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kleine Störung RNA (= kleine störende RNA) oder siRNA besteht aus 20 bis 25 Nukleotide lange RNA, die exprimiert Gene beeinflusst. SiRNAs werden vom Dicer-Enzym während der RNA-Interferenzzyklus. Sie können auch von externen Forschern in der Kern eingebracht werden, um ein Gen auszuschalten.

In Pflanzen verhindert die siRNA die Vermehrung von VirusRNA, deren Mechanismus dem der miRNA.

Eine siRNA besteht aus einer normalerweise 21 Nukleotide langen doppelsträngigen RNA mit einem hervorstehenden Stück von zwei Nukleotiden an den 3'-Seiten.

Die Einführung von siRNA in den Zellkern (Transfektion) stößt auf Probleme, da es schnell zerfällt und die doppelsträngige Struktur nicht ohne weiteres dauerhaft aufrechterhalten werden kann. Daher wird die siRNA so verändert, dass sie beispielsweise von a . gelesen werden kann Plasmid. Dazu wird eine Schlaufe zwischen die beiden Stränge gelegt, damit der Einzelstranganteil in der Schlinge abgelesen werden kann. Dies verwendet a RNA-Polymerase III-Promoter. Es kann auch durch eine Virusinfektion in die Zelle eingebracht werden. Das VirusGenom enthält dann die Sequenz einer kurzen Haarnadel-RNA (shRNA) in seinem Genom. Nach der Infektion wird die virale RNA in das Genom der Zelle eingebaut, wodurch die Zelle die kurze Haarnadel produziert. Nach der Verarbeitung in der Zelle wird siRNA gebildet.

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