WikiDer > Белок, содержащий повторы WD 77

WD repeat-containing protein 77

WDR77

Доступные конструкции

Поиск ортолога: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
4GQB, 4X60, 4X61, 4X63, 5EMJ, 5EML, 5EMM, 5FA5, 5ЭМК, 5C9Z

Идентификаторы

Псевдонимы

WDR77, MEP-50, MEP50, Nbla10071, p44, p44 / Mep50, HKMT1069, домен повтора WD 77

Внешние идентификаторы

OMIM: 611734 MGI: 1917715 ГомолоГен: 11466 Генные карты: WDR77

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 1 (человек)^[1]

Группа	1п13.2	Начните	111,439,890 бп^[1]
Группа	1п13.2	Конец	111,449,256 бп^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 3 (мышь)^[2]

Группа	3 \| 3 F2.2	Начните	105,959,369 бп^[2]
Группа	3 \| 3 F2.2	Конец	105,970,037 бп^[2]

Экспрессия РНК шаблон

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание метил-CpG • GO: 0001948 связывание с белками • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • протеин-аргинин-N-метилтрансферазная активность
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • аппарат Гольджи • метилосома • нуклеоплазма • ядро клетки
Биологический процесс	• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • дифференцировка секреторных столбчатых люминарных эпителиальных клеток, участвующих в развитии ацинуса предстательной железы • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток, участвующих в развитии предстательной железы • положительное регулирование пролиферации клеток • отрицательное регулирование пролиферации клеток • пептидил-аргинин N-метилирование • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах • сплайсосомальная сборка snRNP
Источники:Amigo / QuickGO

Ортологи

Виды

Человек

Мышь


79084


70465

Ансамбль


ENSG00000116455


ENSMUSG00000000561


Q9BQA1


Q99J09

RefSeq (мРНК)


NM_024102 NM_001317062 NM_001317063 NM_001317064


NM_027432

RefSeq (белок)


NP_001303991 NP_001303992 NP_001303993 NP_077007


NP_081708

Расположение (UCSC)

Chr 1: 111.44 - 111.45 Мб

Chr 3: 105.96 - 105.97 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Метилосомный белок 50 это белок что у людей кодируется WDR77 ген.^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что белок 77, содержащий повторы WD, взаимодействовать с участием CTDP1^[8] и Белок аргининметилтрансфераза 5.^[5]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116455 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000000561 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). «Новый компонент повторяющегося белка WD метилосомы связывает белки Sm». J Biol Chem. 277 (10): 8243–7. Дои:10.1074 / jbc.M109984200. PMID 11756452.
^ Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (июнь 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
^ "Энтрез Ген: WDR77 WD повторный домен 77".
^ Личкардо, Паоло; Аменте Стефано; Руджеро Лука; Монти Мария; Пуччи Пьеро; Ланя Луиджи; Majello Barbara (февраль 2003 г.). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом метилосомного комплекса, участвующего в сборке snRNP». Нуклеиновые кислоты Res. Англия. 31 (3): 999–1005. Дои:10.1093 / нар / gkg197. ЧВК 149217. PMID 12560496.

дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Личкардо П., Аменте С., Руджеро Л. и др. (2003). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом метилосомного комплекса, участвующего в сборке snRNP». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (3): 999–1005. Дои:10.1093 / нар / gkg197. ЧВК 149217. PMID 12560496.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Ямада С., Охира М., Хори Х. и др. (2004). «Профилирование экспрессии и дифференциальный скрининг между гепатобластомами и соответствующей нормальной печенью: идентификация высокой экспрессии онкогена PLK1 как плохого прогностического индикатора гепатобластом». Онкоген. 23 (35): 5901–11. Дои:10.1038 / sj.onc.1207782. PMID 15221005.
Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Аменте С., Наполитано Г., Личкардо П. и др. (2005). «Идентификация белков, взаимодействующих с фосфатазой RNAPII FCP1: FCP1 образует комплекс с аргининметилтрансферазой PRMT5 и является субстратом для метилирования, опосредованного PRMT5». FEBS Lett. 579 (3): 683–9. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.12.045. PMID 15670829.
Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006Натура.441..315Г. Дои:10.1038 / природа04727. PMID 16710414.
Фуруно К., Масацугу Т., Сонода М. и др. (2006). «Ассоциация Polycomb группы SUZ12 с белком WD-повтора MEP50, который селективно связывается с гистоном H2A in vitro». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 345 (3): 1051–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.05.014. PMID 16712789.
Чжоу Л., Ву Х, Ли П, Ван Зи (2007). «Роль кофактора рецептора андрогена p44 в росте эпителиальных клеток простаты». J. Mol. Эндокринол. 37 (2): 283–300. Дои:10.1677 / jme.1.02062. PMID 17032745.
Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Лян Дж. Дж., Ван З., Чирибога Л. и др. (2007). «Экспрессия и функция коактиватора рецептора андрогена p44 и протеина аргининметилтрансферазы 5 в развивающихся яичках и опухолях яичек». Дж. Урол. 177 (5): 1918–22. Дои:10.1016 / j.juro.2007.01.017. PMID 17437848.

Rengasamy, M, Zhang, F, Vashisht, A, Song, WM, et al. (2017). «Комплекс PRMT5 / WDR77 регулирует альтернативный сплайсинг через ZNF326 при раке груди». Нуклеиновые кислоты Res. 45 (19): 11106–11120. Дои:10.1093 / нар / gkx727. PMID 28977470.

внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9BQA1 (Метилосомный белок 50) на PDBe-KB.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.