WikiDer > Малый модификатор, связанный с убиквитином 1

Small ubiquitin-related modifier 1
SUMO1
Белок SUMO1 PDB 1a5r.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSUMO1, DAP1, GMP1, OFC10, PIC1, SENP2, SMT3, SMT3C, SMT3H3, UBL1, малый убиквитиноподобный модификатор 1, малый убиквитиноподобный модификатор 1
Внешние идентификаторыOMIM: 601912 MGI: 1197010 ГомолоГен: 2514 Генные карты: SUMO1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение SUMO1
Геномное расположение SUMO1
Группа2q33.1Начинать202,206,180 бп[1]
Конец202,238,608 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SUMO1 208762 в формате fs.png

PBB GE SUMO1 208761 s at fs.png

PBB GE SUMO1 211069 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7341

22218

Ансамбль

ENSG00000116030

ENSMUSG00000026021

UniProt

P63165

P63166

RefSeq (мРНК)

NM_003352
NM_001005781
NM_001005782

NM_009460

RefSeq (белок)

NP_033486

Расположение (UCSC)Chr 2: 202.21 - 202.24 МбChr 1: 59.59 - 59.67 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Малый модификатор, связанный с убиквитином 1 это белок что у людей кодируется SUMO1 ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, входящий в состав СУМО (небольшой убиквитин-подобный модификатор) семейство белков. Он работает аналогично убиквитин в том, что он связан с белками-мишенями как часть системы посттрансляционной модификации. Однако, в отличие от убиквитина, который нацелен на белки для деградации, этот белок участвует во множестве клеточных процессов, таких как ядерный транспорт, регуляция транскрипции, апоптоз и стабильность белка. Он не активен, пока не будут отщеплены последние четыре аминокислоты на карбокси-конце. Сообщается о нескольких псевдогенах этого гена. Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, кодирующие разные изоформы.[7]

Наиболее расщелина гены имеют сумоилирование компонент .[8] Анализ хромосомных аномалий у пациентов привел к идентификации и подтверждению SUMO1 как заячья губа и нёбо локус.[9]

Взаимодействия

Небольшой модификатор, связанный с убиквитином 1, может взаимодействовать с:

Роль в сердце

Сердечная недостаточность Это процесс, в результате которого насосная способность сердца значительно ослабевает, и организм не может обеспечить надлежащее кровообращение. Ослабленное сердце вызывает симптомы усталости, снижение толерантности к физическим нагрузкам и одышку. Пациенты с сердечной недостаточностью имеют значительно повышенный риск смерти по сравнению с людьми с нормальной функцией сердца. Сердечная недостаточность представляет собой серьезную проблему для общественного здравоохранения, поскольку ее заболеваемость растет во всем мире, и она является основной причиной смерти в развитых странах. [27]

SUMO 1 является ключевым компонентом сердечной функции, так как он помогает регулировать гомеостаз кальция в митохондрии сердечных клеток. SUMO 1 связан с другим важным сердечным белком, называемым Ca2 + ATPase сарко / эндоплазматического ретикулума, или SERCA2A. SERCA трансмембранный белок, расположенный в саркоплазматический ретикулум сердечных клеток. Его основная функция - регулировать выделение и поглощение внутриклеточного кальция между цитозолем и просветом саркоплазматического ретикулума. Кальций является важным фактором для развития сокращения и расслабления сердечных миоцитов. Таким образом, управление гомеостазом внутриклеточного кальция с помощью SERCA2A имеет решающее значение для общей сердечной деятельности.[28] Обычно SUMO 1 активирует и стабилизирует SERCA2A за счет связывания лизиновых остатков 480 и 585. Взаимодействие между SUMO 1 и SERCA2A имеет решающее значение для регулирования уровней кальция внутри сердечных миоцитов. Снижение уровня белка SUMO 1 снижает SERCA2A и, таким образом, способствует эффективному усвоению кальция у пациентов с сердечной недостаточностью.[29]

Как мишень для наркотиков

SUMO 1 может быть важной терапевтической мишенью для улучшения работы сердца у пациентов с сердечной недостаточностью. В модели на мышах введение SUMO 1 посредством генной терапии было связано с улучшенной активностью SERCA2A, что привело к улучшению сердечной функции за счет увеличения сердечной сократимости.[29] Кроме того, сверхэкспрессия SUMO 1 приводит к ускоренному усвоению кальция, что дает дополнительные доказательства его важности для поддержания адекватного уровня кальция в клетках сердца. Этот конкретный сердечный белок может стать интересной и новой мишенью для лечения сердечной недостаточности в будущем.[29]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116030 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026021 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шен З., Пардингтон-Пуртимун ЧП, Комо Дж. К., Мойзис Р. К., Чен Д. Д. (сентябрь 1996 г.). «UBL1, убиквитиноподобный белок человека, связанный с белками RAD51 / RAD52 человека». Геномика. 36 (2): 271–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0462. PMID 8812453.
  6. ^ а б c Окура Т., Гонг Л., Камитани Т., Вада Т., Окура И., Вэй С.Ф., Чанг Х.М., Йе ET (ноябрь 1996 г.). «Защита от гибели клеток, опосредованной Fas / APO-1 и фактором некроза опухоли, с помощью нового белка, сентрина». Журнал иммунологии. 157 (10): 4277–81. PMID 8906799.
  7. ^ «Ген Entrez: супрессор SUMO1 SMT3 гомолога 1 mif two 3 (S. cerevisiae)».
  8. ^ Поус Э., Станье П. (декабрь 2007 г.). «Передача сигналов FGF и модификация SUMO: новые игроки в этиологии заячьей губы и / или неба». Тенденции в генетике. 23 (12): 631–40. Дои:10.1016 / j.tig.2007.09.002. PMID 17981355.
  9. ^ Диксон MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (2011). «Расщелина губы и неба: понимание генетических влияний и факторов окружающей среды». Природа Обзоры Генетика (12) 167-178.
  10. ^ «База данных молекулярных взаимодействий». Архивировано из оригинал на 2006-05-06.
  11. ^ а б Лин ДЙ, Ши Х.М. (июль 2002 г.). «Существенная роль белка микросфер весом 58 кДа в модуляции Daxx-зависимой репрессии транскрипции, что выявлено секвестрацией ядрышек». Журнал биологической химии. 277 (28): 25446–56. Дои:10.1074 / jbc.M200633200. PMID 11948183.
  12. ^ а б Ryu SW, Chae SK, Kim E (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Daxx, белка, связывающего Fas, с сентрином и Ubc9». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 279 (1): 6–10. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3882. PMID 11112409.
  13. ^ а б Иванчук С.М., Мондал С., Рутка Ю.Т. (июнь 2008 г.). «p14ARF взаимодействует с DAXX: влияет на HDM2 и p53». Клеточный цикл. 7 (12): 1836–50. Дои:10.4161 / cc.7.12.6025. PMID 18583933.
  14. ^ Канг Э.С., Пак CW, Чанг Дж.Х. (декабрь 2001 г.). «Dnmt3b, de novo ДНК-метилтрансфераза, взаимодействует с SUMO-1 и Ubc9 через свою N-концевую область и может быть модифицирована SUMO-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 289 (4): 862–8. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6057. PMID 11735126.
  15. ^ а б c Minty A, Dumont X, Kaghad M, Caput D (ноябрь 2000 г.). «Ковалентная модификация p73alpha с помощью SUMO-1. Двухгибридный скрининг с p73 идентифицирует новые взаимодействующие с SUMO-1 белки и мотив взаимодействия SUMO-1». Журнал биологической химии. 275 (46): 36316–23. Дои:10.1074 / jbc.M004293200. PMID 10961991.
  16. ^ Ли Б.Х., Ёсимацу К., Маэда А., Очиай К., Моримацу М., Араки К., Огино М., Морикава С., Арикава Дж. (Декабрь 2003 г.). «Ассоциация нуклеокапсидного белка хантавирусов Сеула и Хантаана с небольшими молекулами, родственными убиквитин-подобному модификатору-1». Вирусные исследования. 98 (1): 83–91. Дои:10.1016 / j.virusres.2003.09.001. PMID 14609633.
  17. ^ Кахио Т., Нисида Т., Ясуда Х. (сентябрь 2001 г.). «Участие PIAS1 в сумоилировании супрессора опухолей р53». Молекулярная клетка. 8 (3): 713–8. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00349-5. PMID 11583632.
  18. ^ Камитани Т., Нгуен Х.П., Кито К., Фукуда-Камитани Т., Йе ET (февраль 1998 г.). «Ковалентная модификация ПМЛ семейством сентринов убиквитиноподобных белков». Журнал биологической химии. 273 (6): 3117–20. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3117. PMID 9452416.
  19. ^ а б Татхам М.Х., Ким С., Ю Би, Джафрей Э, Сонг Дж, Чжэн Дж, Родригес М.С., Хэй РТ, Чен Й (август 2003 г.) «Роль N-концевого сайта Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия. 42 (33): 9959–69. Дои:10.1021 / bi0345283. PMID 12924945.
  20. ^ Гонг Л., Ли Б., Миллас С., Йе Э. Т. (апрель 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческих AOS1 и UBA2, компонентов комплекса ферментов, активирующих сентрин». Письма FEBS. 448 (1): 185–9. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00367-1. PMID 10217437. S2CID 7756078.
  21. ^ Ван Ю.Т., Чуанг Дж.Й., Шен М.Р., Ян В.Б., Чанг В.К., Хунг Дж.Д. (июль 2008 г.). «Сумоилирование специфичного белка 1 увеличивает его деградацию, изменяя локализацию и увеличивая протеолитический процесс специфичности белка 1». Журнал молекулярной биологии. 380 (5): 869–85. Дои:10.1016 / j.jmb.2008.05.043. PMID 18572193.
  22. ^ Hardeland U, Steinacher R, Jiricny J, Schär P (март 2002 г.). «Модификация тимин-ДНК-гликозилазы человека убиквитин-подобными белками способствует ферментативному обмену». Журнал EMBO. 21 (6): 1456–64. Дои:10.1093 / emboj / 21.6.1456. ЧВК 125358. PMID 11889051.
  23. ^ Liou ML, Liou HC (апрель 1999 г.). «Белок, гомологичный убиквитину, DAP-1, связывается с доменом смерти рецептора фактора некроза опухоли (p60) и вызывает апоптоз». Журнал биологической химии. 274 (15): 10145–53. Дои:10.1074 / jbc.274.15.10145. PMID 10187798.
  24. ^ а б Мао Ю., Десаи С.Д., Лю Л.Ф. (август 2000 г.). «Конъюгация SUMO-1 с изоферментами топоизомеразы II ДНК человека». Журнал биологической химии. 275 (34): 26066–73. Дои:10.1074 / jbc.M001831200. PMID 10862613.
  25. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
  26. ^ Шен З., Пардингтон-Пуртимун ЧП, Комо Дж. К., Мойзис Р. К., Чен Д. Д. (октябрь 1996 г.). «Ассоциации UBE2I с белками RAD52, UBL1, p53 и RAD51 в дрожжевой двугибридной системе». Геномика. 37 (2): 183–6. Дои:10.1006 / geno.1996.0540. PMID 8921390.
  27. ^ Шварц RJ, Yeh ET (2012). «Взвешивание сердечной недостаточности: роль СУМОилирования SERCA2a». Циркуляционные исследования. 110 (2): 198–9. Дои:10.1161 / RES.0b013e318246f187. PMID 22267837.
  28. ^ Periasamy M, Huke S (2001). «Уровень помпы SERCA является решающим фактором гомеостаза Ca (2+) и сократимости сердца». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 33 (6): 1053–63. Дои:10.1006 / jmcc.2001.1366. PMID 11444913.
  29. ^ а б c Хо С., Ли А., Чжон Д., О Дж. Дж., Чаанин А. Х., Кизана Е., Пак В. Дж., Хаджар Р. Дж. (2011). «SUMO1-зависимая модуляция SERCA2a при сердечной недостаточности». Природа. 477 (7366): 601–5. Дои:10.1038 / природа10407. ЧВК 3443490. PMID 21900893.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка