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DNA-bindingsdomein
Beispiel einer DNA-Bindungsdomäne im Kontext eines Proteins. Es N-TerminusDNA-bindende Domäne (markiert) des Lac Suppressor wird geregelt durch a C-TerminusRegeldomäne (getaggt). Die Regeldomäne bindet an a allosterisch Effektormolekül (grün). Die allosterische Antwort des Proteins wird durch die Kontrolldomäne an die DNA-Bindungsdomäne durch die verknüpfte Region weitergegeben.[1]

EIN DNA-Bindungsdomäne oder DBD (Englisch: DNA-Bindungsdomäne) ist ein unabhängig gefaltetes Proteindomäne mit mindestens einem Motiv das doppel- oder einzelsträngigDNA erkennt. Eine DNA-Bindungsdomäne erkennt ein spezifisches DNA-Sequenz oder hat eine allgemeine Affinität zu DNA.[2] In einigen DNA-Bindungsdomänen kann die gefaltete Struktur auch enthalten Nukleinsäuren Aussehen.

Funktion

Eine oder mehrere DNA-Bindungsdomänen sind oft Teil eines größeren Proteins, das aus hinzugefügten Proteindomänen mit unterschiedlichen Funktionen besteht. Die hinzugefügten Domänen regulieren oft die Aktivität der DNA-Bindungsdomäne. Die Funktion der DNA-Bindung ist entweder strukturell oder beteiligt sich an der Regulation der Transkription, wobei sich beide Funktionen manchmal überschneiden.

DNA-Bindungsdomänen mit einer Funktion, die die Struktur der DNA betrifft, spielen eine biologische Rolle in biological Reproduzieren, Reparatur, Lager und Veränderung der DNA, wie z DNA-Methylierung.

Viele Proteine, die an der Verordnung der Genexpression enthalten DNA-Bindungsdomänen. Zum Beispiel Proteine, die Transkription regulieren durch Bindung an DNA Transkriptionsfaktoren erwähnt. Der letzte Effekt der meisten aufeinanderfolgenden Signalübertragungen Genregulation in einer Zelle.

DNA-Bindungsdomänen interagieren mit dem DNA-Nukleotide auf einen DNA-spezifische Sequenz oder unspezifisch sequentiell, aber auch bei unspezifischer Sequenzerkennung existiert eine gewisse molekulare Komplementarität zwischen Protein und DNA. Die DNA-Erkennung durch die DNA-Bindungsdomäne kann auf dem großen oder kleiner Steinbruch der DNA oder auf dem DesoxyribosephosphatRückgrat der DNA. Eine bestimmte Art der DNA-Erkennung ist an die Funktion des Proteins angepasst. Zum Beispiel schneidet das DNA-schneidende Enzym DNAse I die DNA ist fast zufällig und muss daher an einer unspezifischen Sequenz an die DNA binden. DNAse I erkennt aber auch eine bestimmte dreidimensionale DNA-Struktur und liefert damit ein etwas spezifisches DNA-Schnittmuster, das bei der DNA-Erkennung im DNA-Forschung (sogenannt DNA-Fußabdrücke).

Viele DNA-bindende Domänen müssen in der Lage sein, spezifische DNA-Sequenzen zu erkennen, wie DNA-bindende Domänen von Transkriptionsfaktoren, die bestimmte Gene aktivieren, oder Domänen von Enzymen, die DNA an bestimmten Stellen modifizieren, wie z Restriktionsenzyme und Telomerase. Es Wasserstoffbrückenmuster im großen Groove der DNA ist weniger degenerieren als die der kleinen Furche, wodurch die große Furche besser für die Erkennung einer spezifischen DNA-Sequenz geeignet ist.

Siehe auch