WikiDer > PPP1R8

PPP1R8
PPP1R8
Белок PPP1R8 PDB 2jpe.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPPP1R8, ARD-1, ARD1, NIPP-1, NIPP1, PRO2047, регуляторная субъединица 8 протеинфосфатазы 1
Внешние идентификаторыOMIM: 602636 MGI: 2140494 ГомолоГен: 8555 Генные карты: PPP1R8
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение PPP1R8
Геномное расположение PPP1R8
Группа1п35.3Начните27,830,782 бп[1]
Конец27,851,676 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PPP1R8 207830 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_138558
NM_002713
NM_014110

NM_001290725
NM_146154
NM_001355198
NM_001355199

RefSeq (белок)

NP_002704
NP_054829
NP_612568

NP_001277654
NP_666266
NP_001342127
NP_001342128

Расположение (UCSC)Chr 1: 27,83 - 27,85 МбChr 4: 132,83 - 132,84 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ядерный ингибитор протеинфосфатазы 1 является фермент что у людей кодируется PPP1R8 ген.[5][6][7]

Этот ген посредством альтернативного сплайсинга кодирует три разных изоформы. Две изоформы белка, кодируемые этим геном, являются специфическими ингибиторами серин / треониновых протеинфосфатаз типа 1 и могут связывать, но не расщеплять РНК. Третья изоформа протеина лишена функции ингибирования фосфатазы, но представляет собой одноцепочечную эндорибонуклеазу, сравнимую с РНКазой E E. coli. Эта изоформа требует магния для своей функции и расщепляет определенные сайты в A + U-богатых областях РНК.[7]

Взаимодействия

PPP1R8 показал себя взаимодействовать с участием PPP1CA,[8][9] Гистоновая деацетилаза 2,[8] SF3B1[10] EED [8] и область EZH2 PRC2.[11]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117751 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028882 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ван М., Коэн С. Н. (ноябрь 1994 г.). «ard-1: ген человека, который обращает действие термочувствительных и делеционных мутаций в гене Escherichia coli rne и кодирует активность, вызывающую расщепления, подобные РНКазе Е». Proc Natl Acad Sci USA. 91 (22): 10591–5. Bibcode:1994PNAS ... 9110591W. Дои:10.1073 / пнас.91.22.10591. ЧВК 45067. PMID 7524097.
  6. ^ Мисима К., Цучия М., Соловей М.С., Мосс Дж., Воган М. (май 1993 г.). «ARD 1, 64-кДа гуанин-нуклеотид-связывающий белок с карбоксиконцевым доменом фактора ADP-рибозилирования». J Biol Chem. 268 (12): 8801–7. PMID 8473324.
  7. ^ а б «Ген Entrez: протеинфосфатаза 1 PPP1R8, регуляторная (ингибиторная) субъединица 8».
  8. ^ а б c Цзинь, Цимин; ван Эйнде Алейде; Beullens Monique; Рой Ниведита; Тиль Джеральд; Стальманс Вилли; Боллен Матье (август 2003 г.). «Регулятор протеинфосфатазы-1 (PP1), ядерный ингибитор PP1 (NIPP1), взаимодействует с белком группы polycomb, развитием эмбриональной эктодермы (EED) и функционирует как репрессор транскрипции»). J. Biol. Chem. 278 (33): 30677–85. Дои:10.1074 / jbc.M302273200. ISSN 0021-9258. PMID 12788942.
  9. ^ Аджух, П. М.; Браун Дж. Дж .; Hawkes N. A; Cohen P T; Робертс С. Дж .; Ламонд А. I (февраль 2000 г.). «Связь активности протеинфосфатазы 1 с комплексом человеческого фактора C1 (HCF)». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (3): 678–86. Дои:10.1093 / nar / 28.3.678. ЧВК 102561. PMID 10637318.
  10. ^ Boudrez, An; Beullens Monique; Велькенс Этьен; Стальманс Вилли; Боллен Матье (август 2002 г.). «Зависимое от фосфорилирования взаимодействие факторов сплайсинга SAP155 и NIPP1». J. Biol. Chem. 277 (35): 31834–41. Дои:10.1074 / jbc.M204427200. ISSN 0021-9258. PMID 12105215.
  11. ^ Феррейра М., Вербиннен И., Фардилья М., Ван Эйнде А., Боллен М. (ноябрь 2018 г.). «Делеция регулятора протеинфосфатазы 1 NIPP1 в яичках вызывает гиперфосфорилирование и деградацию гистон-метилтрансферазы EZH2». J. Biol. Chem. 293 (47): 18031–18039. Дои:10.1074 / jbc.AC118.005577. ЧВК 6254331. PMID 30305391.

дальнейшее чтение