WikiDer > SMN1

SMN1
SMN1
Белок SMN1 PDB 1g5v.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSMN1, BCD541, GEMIN1, SMNT, T-BCD541, TDRD16A, выживание двигательного нейрона 1, теломерный, выживание двигательного нейрона 1, теломерный, SMA1, SMA4, SMA @, SMA2, SMA, SMA3, SMN
Внешние идентификаторыOMIM: 600354 MGI: 109257 ГомолоГен: 292 Генные карты: SMN1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение SMN1
Геномное расположение SMN1
Группа5q13.2Начинать70,925,030 бп[1]
Конец70,953,942 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000344
NM_001297715
NM_022874

NM_001252629
NM_011420

RefSeq (белок)

NP_001239558
NP_035550

Расположение (UCSC)Chr 5: 70.93 - 70.95 МбChr 13: 100.12 - 100.14 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Выживание мотонейрона 1 (SMN1), также известный как компонент драгоценных камней 1 или же БЛИЗНЕЦ1, это ген, кодирующий Белок SMN в людях.[5][6]

Ген

SMN1 это теломерный копия гена, кодирующего белок SMN; в центромерный копия называется SMN2. SMN1 и SMN2 являются частью инвертированной дупликации размером 500 kb на хромосоме 5q13. Эта дублированная область содержит по крайней мере четыре гена и повторяющиеся элементы, которые делают ее склонной к перестройкам и делециям. Повторяемость и сложность последовательности также вызвали трудности в определении организации этой геномной области. SMN1 и SMN2 почти идентичны и кодируют один и тот же белок.[6] Критическое различие в последовательностях между ними - это единственный нуклеотид в экзоне 7, который, как полагают, является усилителем сплайсинга экзона. Считается, что в событиях конверсии генов могут участвовать два гена, что приводит к разному количеству копий каждого гена.[6]

Клиническое значение

Мутации в SMN1 связаны с спинальная мышечная атрофия. Мутации в SMN2 сами по себе не приводят к болезни, хотя мутации в обоих SMN1 и SMN2 результат в эмбриональная смерть.

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000172062 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000275349, ENSG00000172062 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021645 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Lefebvre S, Bürglen L, Reboullet S, Clermont O, Burlet P, Viollet L, Benichou B, Cruaud C, Millasseau P, Zeviani M (январь 1995 г.). «Идентификация и характеристика гена, определяющего мышечную атрофию позвоночника». Клетка. 80 (1): 155–65. Дои:10.1016/0092-8674(95)90460-3. PMID 7813012.
  6. ^ а б c «Энтрез Ген: выживаемость SMN1 мотонейрона 1, теломерный».

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Приор Т.В., Руссман Б.С. (2013). Пагон Р.А., Адам М.П., ​​Ардингер Х.Х., Уоллес С.Е., Амемия А., Бин Л.Дж., Берд Т.Д., Фонг С.Т., Меффорд ХК, Смит Р.Дж., Стивенс К. (ред.). «Спинальная мышечная атрофия». GeneReviews [Интернет]. PMID 20301526.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.