WikiDer > Транспорт в 1

Transportin 1
TNPO1
Белок TNPO1 PDB 1qbk.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTNPO1, IPO2, KPNB2, MIP, MIP1, TRN, Transportin 1
Внешние идентификаторыOMIM: 602901 MGI: 2681523 ГомолоГен: 5358 Генные карты: TNPO1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение TNPO1
Геномное расположение TNPO1
Группа5q13.2Начните72,816,312 бп[1]
Конец72,916,733 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TNPO1 207657 x at fs.png

PBB GE TNPO1 221829 s at fs.png

PBB GE TNPO1 209225 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002270
NM_153188

NM_001048267
NM_178716

RefSeq (белок)

NP_001041732
NP_848831

Расположение (UCSC)Chr 5: 72,82 - 72,92 МбChr 13: 98,84 - 98,93 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Транспортин-1 (или Импортин-β 2) это белок что у людей кодируется TNPO1 ген.[5][6][7]

Функция

Этот белок представляет собой кариоферин который взаимодействует с последовательность ядерной локализации для нацеливания ядерных белков на ядро. Классический рецепторный комплекс кариоферина, такой как комплекс, в котором используется Импортин-β1 (кодируется геном КПНБ1), представляет собой гетеродимер альфа-субъединицы, которая распознает сигнал ядерной локализации, и бета-субъединицы, которая присоединяет комплекс к нуклеопоринам. Однако Transportin-1 может напрямую связываться с белками-грузами, и для этого может не потребоваться альфа-субъединица импортина.[8]

Считается, что Transportin-1 использует тот же основной механизм для осуществления ядерного транспорта, что и другие импорттины. Он обеспечивает стыковку с ядерный поровый комплекс через привязку к нуклеопорин и впоследствии перемещается через поры с помощью механизма, требующего энергии. Затем в ядре Ran связывается с Transportin-1, он диссоциирует от груза, и Transportin-1 реэкспортируется из ядра в цитоплазму, где гидролиз GTP высвобождает Ran. Тогда Transportin-1 может привязать новый груз.

Кроме того, Transportin-1 участвует в транспортировке белка в первичный ресничка.[9] Считается, что в этом случае функция Transportin-1 аналогична переносу белков в ядро ​​через ядерную пору. Transportin-1 связывает груз, а затем помогает ему пройти через пору в основании реснички. В этом механизме также участвуют Ran и нуклеопорины.[10]

Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные белки.[7]

Цели

Транспортин 1 (TRN1) является частью неклассического ядерного пути импорта. В сочетании с RanGTP каскад гидролиза TRN1 действует, чтобы импортировать выбранные белки в ядро ​​клетки. Эти мишени обычно содержат мотив PY, иначе известный как сигнал ядерной локализации M9. Хорошо описанные примеры включают hnRNP A1.[11]

Тип грузовых белков, которые Транспортин 1 может переносить в ядро, включает РНК-связывающие белки (такие как hnRNP A1 и hnRNP F), а также рибосомные белки.[12]

Клиническое значение

TRN1 участвует в патогенезе двух нейродегенеративных заболеваний, а именно Боковой амиотрофический склероз и лобно-височная деменция.[13]

Взаимодействия

Transportin 1 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000083312 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009470 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Поллард В.М., Майкл В.М., Накельни С., Сиоми М.С., Ван Ф., Дрейфус Г. (декабрь 1996 г.). «Новый рецептор-опосредованный путь импорта ядерного белка». Ячейка. 86 (6): 985–94. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80173-7. PMID 8808633. S2CID 15666255.
  6. ^ Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (июнь 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (10): 5055–60. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК 24630. PMID 9144189.
  7. ^ а б «Энтрез Ген: TNPO1 транспортин 1».
  8. ^ Р.А. Фриделл (1997). Ядерный импорт hnRNP A1 опосредуется новым клеточным кофактором, связанным с кариоферином-бета.. Journal of Cell Science 1997 110: 1325-1331;
  9. ^ Тоби В. Херд (2011). Локализация пигментного ретинита 2 в ресничках регулируется импортином β2.. J Cell Sci 2011 124: 718-726; DOI: 10.1242 / jcs.070839
  10. ^ Ки Х.Л. (2012). Барьер проницаемости для исключения размера и нуклеопорины характеризуют комплекс пор ресничек, который регулирует транспорт в реснички.. Nat. Cell Biol. 2012 4 марта; 14 (4): 431-7. DOI: 10,1038 / NCB2450.
  11. ^ Dormann D, Rodde R, Edbauer D, Bentmann E, Fischer I, Hruscha A, Than ME, Mackenzie IR, Capell A, Schmid B, Neumann M, Haass C (август 2010). «Мутации, связанные с БАС, слитые в саркоме (FUS), нарушают опосредованный транспортином ядерный импорт». EMBO J. 29 (16): 2841–57. Дои:10.1038 / emboj.2010.143. ЧВК 2924641. PMID 20606625.
  12. ^ Анн-Кристин Стрём (2001). Импортин-бета-подобные рецепторы ядерного транспорта. Genome Biol. 2001; 2 (6): обзоры3008.1 – обзоры3008.9.
  13. ^ Брелстафф Дж., Лэшли Т., Холтон Дж. Л., Лис А. Дж., Россор М. Н., Бандопадхьяй Р., Ревес Т. (ноябрь 2011 г.). «Транспортин-1: маркер FTLD-FUS». Acta Neuropathol. 122 (5): 591–600. Дои:10.1007 / s00401-011-0863-6. PMID 21847626. S2CID 5913873.
  14. ^ Цай И, Мяо С.Ю., Ван Л.Ф. (октябрь 2001 г.). «[Определение сайта связывания семенников-специфического нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их комбинации in vitro]». Чжунго И Сюэ Кэ Сюэ Юань Сюэ Бао (на китайском языке). 23 (5): 462–6. PMID 12905863.
  15. ^ Чук Ю.М., Блобель Г. (май 1999 г.). «Структура ядерного транспортного комплекса кариоферин-бета2-Ran x GppNHp». Природа. 399 (6733): 230–7. Дои:10.1038/20375. PMID 10353245. S2CID 4413233.
  16. ^ Шамшер М.К., Плоски Дж., Раду А. (октябрь 2002 г.). «Кариоферин бета 2B участвует в экспорте мРНК из ядра». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (22): 14195–9. Дои:10.1073 / pnas.212518199. ЧВК 137860. PMID 12384575.

дальнейшее чтение