WikiDer > Генографический проект

Genographic Project
Не путать с бизнесом компьютерной графики Гениграфика.
Генографический проект
Часть серия на
Генетическая генеалогия
Концепции
похожие темы

В Генографический проект, запущенный 13 апреля 2005 г. Национальное географическое общество, был генетический антропологический исследование (продажи прекращены 31 мая 2019 г.), цель которого - составить карту исторических моделей миграции людей путем сбора и анализа ДНК образцы.[1] Текущая фаза проекта - Geno 2.0 Next Generation.[2] По состоянию на 2019 год к проекту присоединились около миллиона участников из более чем 140 стран.[3]

История проекта

Филогения гаплогрупп митохондриальной ДНК

Начало

Создано и возглавляется директором проекта Спенсер Уэллс в 2005 году «Генографический проект» - это некоммерческое сотрудничество, финансируемое из частных источников, между Национальное географическое общество и Фонд Вайтта. Полевые исследователи в одиннадцати региональных центрах по всему миру сначала начали со сбора образцов ДНК из местный населения. С осени 2015 года Проектом руководит Мигель Вилар.

Осенью 2012 года Генографический проект объявил о завершении нового массива генотипирования, посвященного генетическая антропология, называется GenoChip. GenoChip специально разработан для антропологического тестирования и включает: SNP из аутосомная ДНК, Х-хромосома ДНК, ДНК Y-хромосомы и митохондриальная ДНК (мтДНК). Дизайн нового чипа стал результатом совместных усилий Wells of National Geographic, Эран Эльхайк из Джонс Хопкинс, Семейное древо ДНК, и Иллюмина.[4]

Осенью 2015 года совместными усилиями Вилара, ведущего ученого-генографа, и Family Tree DNA был разработан новый чип.

Весной 2019 года было объявлено, что проект Geno завершился, но результаты будут до 2020 года. В июле 2020 года сайт был закрыт.

Geno 2.0

Анализ аутосомных примесей, разработанный Уэллсом и Эльхайком, классифицирует людей, оценивая их пропорции геномного происхождения, связанные с девятью наследственными регионами: Восточноазиатский, Средиземноморский, Южноафриканский, Юго-Западный Азиатский, Океанский, Юго-Восточный Азиатский, Североевропейский, Африканский к югу от Сахары и Коренной Американец.[5]

численность населенияСредиземноморьеСеверная ЕвропаЮго-Западная АзияАфрика к югу от СахарыЮжноафриканскийВосточная АзияЮго восточный азиатКоренной американецОкеаническийОбщий
Алтайский2172253498
Индейцы45348399
Бермудский1520748374100
Британский335017100
болгарский4731202100
Китайский7228100
Датский30531699
Доминиканский2911147111495
Восточно-Индийский224350299
Египтянин65181497
Финский175717798
Грузинский6173199
Немецкий36461799
Греческий54281799
Иберийский48371398
Иранский42842597
Японский7525100
Хойсан475299
Кинх5743100
Кувейт574278298
Ливанский66526299
Лухья289899
Малагасийский2574152098
Мексиканский28208423698
Монгольский612679498
Северный Кавказ461633499
Северная Индия6534262798
Океанический1288100
Папуас5491100
Хайленд Перуанский229599
Перуанцы1510326898
пуэрториканец312192521199
румынский4336192100
Россияне255118498
Сардинский6724899
Южный индийский42583599
Таджикистан2222441098
Татарский2140211698
Тунисский6261019299
Тосканский54281799
Вануату4157897
Западная Индия96582699
Люди йоруба973100

Geno 2.0 Следующее поколение

Процент основных гаплогрупп Y-ДНК в Европе

В 2016 году в проекте начали использовать самые современные[2] Спираль Секвенирование ДНК для Geno 2.0 Next Generation,[2][6] текущий этап Генографического проекта. По сравнению с предыдущими этапами, на которых использовались девять региональных филиалов, Geno 2.0 Next Generation анализирует современные коренные народы во всем мире, используя 18 или 22 региональных филиала.[7] Используя набор для сбора ДНК, Helix берет образец слюны у участника, который затем анализируется на предмет геномных идентификаторов, которые предлагают беспрецедентные возможности.[2] понимание генетического происхождения человека.[2] Затем данные загружаются в базу данных ДНК Генографического проекта.[2]

Волонтерское участие

Участие общественности в генографическом проекте

С 2005 по 2019 год нанимали волонтеров Genographic (для работы на местах и ​​предоставления образцов ДНК) и гражданская наука проекты. В это время Национальное географическое общество продавало некоммерческие наборы для самопроверки представителям широкой общественности, которые хотели участвовать в проекте в качестве «гражданских ученых». Такой охват общественности для участия в исследованиях поощряется такими организациями, как Международное общество генетической генеалогии (ISOGG), которая стремится продвигать преимущества научных исследований.[8][9][10] Это включает поддержку, организацию и распространение личное ДНК (генетическое) тестирование.

ISOGG поддерживает участие граждан в генетических исследованиях,[11] и считает, что такие добровольцы предоставили ценную информацию и исследования профессиональному научному сообществу.[12]

В своем выступлении перед Генеалогическим обществом Южной Калифорнии в 2013 г. Уэллс обсудил его поощрение гражданских ученых:

С 2005 года в рамках Генографического проекта используются новейшие генетические технологии для расширения наших знаний о человеческой истории, а его новаторское использование тестирования ДНК для вовлечения и вовлечения общественности в исследовательские усилия помогло создать новое поколение "гражданин ученый.«Geno 2.0 расширяет возможности гражданской науки, используя силу толпа открыть новые подробности истории человечества.[13]

Критика

Смотрите также: Археология Америки и Модели миграции в Новый Свет

Вскоре после анонса проекта в апреле 2005 г. Совет коренных народов по биоколониализму (IPCB), базирующаяся в Неваде, выпустила заявление с критикой проекта: представители отметили его связь с противоречивыми вопросами (такими как обеспокоенность некоторых племен тем, что результаты генетических исследований миграции человека могут указывать на то, что Коренные американцы не являются коренными жителями Северной Америки), выращенные Проект разнообразия генома человека, в отличие от финансируемого из частных источников Генографического проекта. IPCB не рекомендовал участвовать коренным народам.[14] Он также рекомендовал коренным народам бойкотировать IBM, Компьютеры шлюза, и National Geographic, которые в то время сотрудничали в Генографическом проекте.

В мае 2006 г. некоторые представители коренных народов посетили Постоянный форум ООН по вопросам коренных народов (UNPFII) для участия в генетическом тестировании. Представитель сказал:

<< Генографический проект является эксплуататорским и неэтичным, поскольку он будет использовать коренные народы в качестве объектов научного интереса в исследованиях, которые не принесут пользы коренным народам, но подвергнут их значительному риску. Исследователи будут брать образцы крови или других тканей тела для собственного использования в чтобы продвигать свои собственные умозрительные теории истории человечества ».[1]

ЮНПФИ провел расследование целей Генографического проекта и пришел к выводу, что, поскольку проект был «задуман и начат без надлежащих консультаций или без учета рисков для его субъектов, коренных народов, Совет по ответственной генетике заключает, что Представители коренных народов правы, и проект следует немедленно приостановить ».[1]

Примерно в мае 2006 года UNPFII рекомендовал National Geographic и другим спонсорам приостановить проект.[15][16] Высказывались опасения, что знания, полученные в результате исследования, могут противоречить давно укоренившимся убеждениям коренных народов и угрожать их культуре. Высказывались также опасения, что претензии коренных народов на земельные права и другие ресурсы могут оказаться под угрозой.

По состоянию на декабрь 2006 г., немного федерально признанные племена в США отказались от участия в исследовании. "Ученые пытаются доказать, что мы такие же, как Паломники Кроме мы пришли несколько тысяч лет назад ", - сказал Морис Фокс, председатель Массачусетской комиссии по делам индейцев и член Машпи Вампаноаг. "Почему мы должны давать им это открыто?"[15] Не все народы согласны с его позицией; по состоянию на декабрь 2012 г.к проекту присоединились более 70 000 представителей коренных народов из Америки, Африки, Азии, Европы и Океании.[7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c «Архивная копия». Архивировано из оригинал 16 мая 2008 г.. Получено 16 мая 2015.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  2. ^ а б c d е ж Geno 2.0 Следующее поколение Национальная география. 28 июня, 2018. Проверено 28 июня, 2018.
  3. ^ Участники-волонтеры по генографии Национальная география. 8 января 2018 г. Проверено 28 июня 2018 г.
  4. ^ GenoChip: новый инструмент генетической антропологии Оксфордские журналы. 9 мая, 2013. Проверено 28 июня, 2018.
  5. ^ Кто я: Обзор регионов
  6. ^ Секвенирование ДНК спирали и Geno 2.0 Спираль. 26 января 2018 г. Проверено 28 июня 2018 г.
  7. ^ а б Эталонные популяции следующего поколения Национальная география. 23 февраля 2018 г. Проверено 28 июня 2018 г.
  8. ^ Бонни, Р. и Лабранш, М. (2004). «Гражданская наука: вовлечение общественности в исследования», Размеры ASTC, Май / июнь 2004 г., стр. 13.
  9. ^ Баретто К., Фастовский Д. и Шихан П. (2003). «Модель интеграции общественности в научные исследования», Журнал геолого-геофизического образования, 50 (1). С. 71–75.
  10. ^ Маккаффри, Р. (2005). «Использование гражданской науки в исследованиях городских птиц», Городская среда обитания, 3 (1). С. 70–86.
  11. ^ Король, Тури Э .; Джоблинг, Марк А. (2009). «Что в имени? Y-хромосомы, фамилии и революция в генетической генеалогии». Тенденции в генетике. 25 (8): 351–60. Дои:10.1016 / j.tig.2009.06.003. HDL:2381/8106. PMID 19665817. Международное общество генетической генеалогии (www.isogg.org) выступает за использование генетики в качестве инструмента генеалогических исследований и обеспечивает сеть поддержки специалистов по генетической генеалогии. На нем размещается дерево Y-гаплогруппы ISOGG, которое регулярно обновляется.
  12. ^ Mendex и др., Фернандо (28 февраля 2013 г.). «Афроамериканец по отцовской линии добавляет чрезвычайно древний корень к филогенетическому дереву Y-хромосомы человека». Американское общество генетики человека. стр. 454–459. Получено 10 июля 2013.
  13. ^ Уэллс, Спенсер (2013). «Генографический проект и рост гражданской науки». Генеалогическое общество Южной Калифорнии (SCGS). Архивировано из оригинал 10 июля 2013 г.. Получено 10 июля, 2013.
  14. ^ Гарри, Дебра и Леа Малия Канехе. "Генетические исследования: сбор крови для сохранения культуры?" Культурное выживание, 29,4 (зима 2005 г.). По состоянию на 4 февраля 2014 г.
  15. ^ а б Хармон, Эми (10 декабря 2006 г.). "Сборщики ДНК - загвоздка: племена им не доверяют". Нью-Йорк Таймс.
  16. ^ "Организация Объединенных Наций рекомендует прекратить генографический проект". ipcb.

внешняя ссылка

Официальные сайты

Новостные статьи

Ролики