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RNA-polymerase IV

RNA-Polymerase IV ist ein RNA-Polymerase, die an der Herstellung von kleine störende RNA (siRNA) in Pflanzen.[1] Es ist eine Ableitung von RNA-Polymerase II. In jungen somatischen Embryonen dringt die RNA-Polymerase IV in die Kern während es in stärker entwickelten älteren Geweben ist Zytoplasma verhindert.[2]

RNA-Polymerase IV ist spezifisch für Pflanzengenome und wird für die Bildung von mehr als 90 % der 24 Nukleotide langen . benötigt heterochromatisch siRNA.[3]

Die RNA-Polymerase IV besteht aus 12 Untereinheiten, von denen viele denen der RNA-Polymerase II und gemein sind RNA-Polymerase V.

Untereinheiten[4]

Pol IV
Untereinheiten		Ob im anderen oder nicht
Auftretende RNA-Polymerasen		menschliches GenNummer proteinogene Aminosäuren[5]Humane Pol II-Untereinheiten
RPD1IV1444
RPD2IV, V1229
RPD3II, IV, VPOLR2C[6]275Untereinheit C
RPD4IV, V219
RPD5IV248
RPD6I, II, III, IV, VPOLR2F[7]127hRPB6 (Untereinheit F)
RPD7IV, V175
RPD8I, II, III, IV, VPOLR2H[8]149hRPB8 (Untereinheit H)
RPD9II, IV, VPOLR2I[9]125Untereinheit I
RPB10II, IV, VPOLR2J[10]117Untereinheit J
RPD11I, II, III, IV, VPOLR2K[11]58hRPB10 (Untereinheit K)
RPD12I, II, III, IV, VPOLR2L[12]67hRPB12 (Untereinheit L)

Funktion

RNA-Polymerase IV Bremsen das Transposons und repetitive DNA während der siRNAReaktionsweg.[1] Die siRNA spielt eine wichtige Rolle bei der Abwehr des Genom gegen eindringen Viren und springende Gene durch die DNA, die von der RNA kontrolliert wirdMethylierung.[3]

RNA-Polymerase IV und ROS1Demethylase (Repressor Öf sodämpfend 1) entsperrt und verdichtet das 5S rDNA-Chromatin, die in vorhanden ist Saat und ist für die Entwicklung der reifen Pflanzeneigenschaften notwendig.[13] Die RNA-Polymerase IV ist auch an den Methylierungsmustern der 5S-Gene während der Pflanzenreifung beteiligt.[13]

Im Arabidopsis thaliana RNA-Polymerase IV interagiert mit dem Bindungsprotein DCL3 (dichcäh-like 3) und a RNA-Polymerase II RDR2 (RNACH DEM-ddauerhaft RNA-Polymerase) und hemmt den Weg der RNA-Polymerase IV, die sonst einzelsträngige RNA produzieren würde, und ist nun geändert zu dsRNA (Doppelstrang RNA) durch RDR2 und dann durch DCL3 in siRNA umgewandelt.[1] Grundlage ist das Vorhandensein eines Stücks (einzelsträngiger) RNA mit der Sequenz, die komplementär zur mRNA. Es entsteht nun eine doppelsträngige RNA. Dies wird vom Enzym erkannt Würfel und in kleine Fragmente geschnitten, "small interfering RNAs" (siRNA) von etwa 25 Basenpaaren Länge mit einem 2 Basenüberhang am 3'-Ende.

Bestimmung des Typs der RNA-Polymerase

Alpha-Amanitin Aufgrund seines Wirkmechanismus wird es auch häufig als Werkzeug in wissenschaftlichen Studien in Molekularbiologie und biologische Forschung. Es kann verwendet werden, um zu bestimmen, welche Formen von RNA-Polymerase vorhanden sind. Anschließend wird die Sensitivität der RNA-Polymerase in Gegenwart von alpha-Amanitin getestet. RNA-Polymerase I, RNA-Polymerase IV und RNA-Polymerase V sind unsensibel, RNA-Polymerase II sehr sensibel und RNA-Polymerase III ist etwas empfindlich gegenüber Alpha-Amanitin.[14]