WikiDer > Утечка сканирования

Leaky scanning

Утечка сканирования это механизм, используемый на этапе инициации эукариотический перевод что позволяет регулировать экспрессия гена. Во время инициации малый 40S рибосомальная субъединица (как 43S PIC) "сканирует" или перемещается в направлении 5 '-> 3' вдоль 5'UTR найти стартовый кодон для начала удлинения. Иногда сканирующая рибосома обходит начальный стартовый кодон AUG и начинает трансляцию с последующих стартовых кодонов AUG.[1] Трансляция в эукариотических клетках в соответствии с большинством механизмов сканирования происходит в стартовом кодоне AUG, проксимальнее 5' конец мРНК; однако сканирующая рибосома может столкнуться с «неблагоприятным нуклеотидным контекстом» вокруг стартового кодона и продолжить сканирование.[2]

В некоторых случаях было обнаружено, что инициация происходит выше по течению в кодоне, отличном от AUG. Эукариотические гены, содержащие последовательные G-C богатый лидерные последовательности часто наблюдаются выполнение этого механизма. Предполагается, что сканирование замедляется из-за вторичной структуры, которая позволяет связывать Встретил-тРНК с кодоном несовпадения.[3]

Несколько вирусы использовать негерметичный механизм сканирования для получения жизненно важных белки что означает, что утечка сканирования не является следствием несоответствия, а позволяет вирусам преодолеть селективное давление соревноваться со своими хозяевами.[4] Молекулярные биологи сужают круг поиска идеальной нуклеотидной среды для инициации трансляции и механизмов репликации вирусов.[1]

Открытие

Через несколько исследований Мэрилин Козак был первым, кто осознал основную роль сканирования в инициации трансляции в клетках млекопитающих. Кодон AUG у млекопитающих оптимально распознается контекстом GCCRCCAUGG, также известным как «консенсусная последовательность Козака».[5] Пурин (R) и каждый из нуклеотидов в этой последовательности являются высококонсервативными и обеспечивают важную функцию распознавания и инициации трансляции для многих 40S субъединиц рибосомы. При оптимальном контексте в стартовом кодоне AUG рибосомы начнут инициацию в этой точке. Слабый контекст возникает, когда последовательности, смежные со стартовым кодоном AUG, отклоняются от согласованной последовательности. Некоторые рибосомы по-прежнему инициируют трансляцию в слабом месте, но большинство будет выполнять сканирование с утечкой и инициировать ниже по течению. Как следствие, вероятно, будут производиться разные белки.[3]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б Козак, Мэрилин. «Инициирование трансляции у прокариот и эукариот». Gene 234 (1999): 187-208. Академический поиск завершен. Интернет. 10 июня 2014 г.
  2. ^ Herzog, Etienne., Et al. «Трансляция второго гена РНК 2 вируса комочков арахиса происходит при сканировании с утечкой данных in vitro». Вирусология 208. (1995): 215-225. Академический поиск завершен. Интернет. 10 июня 1014 г.
  3. ^ а б Козак, Мэрилин. «Расширяя пределы сканирующего механизма инициации перевода». Ген 299 (2002): 1-34. Академический поиск завершен. Интернет. 11 июня 2014 г.
  4. ^ Рябоба, Любовь. И др. «Повторная инициализация трансляции и сканирование с утечками в растительных вирусах». Virus Research 119 (2006): 52-62 Академический поиск завершен. Интернет. 23 июня 2014 г.
  5. ^ Хиннебуш, Алан., «Молекулярный механизм сканирования и выбора стартовых кодонов у эукариот». Американское общество микробиологии Vol. 75 нет. 3. (2011): 434-467. Интернет. 11 июня 2014 г.