WikiDer > S100A15 - Википедия

S100A15 - Wikipedia
S100A7A
PDB 3psr EBI.jpg
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыS100A7A, NICE-2, S100A15, S100A7L1, S100A7f, S100 кальций-связывающий белок A7A, NICE2
Внешние идентификаторыOMIM: 617427 Генные карты: S100A7A
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение для S100A7A
Геномное расположение для S100A7A
Группа1q21.3Начните153,416,520 бп[1]
Конец153,423,222 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

338324

н / д

Ансамбль

ENSG00000184330

н / д

UniProt

Q86SG5

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_176823

н / д

RefSeq (белок)

NP_789793

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 153.42 - 153.42 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

S100 кальций-связывающий белок A15 (S100A15), также известен как кебнеризин и кальций-связывающий белок S100 A7A (S100A7A), это белок что у людей кодируется S100A7A (псевдоним:S100A15) ген.[3]

Белки S100 представляют собой разнообразное семейство связывающих кальций, которые регулируют фундаментальные клеточные и внеклеточные процессы, включая пролиферацию и дифференцировку клеток, миграцию клеток и антимикробную защиту хозяина, как антимикробные пептиды.

Кебнеризин (S100A15) был впервые идентифицирован с повышенной активностью в предрасположенной к воспалению псориатической коже, что позволяет предположить его участие в фенотипе поражения.[4] Феномен Кебнера. Сегодня этот белок вызывает дополнительный интерес из-за его роли в противомикробной защите, врожденном иммунитете, созревании эпидермальных клеток и эпителиальном туморогенезе.[5][6]

Функция

Эпителиальный гомеостаз и антимикробная защита хозяина

Кожа: В нормальном эпидермисе кебнеризин (S100A15) экспрессируется эпидермальными базальными и дифференцированными кератиноцитами, меланоцитами и клетками Лангерганса. Внутри волосистой оболочки S100A15 находится во внутреннем и внешнем влагалище корня и в базальном слое сальной железы. В дерме кебнеризин (S100A15) продуцируется дендритными клетками, гладкомышечными клетками, эндотелиальными клетками, а также фибробластами для контроля регенерации тканей.[7][8][9][10]

Грудь: Кебнеризин (S100A15) экспрессируется альвеолярными клетками и клетками просвета мелких протоков, а также миоэпителиальными клетками эпителиального происхождения вокруг ацинусов и окружающих кровеносных сосудов.[11]

Кебнеризин (S100A15) функционирует как антимикробный пептид (AMP) снижает выживаемость E. coli и строго регулируется несколькими бактериальными компонентами, такими как P. aeruginosa и S. aureus. Таким образом, кебнеризин участвует в антимикробной защите кожи и пищеварительного тракта новорожденных, находящихся на грудном вскармливании.[12]

Эпителиальный канцерогенез

Рак молочной железы: Кебнеризин (S100A15) сверхэкспрессируется в ER / PR-отрицательных опухолях, что указывает на регуляцию прогрессирования опухоли.[11] Секретируемый кебнеризин (S100A15) действует как хемоаттрактант,[8] усиливает воспаление и, таким образом, может вызвать канцерогенез груди.

Воспаление

Кебнеризин (S100A15) сверхэкспрессируется при воспалительных заболеваниях кожи, таких как псориаз и экзема.[13] Он регулируется провоспалительными цитокинами Th1 и Th17, но не Th2.[14][15] При попадании во внеклеточное пространство кебнеризин (S100A15) вызывает воспаление. Он действует как хемоаттрактант для миелоидных лейкоцитов через рецептор, связанный с Gi-белком, чувствительный к коклюшному токсину. Кебнеризин (S100A15) усиливает воспаление с помощью родственного псориазина (S100A7), который совместно регулируется и провоспалительный через Ярость.

Геномная организация и варианты сплайсинга мРНК

Кебнеризин (S100A15) сопоставляется с кластером генов S100 в комплексе эпидермальной дифференцировки (EDC, хромосома 1q21) и обнаруживает необычную геномную организацию по сравнению с другими членами S100. Две альтернативные изоформы мРНК коебнеризина имеют одну и ту же кодирующую область, но демонстрируют различия в составе и длине соседних нетранслируемых областей (S100A15-короткий (S): 0,5 т.п.н. по сравнению с hS100A15-длинным (L): 4,4 т.п.н.). Оба варианта сплайсинга по-разному регулируются при воспалительных заболеваниях кожи, что предполагает использование альтернативных промоторов.[4][14]

Протеин

Аминокислотная последовательность показывает консервативный C-конец и вариант N-конца EF-hand, типичные для белков S100 (101 аминокислота, 11,305 Да, расчетная pI 7,57 кДа). По сравнению с большинством белков S100 кебнеризин (S100A15) является основным.

Эволюция

Примас

Кебнеризин (S100A15) в последнее время эволюционировал дупликации генов в пределах комплекса эпидермальной дифференцировки (EDC, хромосома 1q21) во время эволюция приматов образуя новое подсемейство S100 вместе с псориазином (S100A7).[16][17] Следовательно, коебнеризин практически идентичен псориазину по последовательности (> 90%). Несмотря на высокую гомологию, кебнеризин (S100A15) и псориазин (S100A7) различаются по распределению в тканях, регуляции и структуре.[18][19] и функции и, таким образом, пример разнообразия в семействе S100. Их различные свойства являются вескими причинами различать S100A15 (кебнеризин) и S100A7 (псориазин) в отношении эпителиального гомеостаза, воспаления и рака.

Грызун

Кебнеризин (S100A15) и псориазин (S100A7) имеют общий белок у мышей, кодируемый S100a7a15 (псевдоним: mS100A7, mS100A15, mS100a7a) ген.[20] Его можно использовать для изучения значения соответствующих белков человека для созревания эпидермиса, воспаления и эпителиального канцерогенеза.[17][21][22][23]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184330 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Ген Entrez: кальций-связывающий белок A7A S100».
  4. ^ а б Вольф Р., Мирмохаммадсадех А., Вальц М., Лиза Б., Тартлер Ю., Ремус Р., Хенгге Ю., Мишель Г., Ружичка Т. (2003). «Молекулярное клонирование и характеристика альтернативно сплайсированных изоформ мРНК из псориатической кожи, кодирующих новый член семейства S100». FASEB J. 17 (13): 1969–71. Дои:10.1096 / fj.03-0148fje. PMID 12923069.
  5. ^ Вольф Р., Ружичка Т., Юспа С.Х. (2011). «Новое подсемейство S100A7 (псориазин) / S100A15 (коебнеризин): высоко гомологично, но отличается регуляцией и функцией». Аминокислоты. 41 (4): 789–96. Дои:10.1007 / s00726-010-0666-4. ЧВК 6410564. PMID 20596736.
  6. ^ Цвикер С., Бурейк Д., Ружичка Т., Вольф Р. (2012). «[Друг или враг? - Псориазин и Кебнеризин: многофункциональные защитные молекулы в дифференцировке кожи, онкогенезе и воспалении]». Dtsch. Med. Wochenschr. (на немецком). 137 (10): 491–4. Дои:10.1055 / с-0031-1299015. PMID 22374659.
  7. ^ Гауглиц Г.Г., Бурейк Д., Цвикер С., Ружичка Т., Вольф Р. (2014). «Противомикробные пептиды псориазин (S100A7) и кебнеризин (S100A15) подавляют продукцию внеклеточного матрикса и пролиферацию человеческих фибробластов». Кожа Pharmacol Physiol. 28 (3): 115–123. Дои:10.1159/000363579. PMID 25502330.
  8. ^ а б Вольф Р., Ховард О.М., Донг Х.Ф., Воскопулос К., Бошанс К., Уинстон Дж., Диви Р., Гунсиор М., Голдсмит П., Ахвази Б., Чавакис Т., Оппенгейм Дж. Дж., Юспа С.Х. (2008). «Хемотаксическая активность S100A7 (псориазина) опосредуется рецептором конечных продуктов гликирования и усиливает воспаление с помощью высокогомологичного, но функционально отличного S100A15». J. Immunol. 181 (2): 1499–506. Дои:10.4049 / jimmunol.181.2.1499. ЧВК 2435511. PMID 18606705.
  9. ^ Чжан X, Шарма AM, Утрехт Дж. (Сентябрь 2013 г.). «Идентификация сигналов опасности при кожной сыпи, вызванной невирапином». Химические исследования в токсикологии. 26 (9): 1378–83. Дои:10.1021 / tx400232s. PMID 23947594.
  10. ^ де Кастро А, Минти Ф, Хаттингер Э, Вольф Р, Паркинсон Э.К. (2014). «Секретируемый белок S100A7 (псориазин) индуцируется дисфункцией теломер в кератиноцитах человека независимо от реакции на повреждение ДНК и регуляторов клеточного цикла». Долголетие и продолжительность жизни. 3: 8. Дои:10.1186/2046-2395-3-8. ЧВК 4304136. PMID 25621169.
  11. ^ а б Вольф Р., Воскопулос С., Уинстон Дж., Дхарамси А., Голдсмит П., Гунсиор М., Вондерхар Б.К., Олсон М., Уотсон П.Х., Юспа С.Х. (2009). «Высокогомологичные белки hS100A15 и hS100A7 отчетливо экспрессируются в нормальной ткани груди и раке груди». Рак Lett. 277 (1): 101–7. Дои:10.1016 / j.canlet.2008.11.032. ЧВК 2680177. PMID 19136201.
  12. ^ Бюхау А.С., Хассан М., Кукова Г., Леверенц В., Келлерманн С., Вюртнер Ю.Ю., Вольф Р., Вальц М., Галло Р.Л., Ружичка Т. (2007). «S100A15, антимикробный белок кожи: регуляция E. coli через Toll-подобный рецептор 4». J. Invest. Дерматол. 127 (11): 2596–604. Дои:10.1038 / sj.jid.5700946. PMID 17625598.
  13. ^ Вольф Р., Мация Ф., Дхарамси А., Ховард О. М., Катайссон С., Блисковски В., Уинстон Дж., Фейгенбаум Л., Личти Ю., Ружичка Т., Чавакис Т., Юспа С.Х. (2010). «Ген из локуса восприимчивости к псориазу готовит кожу к воспалению». Sci Transl Med. 2 (61): 61ra90. Дои:10.1126 / scitranslmed.3001108. ЧВК 6334290. PMID 21148126.
  14. ^ а б Вольф Р., Леверенц В., Бюхау А.С., Вальц М., Ружичка Т. (2007). «Сплайсинговые варианты человеческого S100A15 по-разному экспрессируются при воспалительных кожных заболеваниях и регулируются цитокинами Th1 и кальцием». Exp. Дерматол. 16 (8): 685–91. Дои:10.1111 / j.1600-0625.2007.00587.x. PMID 17620096.
  15. ^ Hegyi Z, Zwicker S, Bureik D, Peric M, Koglin S, Batycka-Baran A, Prinz JC, Ruzicka T., Schauber J, Wolf R (2012). «Кальципотриол, аналог витамина D, подавляет индуцированный цитокинами Th17 провоспалительный S100« алармин »псориазин (S100A7) и кебнеризин (S100A15) при псориазе». J. Invest. Дерматол. 132 (5): 1416–24. Дои:10.1038 / jid.2011.486. PMID 22402441.
  16. ^ Кульски Дж. К., Лим С. П., Данн Д. С., Беллгард М (2003). «Геномный и филогенетический анализ дупликаций гена S100A7 (псориазин) в области кластера генов S100 на хромосоме 1q21 человека». J. Mol. Evol. 56 (4): 397–406. Дои:10.1007 / s00239-002-2410-5. PMID 12664160.
  17. ^ а б Вольф Р., Воскопулос С.Дж., Фитцджеральд П.К., Голдсмит П., Катайссон С., Гунсиор М., Вальц М., Ружичка Т., Юспа С.Х. (2006). «Ортолог S100A15 мыши соответствует геномной организации, структуре, экспрессии генов и паттерну процессинга белка подсемейства S100A7 / A15 человека во время созревания эпидермиса». J. Invest. Дерматол. 126 (7): 1600–8. Дои:10.1038 / sj.jid.5700210. PMID 16528363.
  18. ^ Мюррей Дж. И., Тонкин М. Л., Уайтинг А. Л., Пэн Ф., Фарнелл Б., Каллен Дж. Т., Хоф Ф., Буланже М. Дж. (2012). «Структурная характеристика S100A15 выявляет новый координационный сайт цинка среди белков S100 и измененный химический состав поверхности с функциональными последствиями для связывания рецептора». BMC Struct. Биол. 12: 16. Дои:10.1186/1472-6807-12-16. ЧВК 3434032. PMID 22747601.
  19. ^ Бошанс К.М., Вольф Р., Воскопулос С., Жиллетт В., Эспозито Д., Муэзер Т.С., Юспа С.Х., Ахвази Б. (2006). «Очистка, кристаллизация и предварительная дифракция рентгеновских лучей человека S100A15». Acta Crystallographica Раздел F. 62 (Pt 5): 467–70. Дои:10.1107 / S1744309106012838. ЧВК 2219979. PMID 16682778.
  20. ^ «Ген Entrez: кальций-связывающий белок S100a7a S100».
  21. ^ Бризо Е.М., Гвинея-Виньегра Дж., Бакири Л., Рогон З., Петцельбауэр П., Эйлс Р., Вольф Р., Ринкон М., Анхель П., Вагнер Э. Ф. (2013). «Опосредованный воспалением туморогенез кожи, индуцированный эпидермальным c-Fos». Genes Dev. 27 (18): 1959–73. Дои:10.1101 / gad.223339.113. ЧВК 3792473. PMID 24029918.
  22. ^ Нассер М.В., Камри З., Деол Ю.С., Рави Дж., Пауэлл К.А., Триха П., Швенденер Р.А., Бай ХФ, Шило К., Зоу Х, Леоне Дж., Вольф Р., Юспа С.Х., Ганджу РК (2012). «S100A7 усиливает онкогенез молочной железы за счет активации воспалительных путей». Рак Res. 72 (3): 604–15. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-11-0669. ЧВК 3271140. PMID 22158945.
  23. ^ Нассер М.В., Вани Н., Ахирвар Д.К., Пауэлл К.А., Рави Дж., Эльбаз М.М., Чжао Х., Падилья Л., Чжан Х, Шило К., Островски М.С., Шапиро С.Л., Карсон В.Е., Ганджу РК (2015). «RAGE опосредует S100A7-индуцированный рост и метастазирование рака груди, модулируя микроокружение опухоли». Рак Res. 75 (6): 974–85. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-14-2161. ЧВК 4359968. PMID 25572331.

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q86SG5 (Белок S100-A7A) на PDBe-KB.