WikiDer > Трепонема
Трепонема это род спиралевидный бактерии. Основными видами трепонем патогенов человека являются: Бледная трепонема, подвиды которых вызывают такие заболевания, как сифилис, Bejel, и фрамбезия. Treponema carateum является причиной пинта.[2] Treponema paraluiscuniculi связан с сифилисом в кролики.[3] Treponema succinifaciens был обнаружен в кишечном микробиоме традиционных сельских жителей.[4]
Филогения
Филогения основана на высвобождении 123 LTP на основе 16S рРНК Проект "Все виды живого дерева".[5]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Таксономия
В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)[6] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI).[7]
- ?Candidatus Treponema suis Molbak et al. 2006 г.
- ?Treponema calligyrum ♠ Ногучи
- ?Treponema carateum ♥ (пинта-вызывающий Трепонема)
- ?Treponema minutum ♦ Добелл 1912
- ?Бледная трепонема ♦ (Шаудинн и Хоффманн 1905 г.) Шаудинн 1905 г.
- Т. П. эндемикум ♠ Смиберт 1984 (Bejel-вызывающий Трепонема)
- Т. П. паллидум ♠ (Шаудинн и Хоффманн 1905 г.) Шаудинн 1905 г. (сифилис-вызывающий Трепонема)
- Т. П. право ♠ Смиберт 1984 (фрамбезия-вызывающий Трепонема)
- ?Treponema paraluisleporis ♠ Lumeij et al. 1994 г.
- ?Treponema paraluiscuniculi ♦ (Якобсталь 1920) Смиберт 1974
- ?Treponema pertenue ♦ (Кастеллани 1905) Кастеллани и Чалмерс 1910
- ?Treponema phagedenis ♠
- Т. П. фагеденис ♠ (Ногучи 1912) Brumpt
- Т. П. Vaccae ♠ Evans et al. 2006 г.
- ?Treponema refringens ♠ (Шаудинн и Хофманн 1905) Кастеллани и Чалмерс
- ?Treponema vincentii ♠ Смиберт 1984
- ?Treponema zioleckii ♠ Пикнова и др. 2008 г.
- Treponema amylovorum Wyss et al. 1997 г.
- Treponema azotonutricium Graber et al. 2004 г.
- Treponema berlinense Nordhoff et al. 2005 г.
- Treponema brennaborense Schrank et al. 1999 г.
- Treponema bryantii Стэнтон и Канале-Парола 1980
- Treponema caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013
- Treponema denticola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993 г.
- Treponema isoptericolens Dröge et al. 2008 г.
- Treponema lecithinolyticum Wyss et al. 1999 г.
- Treponema maltophilum Wyss et al. 1996 г.
- Трепонема средняя ♦ Умемото и др. 1997 г.
- Т. м. Bovis ♠ Evans et al. 2006 г.
- Т. м. средний ♠ Умемото и др. 1997 г.
- Treponema parvum Wyss et al. 2001 г.
- Treponema pectinovorum Смиберт и Бурмейстер, 1983 г.
- Treponema pedis Evans et al. 2009 г.
- Treponema porcinum Nordhoff et al. 2005 г.
- Treponema primitia Graber et al. 2004 г.
- Treponema putidum Wyss et al. 2004 г.
- Treponema saccharophilum Пастер и Канале-Парола 1986
- Treponema socranskii Smibert et al. 1984
- Т. с. Паредис Smibert et al. 1984
- Т. с. буккале Smibert et al. 1984
- Т. с. Сокранский Smibert et al. 1984
- Стенострепт трепонемы (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013
- Treponema succinifaciens Cwyk и Canale-Parola 1981
- Treponema zuelzerae (бывший Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 исправить. Abt, Göker & Klenk, 2013 г.
Примечания:
♦ Тип штамма утерян или недоступен
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)
♥ Штаммы, не попавшие в Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) или перечисленные в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)
Виды Treponema hyodysenteriae и Treponema innocens были реклассифицированы в Serpulina hyodysenteriae и Серпулина невинная.[8]
Рекомендации
- ^ "Трепонема" (HTML). Таксономия NCBI. Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации.. Получено 27 февраля 2019.
- ^ Antal GM, Lukehart SA, Meheus AZ (январь 2002 г.). «Эндемические трепонематозы». Микробы заражают. 4 (1): 83–94. Дои:10.1016 / S1286-4579 (01) 01513-1. PMID 11825779.
- ^ Харпер К.Н., Лю Х., Окампо П.С. и др. (Август 2008 г.). "Последовательность гена кислого повторяющегося белка (arp) отличает венерический от не венерического Бледная трепонема подвид, и ген развился в результате сильного положительного отбора в подвиде, вызывающем сифилис ". ФЭМС Иммунол. Med. Микробиол. 53 (3): 322–32. Дои:10.1111 / j.1574-695X.2008.00427.x. PMID 18554302. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
- ^ Ангелакис Э., Бачар Д., Ясир М., Муссо Д., Джоссу Ф., Габорит Б. и др. (Январь 2019). «Виды Treponema обогащают кишечную микробиоту традиционных сельских жителей, но отсутствуют у городских жителей». Новые микробы и новые инфекции. 27: 14–21. Дои:10.1016 / j.nmni.2018.10.009. ЧВК 6276622. PMID 30555706.
- ^ Проект "Все виды живого дерева".«Релиз 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2013-03-20.
- ^ J.P. Euzéby. "Трепонема". Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2016-03-20.
- ^ Сэйерс; и другие. "Трепонема". Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2016-03-20.
- ^ Стэнтон ТБ, Дженсен Н.С., Кейси Т.А., Тордофф Л.А., Дьюхерст Ф.И., Пастер Б.Дж. (январь 1991 г.). "Реклассификация Treponema hyodysenteriae и Treponema innocens в новом роде Serpula gen. nov., как Serpula hyodysenteriae comb. ноя и Serpula innocens comb. ноя ". Int. J. Syst. Бактериол. 41 (1): 50–8. Дои:10.1099/00207713-41-1-50. PMID 1704792.