WikiDer > TDRD7

TDRD7
TDRD7
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTDRD7, CATC4, CTRCT36, PCTAIRE2BP, TRAP, tudor домен, содержащий 7
Внешние идентификаторыOMIM: 611258 MGI: 2140279 ГомолоГен: 8618 Генные карты: TDRD7
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение TDRD7
Геномное расположение TDRD7
Группа9q22.33Начинать97,412,096 бп[1]
Конец97,496,125 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TDRD7 213361 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001302884
NM_014290

NM_001290475
NM_146142
NM_001355189

RefSeq (белок)

NP_001289813
NP_055105

NP_001277404
NP_666254
NP_001342118

Расположение (UCSC)Chr 9: 97,41 - 97,5 МбChr 4: 45.97 - 46.03 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий тюдоровский домен 7 это белок что у людей кодируется TDRD7 ген.[5][6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена TDRD7 может регулироваться MITF.[7]

Полиморфизм генов

Были идентифицированы различные однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) гена TDRD7, и для некоторых из них показана связь с более низкой восприимчивостью к возрастной катаракте.[8]

Взаимодействия

TDRD7 был показан взаимодействовать с TACC1.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196116 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035517 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
  6. ^ "Entrez Gene: tudor домен TDRD7, содержащий 7".
  7. ^ Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус К., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергстейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Э. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Пигментная клетка Melanoma Res. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.
  8. ^ Чжэн Ц., Ву М., Хе Ц.Й., Ан XJ, Сун М., Чен Ц.Л., Е Дж. (Февраль 2014 г.) «Полиморфизмы гена TDRD7 компонента гранул РНК в популяции ханьских китайцев с возрастной катарактой». J. Int. Med. Res. 42 (1): 153–63. Дои:10.1177/0300060513504702. PMID 24435515.
  9. ^ Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (ноябрь 2003 г.). «Белковый комплекс TACC1-chTOG-Aurora A при раке груди». Онкоген. 22 (50): 8102–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1206972. PMID 14603251.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8NHU6 (Белок 7, содержащий домен Tudor человека) на PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8K1H1 (Белок 7, содержащий Tudor-домен мыши) на PDBe-KB.