WikiDer > Нуклеолин

Nucleolin
NCL
Белок NCL PDB 2fc8.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNCL, C23, нуклеолин, Nsr1
Внешние идентификаторыOMIM: 164035 MGI: 97286 ГомолоГен: 136488 Генные карты: NCL
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение NCL
Геномное расположение NCL
Группа2q37.1Начинать231,453,531 бп[1]
Конец231,483,641 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NCL 200610 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4691

17975

Ансамбль

ENSG00000115053

ENSMUSG00000026234

UniProt

P19338

P09405

RefSeq (мРНК)

NM_005381

NM_010880

RefSeq (белок)

NP_005372

NP_035010

Расположение (UCSC)Chr 2: 231.45 - 231.48 МбChr 1: 86.34 - 86.36 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеолин это белок что у людей кодируется NCL ген.[5][6]

Ген

Ген NCL человека расположен на хромосома 2 и состоит из 14 экзоны с 13 интроны и занимает около 11 КБ. Интрон 11 гена NCL кодирует малая ядрышковая РНК, получивший название U20.[7]

Функция

Нуклеолин является основным ядрышковым белком растущих эукариотических клеток. Обнаружено, что он связан с внутриядерным хроматином и прерибосомными частицами. Он вызывает деконденсацию хроматина за счет связывания с гистоном H1. Считается, что он играет роль в транскрипции пре-рРНК и сборке рибосом. Может играть роль в процессе удлинения транскрипции. Связывает олигонуклеотиды РНК с 5'-UUAGGG-3 'повторами более прочно, чем с 5'-TTAGGG-3' повторами теломерной одноцепочечной ДНК.

Нуклеолин также может действовать как коактиватор транскрипции с фактором транскрипции второго промотора куриного овальбумина (COUP-TFII).[8]

Клиническое значение

Мидкин и плейотропин связываются с нуклеолином на клеточной поверхности как рецептор с низким сродством. Это связывание может ингибировать ВИЧ-инфекцию.[9][10]

Нуклеолин на поверхности клетки является рецептором для Респираторно-синцитиальный вирус (RSV) слитый белок.[11] Было показано, что вмешательство во взаимодействие слитого белка нуклеолина и RSV оказывает терапевтическое действие против инфекции RSV в культурах клеток и на животных моделях.[12][13][14][15]

Взаимодействия

Было показано, что нуклеолин взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115053 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026234 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шривастава М., Макбрайд О.В., Флеминг П.Дж., Поллард Г.Б., Бернс А.Л. (сентябрь 1990 г.). «Геномная организация и хромосомная локализация гена нуклеолина человека». Журнал биологической химии. 265 (25): 14922–31. PMID 2394707.
  6. ^ Эрард М.С., Беленгер П., Кайзерг-Феррер М., Панталони А., Амальрик Ф. (август 1988 г.). «Главный ядрышковый белок, нуклеолин, вызывает деконденсацию хроматина путем связывания с гистоном H1». Европейский журнал биохимии / FEBS. 175 (3): 525–30. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14224.x. PMID 3409881.
  7. ^ «Ген Энтреза: нуклеолин NCL».
  8. ^ Личфилд Л.М., Риггс К.А., Хокенберри А.М., Оливер Л.Д., Барнхарт К.Г., Кай Дж., Пирс В.М., Иванова М.М., Бейтс П.Дж., Аппана С.Н., Датта С., Кулеша П., Макбрайан Дж., Янг Л.С., Клиндж К.М. (май 2012 г.). «Идентификация и характеристика нуклеолина как коактиватора COUP-TFII транскрипции β рецептора ретиноевой кислоты в клетках рака груди». PLOS ONE. 7 (5): e38278. Bibcode:2012PLoSO ... 738278L. Дои:10.1371 / journal.pone.0038278. ЧВК 3365040. PMID 22693611.
  9. ^ Саид Э.А., Краст Б., Нисол С., Сваб Дж., Бриан Дж. П., Ованесиан А.Г. (октябрь 2002 г.). «Мидкин цитокина против ВИЧ связывает нуклеолин, экспрессируемый на клеточной поверхности, как рецептор с низким сродством». Журнал биологической химии. 277 (40): 37492–502. Дои:10.1074 / jbc.M201194200. PMID 12147681. S2CID 41621217.
  10. ^ Саид Э.А., Courty J, Svab J, Delbé J, Krust B, Hovanessian AG (сентябрь 2005 г.). «Плейотропин подавляет ВИЧ-инфекцию, связывая нуклеолин, экспрессируемый на клеточной поверхности». Журнал FEBS. 272 (18): 4646–59. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.04870.x. PMID 16156786. S2CID 21153881.
  11. ^ Тайяри Ф., Марчант Д., Мораес Т.Дж., Дуан В., Мастранджело П., Хегеле Р.Г. (сентябрь 2011 г.). «Идентификация нуклеолина как клеточного рецептора респираторно-синцитиального вируса человека». Природа Медицина. 17 (9): 1132–5. Дои:10,1038 / нм.2444. PMID 21841784. S2CID 205388029.
  12. ^ Билавчук Л.М., Griffiths CD, Дженсен Л.Д., Элавар Ф., Марчант DJ (август 2017 г.). «Восприимчивость респираторно-синцитиального вируса к блокированию нуклеолиновых рецепторов и нейтрализации антител зависит от метода очистки вируса». Вирусы. 9 (8): 207. Дои:10.3390 / v9080207. ЧВК 5580464. PMID 28771197.
  13. ^ Mastrangelo P, Hegele RG (ноябрь 2012 г.). «Рецептор слияния RSV: не то, что все ожидали». Микробы и инфекции / Institut Pasteur. 14 (13): 1205–10. Дои:10.1016 / j.micinf.2012.07.015. PMID 22884716.
  14. ^ Mastrangelo P, Hegele RG (март 2013 г.). «RSV fusion: время для новой модели». Вирусы. 5 (3): 873–85. Дои:10.3390 / v5030873. ЧВК 3705301. PMID 23518574.
  15. ^ Shakeri A, Mastrangelo P, Griffin JK, Moraes TJ, Hegele RG (ноябрь 2014 г.). «Экспрессия рецептора респираторно-синцитиального вируса у мышей и вирусный тропизм». Гистология и гистопатология. 30 (30): 401–411. Дои:10.14670 / HH-30.401. PMID 25374027.
  16. ^ Ли Д., Добровольская Г., Кребс Э. Г. (июнь 1996 г.). «Физическая ассоциация казеинкиназы 2 с нуклеолином». Журнал биологической химии. 271 (26): 15662–8. Дои:10.1074 / jbc.271.26.15662. PMID 8663258. S2CID 10750338.
  17. ^ Дюбуа Т., Земликова Е., Хауэлл С., Эйткен А. (февраль 2003 г.). «Центаурин-альфа 1 ассоциирует in vitro и in vivo с нуклеолином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 301 (2): 502–8. Дои:10.1016 / s0006-291x (02) 03010-3. PMID 12565890.
  18. ^ Томинага К., Срикантан С., Ли Е.К., Субаран С.С., Мартиндейл Дж.Л., Абдельмохсен К., Гороспе М. (октябрь 2011 г.). «Конкурентная регуляция экспрессии нуклеолина с помощью HuR и miR-494». Молекулярная и клеточная биология. 31 (20): 4219–31. Дои:10.1128 / MCB.05955-11. ЧВК 3187287. PMID 21859890.
  19. ^ Ли Ю.П., Буш Р.К., Вальдес Б.К., Буш Х. (апрель 1996 г.). «C23 взаимодействует с B23, предполагаемым белком, связывающим сигнал ядрышковой локализации». Европейский журнал биохимии / FEBS. 237 (1): 153–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID 8620867.
  20. ^ Даниели Ю., Димитрова Д.Д., Боровец Ю.А. (август 2002 г.). «Стресс-зависимая мобилизация нуклеолина, опосредованная образованием комплекса р53-нуклеолин». Молекулярная и клеточная биология. 22 (16): 6014–22. Дои:10.1128 / mcb.22.16.6014-6022.2002. ЧВК 133981. PMID 12138209.
  21. ^ Моримото Х., Окамура Х., Ханеджи Т. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие протеинфосфатазы 1 дельта с нуклеолином в остеобластических клетках человека». Журнал гистохимии и цитохимии. 50 (9): 1187–93. Дои:10.1177/002215540205000905. PMID 12185196. S2CID 24950287.
  22. ^ Сакагути М., Миядзаки М., Такаиши М., Сакагути Ю., Макино Э., Катаока Н., Ямада Х., Намба М., Хах Нью-Хэмпшир (ноябрь 2003 г.). «S100C / A11 является ключевым медиатором Ca (2 +) - индуцированного ингибирования роста эпидермальных кератиноцитов человека». Журнал клеточной биологии. 163 (4): 825–35. Дои:10.1083 / jcb.200304017. ЧВК 2173690. PMID 14623863.
  23. ^ Fouraux MA, Bouvet P, Verkaart S, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (июль 2002 г.). «Нуклеолин связывается с подмножеством комплексов рибонуклеопротеинов Ro человека». Журнал молекулярной биологии. 320 (3): 475–88. Дои:10.1016 / с0022-2836 (02) 00518-1. PMID 12096904.
  24. ^ Халуска П., Салим А., Эдвардс Т.К., Рубин Э.Х. (апрель 1998 г.). «Взаимодействие между N-концом человеческой топоизомеразы I и большим Т-антигеном SV40». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (7): 1841–7. Дои:10.1093 / nar / 26.7.1841. ЧВК 147454. PMID 9512561.
  25. ^ Бхарти А. К., Олсон М. О., Куфе Д. В., Рубин Е. Х. (январь 1996 г.). «Идентификация сайта связывания нуклеолина в топоизомеразе I человека». Журнал биологической химии. 271 (4): 1993–7. Дои:10.1074 / jbc.271.4.1993. PMID 8567649. S2CID 25059254.
  26. ^ Хурц С., Масутоми К., Делгермаа Л., Араи К., Оиси Н., Мидзуно Н., Хаяси Н., Хан В. К., Мураками С. (декабрь 2004 г.). «Нуклеолин взаимодействует с теломеразой». Журнал биологической химии. 279 (49): 51508–15. Дои:10.1074 / jbc.M407643200. PMID 15371412. S2CID 41394148.

дальнейшее чтение