WikiDer > RBMS1

RBMS1
RBMS1
Белок RBMS1 PDB 1x4e.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRBMS1, C2orf12, HCC-4, MSSP, MSSP-1, MSSP-2, MSSP-3, SCR2, YC1, одноцепочечный взаимодействующий белок 1 с мотивом связывания РНК
Внешние идентификаторыOMIM: 602310 MGI: 1861774 ГомолоГен: 9640 Генные карты: RBMS1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение RBMS1
Геномное расположение RBMS1
Группа2q24.2Начинать160,272,151 бп[1]
Конец160,493,807 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RBMS1 203748 x at fs.png

PBB GE RBMS1 207266 x at fs.png

PBB GE RBMS1 215127 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002897
NM_016836
NM_016839

NM_001141931
NM_001141932
NM_020296

RefSeq (белок)

NP_002888
NP_058520

NP_001135403
NP_001135404
NP_064692

Расположение (UCSC)Chr 2: 160,27 - 160,49 МбChr 2: 60,75 - 60,96 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

РНК-связывающий мотив, одноцепочечный взаимодействующий белок 1 это белок что у людей кодируется RBMS1 ген.[5][6][7][8]

Функция

Этот ген кодирует член небольшого семейства белков, которые связывают одноцепочечную ДНК / РНК. Эти белки характеризуются наличием двух наборов консенсусной последовательности рибонуклеопротеина (RNP-CS), которые содержат консервативные мотивы, RNP1 и RNP2, первоначально описанные в связывающих белках РНК и необходимые для связывания ДНК. Эти белки участвуют в таких разнообразных функциях, как репликация ДНК, транскрипция генов, развитие клеточного цикла и апоптоз. Описаны множественные варианты транскриптов, полученные в результате альтернативного сплайсинга и кодирования различных изоформ. Некоторые из них были выделены в силу их связывания либо с цепью вышестоящего элемента c-myc (MSSP), либо путем фенотипической комплементации мутантов cdc2 и cdc13 дрожжей (scr2), либо в качестве потенциального репрессора ВИЧ-1 человека и транскрипция промотора альфа ILR-2 (YC1). Псевдоген этого локуса находится на хромосоме 12.[8]

Взаимодействия

RBMS1 было показано взаимодействовать с Полимераза (направленная ДНК), альфа 1.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000153250 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026970 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Канаока Й, Нодзима Х (август 1994). «SCR: новые человеческие супрессоры cdc2 / cdc13 мутантов Schizosaccharomyces pombe содержат мотивы для белков, связывающих РНК». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (13): 2687–93. Дои:10.1093 / nar / 22.13.2687. ЧВК 308228. PMID 8041632.
  6. ^ Негиси Ю., Нишита Ю., Саэгуса Ю., Какизаки И., Галли И., Кихара Ф, Тамай К., Миядзима Н., Игучи-Арига С. М., Арига Х. (апрель 1994 г.). «Идентификация и клонирование кДНК одноцепочечных ДНК-связывающих белков, которые взаимодействуют с областью выше человеческого гена c-myc». Онкоген. 9 (4): 1133–43. PMID 8134115.
  7. ^ Такай Т., Нишита Ю., Игучи-Арига С.М., Арига Х. (1994). «Молекулярное клонирование MSSP-2, одноцепочечного связывающего белка гена c-myc: характеристика специфичности связывания и активности репликации ДНК». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (25): 5576–81. Дои:10.1093 / nar / 22.25.5576. ЧВК 310119. PMID 7838710.
  8. ^ а б «Ген Entrez: РНК-связывающий мотив RBMS1, одноцепочечный взаимодействующий белок 1».
  9. ^ Ники Т., Галли I, Арига Х, Игучи-Арига С.М. (июнь 2000 г.). «MSSP, белок, связывающийся с точкой начала репликации в гене c-myc, взаимодействует с каталитической субъединицей ДНК-полимеразы альфа и стимулирует ее полимеразную активность». FEBS Lett. 475 (3): 209–12. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01679-3. PMID 10869558. S2CID 31594271.

дальнейшее чтение