., Боку С., Ватанабэ Н., Фудзита А., Ивамацу А., Обината Т., Охаши К., Мизуно К., Нарумия С. (1999). «Передача сигналов от Rho к актиновому цитоскелету через протеинкиназы ROCK и LIM-киназы». Наука. 285 (5429): 895–8. Дои:10.1126 / наука.285.5429.895. PMID 10436159.
Эдвардс, округ Колумбия, Сандерс Л.С., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (1999). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 связывает передачу сигналов Rac / Cdc42 GTPase с актиновой динамикой цитоскелета». Nat. Cell Biol. 1 (5): 253–9. Дои:10.1038/12963. PMID 10559936. S2CID 25250183.
Охаши К., Нагата К., Маэкава М., Ишизаки Т., Нарумия С., Мидзуно К. (2000). «Rho-ассоциированная киназа ROCK активирует LIM-киназу 1 путем фосфорилирования по треонину 508 в петле активации». J. Biol. Chem. 275 (5): 3577–82. Дои:10.1074 / jbc.275.5.3577. PMID 10652353.
Мартиндейл Д.В., Уилсон, доктор медицины, Ван Д., Берк Р.Д., Чен X, Дуронио В., Куп Б.Ф. (2000). «Сравнительный анализ геномной последовательности области синдрома Вильямса (LIMK1-RFC2) хромосомы 7q11.23 человека». Мамм. Геном. 11 (10): 890–8. Дои:10.1007 / s003350010166. PMID 11003705. S2CID 8575994.
Суми Т., Мацумото К., Сибуя А., Накамура Т. (2001). «Активация киназ LIM киназой миотонической дистрофии, связанной с Cdc42-связывающей киназой альфа». J. Biol. Chem. 276 (25): 23092–6. Дои:10.1074 / jbc.C100196200. PMID 11340065.
Дэн С., Келли А., Бернард О., Минден А. (2001). «Изменения цитоскелета, регулируемые серин / треонинкиназой PAK4, опосредуются LIM киназой 1 и кофилином». J. Biol. Chem. 276 (34): 32115–21. Дои:10.1074 / jbc.M100871200. PMID 11413130.
Тосима Дж., Тосима Дж. Ю., Такеучи К., Мори Р., Мизуно К. (2001). «Активность фосфорилирования кофилина и реорганизации актина тестикулярной протеинкиназы 2 и ее преобладающая экспрессия в клетках Сертоли яичек». J. Biol. Chem. 276 (33): 31449–58. Дои:10.1074 / jbc.M102988200. PMID 11418599.

внешняя ссылка

LIMK1 Информация со ссылками в Шлюз миграции ячеек

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106683 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029674 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8673124-5] Tassabehji M, Metcalfe K, Fergusson WD, Carette MJ, Dore JK, Donnai D, Read AP, Pröschel C, Gutowski NJ, Mao X, Sheer D (август 1996). «LIM-киназа удалена при синдроме Вильямса». Nat. Genet. 13 (3): 272–3. Дои:10.1038 / ng0796-272. PMID 8673124. S2CID 138698.

[pmid8812460-6] Осборн Л.Р., Мартиндейл Д., Шерер С.В., Ши Х.М., Хьюзенга Дж., Хенг Х.Х., Коста Т., Побер Б., Лью Л., Бринкман Дж., Ромменс Дж., Куп Б., Цуй Л.С. (январь 1997 г.). «Идентификация генов из области размером 500 т.п.н. в 7q11.23, которая обычно удаляется у пациентов с синдромом Вильямса». Геномика. 36 (2): 328–36. Дои:10.1006 / geno.1996.0469. PMID 8812460.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: LIMK1 киназа 1 домена LIM».

[pmid12963706-8] Фолетта В.К., Лим М.А., Сусайраджа Дж., Келли А.П., Стэнли Э.Г., Шеннон М., Хе В., Дас С., Массагу Дж., Бернард О., Сусайрайя Дж. (Сентябрь 2003). «Прямая передача сигналов рецептором BMP типа II через регулятор цитоскелета LIMK1». J. Cell Biol. 162 (6): 1089–98. Дои:10.1083 / jcb.200212060. ЧВК 2172847. PMID 12963706.

[pmid10436159-9] Маэкава М., Ишизаки Т., Боку С., Ватанабэ Н., Фудзита А., Ивамацу А., Обината Т., Охаши К., Мидзуно К., Нарумия С. (август 1999 г.). «Передача сигналов от Rho к актиновому цитоскелету через протеинкиназы ROCK и LIM-киназы». Наука. 285 (5429): 895–8. Дои:10.1126 / science.285.5429.895. PMID 10436159.

[pmid14530263-10] Yokoo T, Toyoshima H, Miura M, Wang Y, Iida KT, Suzuki H, Sone H, Shimano H, Gotoda T, Nishimori S, Tanaka K, Yamada N (декабрь 2003 г.). «p57Kip2 регулирует динамику актина, связывая и перемещая LIM-киназу 1 в ядро». J. Biol. Chem. 278 (52): 52919–23. Дои:10.1074 / jbc.M309334200. PMID 14530263.

[pmid9685409-11] Ван Дж.Й., Френзель К.Э., Вен Д., Фоллс Д.Л. (август 1998 г.). «Трансмембранные нейрегулины взаимодействуют с LIM киназой 1, цитоплазматической протеинкиназой, участвующей в развитии зрительно-пространственного познания». J. Biol. Chem. 273 (32): 20525–34. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20525. PMID 9685409.

[pmid10559936-12] Эдвардс, округ Колумбия, Сандерс Л.С., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (сентябрь 1999 г.). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 связывает передачу сигналов Rac / Cdc42 GTPase с актиновой динамикой цитоскелета». Nat. Cell Biol. 1 (5): 253–9. Дои:10.1038/12963. PMID 10559936. S2CID 25250183.

[pmid11413130-13] Дэн С., Келли А., Бернард О., Минден А. (август 2001 г.). «Изменения цитоскелета, регулируемые серин / треонинкиназой PAK4, опосредуются LIM киназой 1 и кофилином». J. Biol. Chem. 276 (34): 32115–21. Дои:10.1074 / jbc.M100871200. PMID 11413130.

[pmid12323073-14] Биркенфельд Дж, Бец Х, Рот Д. (январь 2003 г.). «Идентификация кофилина и протеинкиназы 1, содержащей LIM-домен, в качестве новых партнеров по взаимодействию 14-3-3 дзета». Biochem. J. 369 (Pt 1): 45–54. Дои:10.1042 / BJ20021152. ЧВК 1223062. PMID 12323073.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

Navigation