Waisai ist eine Stadt (kota) an der Südküste der Insel waigeo. Waigeo ist auf dem Äquator vor der Küste der Vogelkopf, der äußerste Nordwesten von Neu Guinea. Die Stadt liegt im Westen der Indonesisch Provinz West-Papua (Papua Barat) und ist das Verwaltungszentrum der Raja Ampat Inseln. Es ist ein Verkehrsknotenpunkt für Reisende, die diesen Archipel besuchen. Es gibt einen Flughafen, der von größeren Orten in der Nähe erreicht werden kann, wie z manado und sorong. Es gibt auch eine Fährverbindung mit Sorong. Es gibt mehrere touristische Einrichtungen mit zwei Stränden und Zentren für Sporttaucher.