WikiDer > SORBS1 - Википедия

SORBS1 - Wikipedia
СОРБС1
Protein SORBS1 PDB 2dl3.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыСОРБС1, CAP, FLAF2, R85FL, SH3D5, SH3P12, SORB1, сорбин и домен SH3, содержащий 1
Внешние идентификаторыOMIM: 605264 MGI: 700014 ГомолоГен: 83252 Генные карты: СОРБС1
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Genomic location for SORBS1
Genomic location for SORBS1
Группа10q24.1Начинать95,311,771 бп[1]
Конец95,561,414 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SORBS1 211705 s at fs.png

PBB GE SORBS1 211819 s at fs.png

PBB GE SORBS1 218087 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10580

20411

Ансамбль

ENSG00000095637

ENSMUSG00000025006

UniProt

Q9BX66

Q62417

RefSeq (мРНК)

NM_001034962
NM_001034963
NM_001034964
NM_009166
NM_178362

RefSeq (белок)

NP_001030134
NP_001030135
NP_001030136
NP_033192
NP_848139

Расположение (UCSC)Chr 10: 95.31 - 95.56 МбChr 19: 40.29 - 40.51 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

CAP / Ponsin белок, также известный как Сорбин и белок 1, содержащий домен SH3 это белок что у людей кодируется СОРБС1 ген.[5][6][7] CAP / Ponsin является частью небольшого семейства адаптерных белков, которые регулируют клеточная адгезия, фактор роста сигнализация и цитоскелет формирование. CAP / Ponsin в основном выражается в сердце, скелетные мышцы, печень, жировой ткань и макрофаги; в поперечно-полосатой мышечной ткани CAP / Ponsin локализуется в Costamere конструкции.

Структура

CAP / Ponsin может существовать в виде тринадцати альтернативно сплайсированных изоформ в диапазоне от 81 кДа до 142 кДа.[8] CAP / Ponsin является частью семейства адаптерных белков, в котором ArgBP2 и винексин также являются частью.[9] Эти белки содержат домен консервативной гомологии сорбина (SOHO) и три SH3 домены, а CAP / Ponsin выражается в сердце, скелетные мышцы, печень, жировой ткань и макрофаги.[8][10][11]

Функция

В мышцах CAP / Ponsin играет роль в формировании зрелой костамеры из очаговая адгезия-подобные контакты при сборке сократительный аппарат, поскольку избыточная экспрессия CAP / Ponsin нарушает нормальную морфологию контакта клетки с матриксом.[12] В мышиной модели вирусного миокардит из-за Coxsackievirus инфекция, CAP / Ponsin стабилизированный противовирусный тип I интерферон производства и защищал от апоптоз и цитотоксичность.[13] Также было показано, что CAP / Ponsin является основным регулятором инсулин-стимулированная сигнализация и регуляция поглощение глюкозы, потенцируя инсулин-индуцированный фосфорилирование и набор CBL к липидный плот сигнальный комплекс с участием флотилий.[14] Роль CAP / Ponsin в макрофаг функция была освещена открытием, что мыши, укрывающие СОРБС1-дефицитные макрофаги в Костный мозг защищает от диеты с высоким содержанием жиров резистентность к инсулину и показал сокращение воспаление.[11] В немышечных клетках CAP / Ponsin подавляет распространение клеток и очаговая адгезия оборот, поскольку его миРНК-опосредованный нокдаун привел к усилению ПАК/МЕК/ERK активация и миграция клеток.[15]

Клиническое значение

Показано, что CAP / Ponsin подавляется на конечной стадии. сердечная недостаточность пациенты; эффект, который восстанавливался при механической разгрузке.[12] А однонуклеотидный полиморфизм в СОРБС1 было обнаружено, что он связан с диабет 2 типа и ожирение.[16]

Взаимодействия

SORBS1 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000095637 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025006 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c Мандаи К., Наканиси Х., Сато А., Такахаши К., Сато К., Нисиока Х., Мидзогути А., Такай Й. (март 1999 г.). «Понсин / SH3P12: l-афадин- и винкулин-связывающий белок, локализованный на стыках адгезивов клетка-клетка и клетка-матрикс». Журнал клеточной биологии. 144 (5): 1001–17. Дои:10.1083 / jcb.144.5.1001. ЧВК 2148189. PMID 10085297.
  6. ^ а б Baumann CA, Ribon V, Kanzaki M, Thurmond DC, Mora S, Shigematsu S, Bickel PE, Pessin JE, Saltiel AR (сентябрь 2000 г.). «CAP определяет второй сигнальный путь, необходимый для инсулино-стимулированного транспорта глюкозы» (PDF). Природа. 407 (6801): 202–7. Дои:10.1038/35025089. HDL:2027.42/62940. PMID 11001060. S2CID 4334519.
  7. ^ «Ген Entrez: сорбин SORBS1 и домен SH3, содержащий 1».
  8. ^ а б Линь WH, Хуанг CJ, Лю М.В., Чанг Х.М., Чен Ю.Дж., Тай Т.Ю., Чуанг Л.М. (май 2001 г.). «Клонирование, картирование и характеристика сорбина человека и домена SH3, содержащего 1 ген (SORBS1): белок, связанный с c-Abl во время передачи сигнала инсулина в линии клеток гепатомы Hep3B». Геномика. 74 (1): 12–20. Дои:10.1006 / geno.2001.6541. PMID 11374898.
  9. ^ Киока Н., Уэда К., Амачи Т. (февраль 2002 г.). «Винексин, CAP / ponsin, ArgBP2: новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов». Функция сотовой структуры. 27 (1): 1–7. Дои:10.1247 / csf.27.1. PMID 11937713.
  10. ^ Рибон В., Принтен Дж. А., Хоффман Н. Г., Кей Б. К., Салтиель А. Р. (февраль 1998 г.). «Новый, многофункциональный связывающий c-Cbl белок в передаче сигналов рецептора инсулина в адипоцитах 3T3-L1». Молекулярная и клеточная биология. 18 (2): 872–9. Дои:10.1128 / mcb.18.2.872. ЧВК 108798. PMID 9447983.
  11. ^ а б Лесневски Л.А., Хош С.Е., Нилс Дж. Г., де Лука С., Пашмфороуш М., Люмен С. Н., Чан Ш., Скаденг М., Салтиель А. Р., Олефски Дж. М. (апрель 2007 г.). «Специфическая для костного мозга делеция гена Cap защищает от инсулинорезистентности, вызванной диетой с высоким содержанием жиров». Природа Медицина. 13 (4): 455–62. Дои:10,1038 / нм 1550. PMID 17351624. S2CID 22210202.
  12. ^ а б c Гемлих К., Пиноцис Н., Хайесс К., ван дер Вен П.Ф., Милтинг Х., Эль-Банаёси А., Кёрфер Р., Вильманнс М., Элер Е., Фюрст Д.О. (июнь 2007 г.). «Паксиллин и понсин взаимодействуют в формирующихся костамерах мышечных клеток». Журнал молекулярной биологии. 369 (3): 665–82. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.03.050. PMID 17462669.
  13. ^ Валаперти А., Нишии М., Лю И, Ян Х, Найто К., Лю П. П., Эрикссон Ю. (май 2014 г.). «Адаптерный белок c-Cbl-ассоциированный белок (CAP) защищает от острого CVB3-опосредованного миокардита за счет стабилизации выработки интерферона I типа и снижения цитотоксичности» (PDF). Фундаментальные исследования в кардиологии. 109 (3): 411. Дои:10.1007 / s00395-014-0411-3. PMID 24763933. S2CID 23062795.
  14. ^ Baumann CA, Ribon V, Kanzaki M, Thurmond DC, Mora S, Shigematsu S, Bickel PE, Pessin JE, Saltiel AR (сентябрь 2000 г.). «CAP определяет второй сигнальный путь, необходимый для инсулино-стимулированного транспорта глюкозы» (PDF). Природа. 407 (6801): 202–7. Дои:10.1038/35025089. HDL:2027.42/62940. PMID 11001060. S2CID 4334519.
  15. ^ Чжан М., Лю Дж., Ченг А., Деён С.М., Чен Х, Долд Л.Х., Салтиель А.Р. (ноябрь 2006 г.). «CAP взаимодействует с белками цитоскелета и регулирует активацию и подвижность ERK, опосредованные адгезией». Журнал EMBO. 25 (22): 5284–93. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601406. ЧВК 1636617. PMID 17082770.
  16. ^ Лин УХ, Чиу К.С., Чанг Х.М., Ли К.С., Тай Т.Ю., Чуанг Л.М. (август 2001 г.). «Молекулярное сканирование гена сорбина человека и SH3-домена-1 (SORBS1): положительная ассоциация полиморфизма T228A с ожирением и диабетом 2 типа». Молекулярная генетика человека. 10 (17): 1753–60. Дои:10.1093 / hmg / 10.17.1753. PMID 11532984.
  17. ^ а б Хаглунд К., Иванкович-Дикич И., Шимокава Н., Крух Г.Д., Дикич И. (май 2004 г.). «Рекрутирование Pyk2 и Cbl в липидные рафты опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах». Журнал клеточной науки. 117 (Pt 12): 2557–68. Дои:10.1242 / jcs.01148. PMID 15128873.
  18. ^ а б Vandenbroere I, Paternotte N, Dumont JE, Erneux C, Pirson I. (январь 2003 г.). «Связанный с c-Cbl белок и c-Cbl являются двумя новыми партнерами SH2-содержащей инозитолполифосфат-5-фосфатазы SHIP2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 300 (2): 494–500. Дои:10.1016 / с0006-291x (02) 02894-2. PMID 12504111.
  19. ^ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные рафты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (16): 9098–103. Дои:10.1073 / pnas.151252898. ЧВК 55379. PMID 11481476.
  20. ^ Се Дж., Цай Т., Чжан Х., Лан М.С., Ноткинс А.Л. (июль 2002 г.). «Фактор транскрипции цинкового пальца INSM1 экспрессируется во время развития эмбриона и взаимодействует с Cbl-ассоциированным белком». Геномика. 80 (1): 54–61. Дои:10.1006 / geno.2002.6800. ЧВК 1237014. PMID 12079283.

дальнейшее чтение