WikiDer > МАЛАТ1

MALAT1
МАЛАТ1
Идентификаторы
ПсевдонимыМАЛАТ1, HCN, LINC00047, MALAT-1, NCRNA00047, NEAT2, PRO2853, mascRNA, транскрипт 1 аденокарциномы легких, ассоциированный с метастазами (небелковое кодирование), транскрипт 1 аденокарциномы легких, ассоциированных с метастазами
Внешние идентификаторыOMIM: 607924 Генные карты: МАЛАТ1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение MALAT1
Геномное расположение MALAT1
Группа11q13.1Начинать65,497,688 бп[1]
Конец65,506,516 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

н / д

Расположение (UCSC)Chr 11: 65,5 - 65,51 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Консервированная вторичная структура транскрипта 1 аденокарциномы легких, ассоциированной с метастазами
Вторичная структура MALAT1.jpg
Идентификаторы
СимволМАЛАТ1
РфамRF01871
Прочие данные
РНК типГен;
Домен (ы)Эукариоты;
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO:
ТАКSO: 0001263
PDB структурыPDBe

МАЛАТ 1 (транскрипт 1 аденокарциномы легких, ассоциированный с метастазами), также известный как NEAT2 (некодирующий обогащенный ядерными фрагментами транскрипт 2), представляет собой большой, редко встречающийся сращенный некодирующая РНК, который хорошо сохраняется среди млекопитающие и высоко выражен в ядро.[3] MALAT1 был идентифицирован в нескольких типах физиологических процессов, таких как альтернативный сплайсинг, ядерная организация, эпигенетическая модуляция экспрессии генов, и ряд доказательств указывает на то, что MALAT1 также тесно связан с различными патологическими процессами, начиная от осложнений диабета и заканчивая раком.[4][5] Он регулирует выражение из метастаз-ассоциированный гены.[6] Он также положительно регулирует клетка подвижность через транскрипционный и / или посттранскрипционная регуляция генов, связанных с подвижностью.[7] MALAT1 может играть роль в определение пола в зависимости от температуры у красноухой черепахи-ползунка (Trachemys scripta).[8]

Выражение в мозгу алкоголика

Транскрипты MALAT1 значительно увеличиваются в мозжечок человека-алкоголиков, а также в аналогичных областях мозга крыс после вывода паров этанола. Эта индуцированная алкоголем повышающая регуляция MALAT1 может быть ответственной за дифференциальную экспрессию ряда белков, которые способствуют толерантности и зависимости от этанола у людей.[9]

Прогностический потенциал при раке

Задокументировано участие РНК MALAT1 в патологии различных видов рака.[5] Повышенная экспрессия MALAT1 коррелирует с плохой общей выживаемостью при различных типах рака, что позволяет предположить, что этот ген является прогностическим фактором для различных типов рака.[10][11]

Как мишень для лечения рака

Генетическая потеря или системный нокдаун Малата1 с использованием антисмысловые олигонуклеотиды (ASO) на модели карциномы молочной железы мыши приводит к более медленному росту опухоли, сопровождающемуся значительной дифференцировкой в ​​кистозные опухоли и уменьшением метастазов. На молекулярном уровне гибрид ASO-Malat1 стимулирует естественный клеточный фермент, разрушающий днРНК Malat1. Нокдаун Malat1 приводит к изменениям в экспрессии генов и изменениям в паттернах сплайсинга генов, участвующих в дифференцировке и протуморигенных сигнальных путях. Метастатические опухоли зависят от малата1 - без него они не могут развиваться. И, что очень важно, этого, кажется, требуют только раковые клетки. Поскольку было установлено, что MALAT1 участвует в онкогенезе различных типов рака, таких как рак легких, рак поджелудочной железы, рак шейки матки, ASO Malat1 представляют собой потенциальную терапию для ингибирования прогрессирования такого рака.[12]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000251562 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Хатчинсон Дж. Н., Энсмингер А. В., Клемсон С. М., Линч С. Р., Лоуренс Дж. Б., Шахматы А (2007). «Скрининг ядерных транскриптов идентифицирует две связанные некодирующие РНК, связанные с доменами сплайсинга SC35». BMC Genomics. 8: 39. Дои:10.1186/1471-2164-8-39. ЧВК 1800850. PMID 17270048. открытый доступ
  4. ^ Ву И, Хуанг Ц., Мэн Х, Ли Дж. (2015). «Длинная некодирующая РНК MALAT1: понимание ее биогенеза и последствий для заболеваний человека». Текущий фармацевтический дизайн. 21 (34): 5017–5028. Дои:10.2174/1381612821666150724115625. PMID 26205289.
  5. ^ а б Ёсимото Р., Майеда А., Ёсида М., Накагава С. (январь 2016 г.). «MALAT1 длинная некодирующая РНК при раке». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов. 1859 (1): 192–199. Дои:10.1016 / j.bbagrm.2015.09.012. PMID 26434412.
  6. ^ Gutschner T, Hämmerle M, Eissmann M, Hsu J, Kim Y, Hung G, Revenko A, Arun G, Stentrup M, Gross M, Zörnig M, MacLeod AR, Spector DL, Diederichs S (февраль 2013 г.). «Некодирующая РНК MALAT1 является критическим регулятором фенотипа метастазирования клеток рака легкого». Исследования рака. 73 (3): 1180–1189. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-12-2850. ЧВК 3589741. PMID 23243023.
  7. ^ Тано К., Мизуно Р., Окада Т., Раквал Р., Шибато Дж., Масуо Ю., Иджири К., Акимицу Н. (ноябрь 2010 г.). «МАЛАТ-1 усиливает подвижность клеток аденокарциномы легких, влияя на экспрессию генов, связанных с подвижностью». Письма FEBS. 584 (22): 4575–4580. Дои:10.1016 / j.febslet.2010.10.008. PMID 20937273. S2CID 207575862.
  8. ^ Chojnowski JL, Braun EL (15 июля 2012 г.). «Беспристрастный подход к идентификации генов, участвующих в развитии черепах с зависимым от температуры определением пола». BMC Genomics. 13: 308. Дои:10.1186/1471-2164-13-308. ЧВК 3434017. PMID 22793670.
  9. ^ Kryger R, Fan L, Wilce PA, Jaquet V (ноябрь 2012 г.). «MALAT-1, небелковая РНК, активируется в мозжечке, гиппокампе и стволе мозга алкоголиков». Алкоголь. 46 (7): 629–634. Дои:10.1016 / j.alcohol.2012.04.002. PMID 22560368.
  10. ^ Тиан Х, Сюй Джи (2015). «Клиническое значение днРНК MALAT1 как прогностического маркера рака человека: систематический обзор и метаанализ». BMJ Open. 5 (9): e008653. Дои:10.1136 / bmjopen-2015-008653. ЧВК 4593150. PMID 26423854. открытый доступ
  11. ^ Вэй Й, Ню Б. (2015). «Роль MALAT1 как прогностического фактора выживания при различных раковых заболеваниях: систематический обзор литературы с метаанализом». Маркеры заболеваний. 2015: 164635. Дои:10.1155/2015/164635. ЧВК 4572489. PMID 26420912.
  12. ^ Арун Дж., Дирмайер С., Акерман М., Чанг К. К., Уилкинсон Дж. Э., Хирн С., Ким И., Маклауд А. Р., Крайнер А. Р., Нортон Л., Броги Е., Эгеблад М., Спектор Д. Л. (январь 2016 г.). «Дифференциация опухолей молочной железы и уменьшение метастазов при потере днРНК Malat1». Гены и развитие. 30 (1): 34–51. Дои:10.1101 / gad.270959.115. ЧВК 4701977. PMID 26701265.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка