WikiDer > Суданский эболавирус

Sudan ebolavirus

Суданский эболавирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Учебный класс:Monjiviricetes
Заказ:Mononegavirales
Семья:Filoviridae
Род:Эболавирус
Разновидность:
Суданский эболавирус
Член вирус

Суданский вирус (SUDV)

В разновидность Суданский эболавирус это вирусологический таксон входит в род Эболавирус, семья Filoviridae, порядок Mononegavirales. Вид имеет один вирус член, Суданский вирус (СУДВ).[1] Члены этого вида называются суданскими эболавирусами.[1]

Номенклатура

Название Суданский эболавирус происходит от Судан (страна, в которой был впервые обнаружен суданский вирус) и таксономический суффикс эболавирус (что обозначает вид эболавируса).[1]

Вид был интродуцирован в 1998 г. как Судан вирус Эбола.[2][3] В 2002 году название было изменено на Суданский эболавирус.[4][5]

Вирус рода Эболавирус является членом вида Суданский эболавирус если:[1]

  • это эндемик в Судане и / или Уганда
  • у него есть геном с тремя перекрытиями генов (VP35/VP40, GP/VP30, VP24/L)
  • его геномная последовательность отличается от Вирус Эбола на ≥30%, но отличается от вируса Судана на <30%

Суданский вирус (SUDV) - один из шести известных вирусов в род Эболавирус и один из четырех, вызывающих Болезнь, вызванная вирусом Эбола (EVD) в люди и другие приматы; это единственный представитель вида Суданский эболавирус. СУДВ - это Выбрать агента, Всемирная организация здоровья Возбудитель группы риска 4 (требующий Защита, эквивалентная 4-му уровню биобезопасности), Национальные институты здоровья/Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний Приоритетный патоген категории А, Центры по контролю и профилактике заболеваний Агент биотерроризма категории А, и внесен в список в качестве биологического агента экспортного контроля Австралийская группа.

Первая известная вспышка БВВЭ произошла из-за вируса Судана в южный Судан в период с июня по ноябрь 1976 г., заразив 284 человека и убив 151, первый идентифицируемый случай произошел 27 июня 1976 г.[6][7][8]

Использование термина

Суданский вирус (сокращенно SUDV) был впервые описан в 1977 году.[9] Это единственный член разновидность Суданский эболавирус, который входит в род Эболавирус, семья Filoviridae, порядок Mononegavirales.[1] Название «Суданский вирус» происходит от юг Судан (где он был впервые обнаружен до отделения Южного Судана от Судана[10]) и таксономический суффикс вирус.

Предыдущие обозначения

Суданский вирус был впервые представлен как новый «штамм» вируса Эбола в 1977 году.[9] Суданский вирус был описан как «геморрагическая лихорадка Эбола» в отчете ВОЗ 1978 года, описывающем вспышку в Судане в 1976 году.[11] В 2000 году получил обозначение Суданский вирус Эбола.[12][13] а в 2002 году название было изменено на Суданский эболавирус.[4][5] Предыдущие сокращения для вируса были EBOV-S (для вируса Эбола в Судане), а совсем недавно - SEBOV (для суданского вируса Эбола или суданского эболавируса). Окончательное название вирус получил в 2010 году, когда он был переименован в Суданский вирус (SUDV).[1]

Критерии включения вирусов

Вирус вида Суданский эболавирус является суданским вирусом (SUDV), если он обладает свойствами суданских эболавирусов и если его геном отличается от прототипа суданского вируса, варианта суданского вируса Boniface (SUDV / Bon), на ≤10% в нуклеотид уровень.[1]

Болезнь

SUDV - один из четырех эболавирусов, вызывающих Болезнь, вызванная вирусом Эбола (БВВЭ) у людей (в литературе также часто называют геморрагической лихорадкой Эбола, КВЧ). БВВЭ, вызванный инфекцией SUDV, невозможно отличить от БВВЭ, вызванной другими эболавирусами, только на основании клинических наблюдений, поэтому клинические проявления и патология инфекций, вызванных всеми эболавирусами, представлены вместе на отдельной странице (см. Болезнь, вызванная вирусом Эбола). В прошлом SUDV вызывал следующие вспышки БВВЭ:[нужна цитата]

Болезнь, вызванная вирусом Эбола (БВВЭ) вспышки инфекции, вызванной суданским вирусом (СУДВ)
ГодГеографическое положениеСлучаи / смерти людей (летальность)
1976Джуба, Мариди, Нзара и Тембура, южный Судан284/151 (53%)
1979Нзара, южный Судан34/22 (65%)
2000–2001Гулу, Мбарара, и Масиндинские районы, Уганда425/224 (53%)
2004Округ Ямбио, южный Судан17/7 (41%)
2011Luweero District, Уганда1/1 (100%)
2014Экваториальная, Конго [14]0/1 * два штамма, один Судан и один Судан / Заир гибрид на 24.08.2014 (0%)

Исследование

Агентство общественного здравоохранения Канады имеет кандидатную вакцину против рВСВ против суданского эболавируса (рВСВ-СУДВ). Merck разрабатывал его, но прекратил разработку.[15]

Экология

Экология SUDV в настоящее время неясна, и ни один резервуар-хозяин еще не идентифицирован. Поэтому остается неясным, как SUDV неоднократно вводился в человеческие популяции. Летучие мыши подозреваются в том, что они содержат вирус, потому что инфекционные Марбургский вирус (MARV), отдаленно родственный филовирус, был выделен от летучих мышей,[16] и потому что следы (но не инфекционные частицы) более близких Вирус Эбола (EBOV) также были обнаружены у летучих мышей.[17]

Молекулярная биология

SUDV в основном не охарактеризован на молекулярном уровне. Однако его геномная последовательность, а вместе с ней и геномный организация и сохранение индивидуального открытые рамки для чтения, аналогичен таковому у других четырех известных эболавирусов. Поэтому в настоящее время предполагается, что знания, полученные для EBOV, могут быть экстраполированный в СУДВ и все СУДВ белки ведут себя аналогично EBOV.[нужна цитата]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм Kuhn, Jens H .; Беккер, Стефан; Эбихара, Хидеки; Geisbert, Thomas W .; Джонсон, Карл М .; Каваока, Ёсихиро; Липкин, В. Ян; Негредо, Ана I; и другие. (2010). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: классификация, названия таксонов и вирусов, а также аббревиатуры вирусов». Архив вирусологии. 155 (12): 2083–103. Дои:10.1007 / s00705-010-0814-х. ЧВК 3074192. PMID 21046175.
  2. ^ Нетесов, С. В .; Feldmann, H .; Jahrling, P. B .; Klenk, H.D .; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». In van Regenmortel, M.HV .; Fauquet, C.M .; Бишоп, Д. Х. Л .; Карстенс, Э.Б .; Эстес, М. К .; Lemon, S.M .; Maniloff, J .; Mayo, M. A .; McGeoch, D. J .; Pringle, C.R .; Викнер, Р. Б. (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Сан-Диего, США: Academic Press. С. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5.
  3. ^ Прингл, К. Р. (1998). «Таксономия вирусов - Сан-Диего 1998». Архив вирусологии. 143 (7): 1449–59. Дои:10.1007 / s007050050389. PMID 9742051. S2CID 13229117.
  4. ^ а б Feldmann, H .; Geisbert, T. W .; Jahrling, P. B .; Klenk, H.-D .; Нетесов, С. В .; Peters, C.J .; Sanchez, A .; Swanepoel, R .; Волчков, В. Е. (2005). «Семейство Filoviridae». In Fauquet, C.M .; Mayo, M. A .; Maniloff, J .; Desselberger, U .; Болл, Л. А. (ред.). Таксономия вирусов - восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Сан-Диего, США: Elsevier / Academic Press. С. 645–653. ISBN 978-0-12-370200-5{{противоречивые цитаты}}
  5. ^ а б Мэйо, М.А. (2002). «ICTV на парижском ICV: результаты пленарного заседания и биномиального голосования». Архив вирусологии. 147 (11): 2254–60. Дои:10.1007 / s007050200052. S2CID 43887711.
  6. ^ "Геморрагическая лихорадка Эбола в Судане, 1976 г." (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) 13 октября 2014 г.
  7. ^ Feldmann, H .; Гейсберт, Т. В. (2011). «Геморрагическая лихорадка Эбола». Ланцет. 377 (9768): 849–862. Дои:10.1016 / S0140-6736 (10) 60667-8. ЧВК 3406178. PMID 21084112.
  8. ^ Хоенен Т., Гросет А., Фельдманн Х (июль 2012 г.). «Современные вакцины против Эболы». Мнение эксперта Biol Ther. 12 (7): 859–72. Дои:10.1517/14712598.2012.685152. ЧВК 3422127. PMID 22559078.
  9. ^ а б Bowen, E. T. W .; Lloyd, G .; Harris, W. J .; Platt, G.S .; Baskerville, A .; Велла, Э. Э. (1977). «Вирусная геморрагическая лихорадка в южном Судане и северном Заире, предварительные исследования этиологического агента». Ланцет. 309 (8011): 571–3. Дои:10.1016 / с0140-6736 (77) 92001-3. PMID 65662. S2CID 3092094.
  10. ^ Нзара, Южный Судан
  11. ^ "Дома" (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) 13 октября 2014 г.. Получено 11 февраля 2015.
  12. ^ Нетесов, С. В .; Feldmann, H .; Jahrling, P. B .; Klenk, H.D .; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». In van Regenmortel, M.HV .; Fauquet, C.M .; Бишоп, Д. Х. Л .; Карстенс, Э.Б .; Эстес, М. К .; Lemon, S.M .; Maniloff, J .; Mayo, M. A .; McGeoch, D. J .; Pringle, C.R .; Викнер, Р. Б. (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Сан-Диего, США: Academic Press. С. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5{{противоречивые цитаты}}
  13. ^ Прингл, К. Р. (1998). «Таксономия вирусов - Сан-Диего 1998». Архив вирусологии. 143 (7): 1449–59. Дои:10.1007 / s007050050389. PMID 9742051. S2CID 13229117.
  14. ^ «Вспышка Эболы: ДР Конго подтвердила два случая смерти». BBC. 24 августа 2014 г.
  15. ^ «Ответ MSF на политику CEPI в отношении равного доступа». Кампания "Врачи без границ". При разработке вакцины важен доступ к ноу-хау. Знания и опыт, включая, помимо прочего, методы очистки, клеточные линии, материалы, программные коды и их передачу альтернативным производителям в случае, если победитель прекращает разработку перспективной вакцины, критически важны. Ярким тому примером является недавний отказ компании Merck от разработки вакцин против rVSV для Марбурга (rVSV-MARV) и для Судана-Эбола (rVSV-SUDV). Компания Merck продолжает сохранять жизненно важные ноу-хау на платформе rVSV, поскольку она разработала вакцину rVSV для Заир-Эбола (rVSV-ZEBOV) при финансовой поддержке ГАВИ. Хотя он передал права на эти вакцины обратно Агентству общественного здравоохранения Канады, нет никакого механизма, чтобы поделиться ноу-хау на платформе rVSV с другими разработчиками вакцин, которые хотели бы также использовать rVSV в качестве вектора против других патогенов.
  16. ^ Towner, J. S .; Amman, B.R .; Сили, Т. К .; Кэрролл, С. А. Р .; Comer, J. A .; Kemp, A .; Swanepoel, R .; Paddock, C.D .; Балинанди, С .; Христова, М.Л .; Форменти, П. Б .; Albarino, C.G .; Миллер, Д. М .; Рид, З. Д .; Kayiwa, J. T .; Mills, J. N .; Кэннон, Д. Л .; Грир, П. У .; Byaruhanga, E .; Farnon, E.C .; Atimnedi, P .; Okware, S .; Катонголе-Мбидде, Э .; Даунинг, Р.; Tappero, J. W .; Zaki, S. R .; Ksiazek, T. G .; Никол, С. Т .; Роллин, П. Э. (2009). Фушье, Рон А. М. (ред.). «Выделение генетически разнообразных вирусов Марбург из египетских летучих мышей». Патогены PLOS. 5 (7): e1000536. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000536. ЧВК 2713404. PMID 19649327.
  17. ^ Leroy, E.M .; Kumulungui, B .; Pourrut, X .; Rouquet, P .; Хассанин, А .; Yaba, P .; Délicat, A .; Paweska, J. T .; Gonzalez, J. P .; Свейнпол, Р. (2005). «Летучие мыши как резервуары вируса Эбола». Природа. 438 (7068): 575–576. Bibcode:2005Натура 438..575л. Дои:10.1038 / 438575a. PMID 16319873. S2CID 4403209.

внешняя ссылка