WikiDer > Секвестосома 1
Sequestosome 1
Секестосома-1 это белок что у людей кодируется SQSTM1 ген.[5][6][7] Также известен как убиквитин-связывающий белок p62,[8] это аутофагосома белок-груз, который нацелен на другие белки, которые связываются с ним для селективного аутофагия. Взаимодействуя с GATA4 и направляя его на деградацию, он может ингибировать связанный с GATA-4 старение и секреторный фенотип, связанный со старением.[9]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Нормальный |
| Плодородие | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Беспокойство | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология | Аномальный[10] |
| Лимфоциты периферической крови | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный[11] |
| Citrobacter инфекционное заболевание | Нормальный[12] |
| Все тесты и анализы от[13][14] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции SQSTM1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Sqstm1tm1a (КОМП) Wtsi[15][16] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[17][18][19]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[13][20] Было проведено двадцать два испытания на гомозиготный мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: у самок были аномальные полный анализ крови параметры, в том числе повышенный эритроцит ширина распределения и увеличенное среднее тромбоцит объем.[13]
Взаимодействия
Секвестосома 1 может взаимодействовать с:
Рекомендации
- ^ а б c ENSG00000284099 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000161011, ENSG00000284099 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015837 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Джунг И., Строминджер Дж. Л., Шин Дж. (Июль 1996 г.). «Молекулярное клонирование фосфотирозин-независимого лиганда SH2 домена p56lck». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (12): 5991–5. Дои:10.1073 / pnas.93.12.5991. ЧВК 39176. PMID 8650207.
- ^ Devergne O, Hummel M, Koeppen H, Le Beau MM, Nathanson EC, Kieff E, Birkenbach M (февраль 1996). «Новый родственный интерлейкину-12 белок p40, индуцированный латентной инфекцией вируса Эпштейна-Барра в B-лимфоцитах». J Virol. 70 (2): 1143–53. Дои:10.1128 / JVI.70.2.1143-1153.1996. ЧВК 189923. PMID 8551575.
- ^ «Энтрез Ген: секвестосома 1 SQSTM1».
- ^ Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): 601530
- ^ Кэссиди Л.Д., Нарита М (2015). "GATA сдерживает старение" (PDF). Наука. 349 (6255): 1448–9. Дои:10.1126 / science.aad2501. PMID 26404812. S2CID 35805331.
- ^ «Гематологические данные для Sqstm1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Сальмонелла данные о заражении для Sqstm1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении для Sqstm1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
- ^ Швец Э., Фасс Э., Шерц-Шуваль Р., Элазар З. (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62 / SQSTM1 в аутофагосомы». J. Cell Sci. 121 (Пт 16): 2685–95. Дои:10.1242 / jcs.026005. PMID 18653543.
- ^ Санчес П., Де Карсер Дж., Сандовал И.В., Москат Дж., Диас-Меко М.Т. (май 1998 г.). «Локализация изоформ атипичной протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 3069–80. Дои:10.1128 / mcb.18.5.3069. ЧВК 110686. PMID 9566925.
- ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Санз Л., Санчес П., Лаллена М.Дж., Диас-Меко М.Т., Москат Дж. (1999). «Взаимодействие p62 с RIP связывает атипичные PKC с активацией NF-kappaB». EMBO J. 18 (11): 3044–53. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3044. ЧВК 1171386. PMID 10356400.
- ^ Sanz L, Diaz-Meco MT, Nakano H, Moscat J (апрель 2000 г.). «Атипичный PKC-взаимодействующий белок p62 каналы активации NF-kappaB с помощью пути IL-1-TRAF6». EMBO J. 19 (7): 1576–86. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1576. ЧВК 310227. PMID 10747026.
- ^ Wooten MW, Seibenhener ML, Mamidipudi V, Diaz-Meco MT, Barker PA, Moscat J (март 2001 г.). «Атипичный протеин-протеин p62, взаимодействующий с протеинкиназой C, представляет собой основу для активации NF-kappaB фактором роста нервов». J. Biol. Chem. 276 (11): 7709–12. Дои:10.1074 / jbc.C000869200. PMID 11244088.
- ^ а б Гита Т., Вутен М.В. (февраль 2003 г.). «Ассоциация атипичного белка p62 / ZIP, взаимодействующего с протеинкиназой C, с рецептором фактора роста нервов TrkA регулирует перенос рецепторов и передачу сигналов Erk5». J. Biol. Chem. 278 (7): 4730–9. Дои:10.1074 / jbc.M208468200. PMID 12471037.
- ^ а б Джадхав Т., Гита Т., Цзян Дж., Вутен М.В. (2008). «Идентификация консенсусного сайта полиубиквитинирования TRAF6 / p62». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 371 (3): 521–4. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.04.138. ЧВК 2474794. PMID 18457658.
- ^ Вутен М.В., Гита Т., Бабу Дж. Р., Зайбенхенер М.Л., Пенг Дж., Кокс Н., Диас-Меко М. Т., Москат Дж. (Март 2008 г.). «Важная роль секвестосомы 1 / p62 в регулировании накопления Lys63-убиквитинированных белков». J. Biol. Chem. 283 (11): 6783–9. Дои:10.1074 / jbc.M709496200. PMID 18174161.
- ^ Feng, Lifeng et al. «Тамоксифен активирует Nrf2-зависимую транскрипцию SQSTM1, способствуя гиперплазии эндометрия» Theranostics vol. 7,7 1890-1900 гг. 10 апреля 2017 г., DOI: 10.7150 / thno.19135
дальнейшее чтение
- Гита Т., Вутен М.В. (2002). «Структура и функциональные свойства убиквитин-связывающего белка р62». FEBS Lett. 512 (1–3): 19–24. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 02286-X. PMID 11852044. S2CID 22029085.
- Layfield R, Ciani B, Ralston SH, Hocking LJ, Sheppard PW, Searle MS, Cavey JR (2005). «Структурные и функциональные исследования мутаций, влияющих на домен UBA SQSTM1 (p62), которые вызывают болезнь Педжета костей». Biochem. Soc. Транс. 32 (Пт 5): 728–30. Дои:10.1042 / BST0320728. PMID 15493999.
- Michou L, Collet C, Laplanche JL, Orcel P, Cornélis F (2006). «Генетика костной болезни Педжета». Суставная кость позвоночника. 73 (3): 243–8. Дои:10.1016 / j.jbspin.2005.05.009. PMID 16574459.
- Пак И., Чанг Дж., Уолш К. Т., Юн И, Строминджер Дж. Л., Шин Дж. (1996). «Фосфотирозин-независимое связывание белка массой 62 кДа с доменом src homology 2 (SH2) p56lck и его регуляция путем фосфорилирования Ser-59 в уникальной N-концевой области lck». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (26): 12338–42. Дои:10.1073 / пнас.92.26.12338. ЧВК 40352. PMID 8618896.
- Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (1996). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия. 35 (7): 2157–67. Дои:10.1021 / bi9524124. PMID 8652557.
- Вадламуди Р.К., Джунг И., Строминджер Д.Л., Шин Дж. (1996). «p62, фосфотирозин-независимый лиганд SH2-домена p56lck, принадлежит к новому классу убиквитин-связывающих белков». J. Biol. Chem. 271 (34): 20235–7. Дои:10.1074 / jbc.271.34.20235. PMID 8702753.
- Маркус С.Л., Уинроу С.Дж., Капоне Дж.П., Рачубинский Р.А. (1996). «Лиганд p56 (lck) служит коактиватором рецептора орфанного ядерного гормона». J. Biol. Chem. 271 (44): 27197–200. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27197. PMID 8910285.
- Джаллал Б., Мосси К., Василудис Г., Князев П., Захвейя Дж., Ясновидящий Ф., Шиллинг Дж., Ульрих А. (1997). «Рецептор-подобная протеин-тирозинфосфатаза DEP-1 конститутивно связана с серин / треонинкиназой протеина массой 64 кДа». J. Biol. Chem. 272 (18): 12158–63. Дои:10.1074 / jbc.272.18.12158. PMID 9115287.
- Санчес П., Де Карсер Дж., Сандовал И.В., Москат Дж., Диас-Меко МТ (1998). «Локализация изоформ атипичной протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 3069–80. Дои:10.1128 / mcb.18.5.3069. ЧВК 110686. PMID 9566925.
- Вадламуди Р.К., Шин Дж. (1998). «Геномная структура и анализ промотора гена p62, кодирующего непротеасомный мультиубиквитиновый белок, связывающий цепь». FEBS Lett. 435 (2–3): 138–42. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01021-7. PMID 9762895. S2CID 3184369.
- Санз Л., Санчес П., Лаллена М.Дж., Диас-Меко М.Т., Москат Дж. (1999). «Взаимодействие p62 с RIP связывает атипичные PKC с активацией NF-kappaB». EMBO J. 18 (11): 3044–53. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3044. ЧВК 1171386. PMID 10356400.
- Штумптнер К., Хейд Х, Фуксбихлер А., Хаузер Х., Мишингер Х. Дж., Затлукал К., Денк Х (1999). «Анализ внутрицитоплазматических гиалиновых телец при гепатоцеллюлярной карциноме. Демонстрация p62 как основного компонента». Являюсь. Дж. Патол. 154 (6): 1701–10. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 65426-0. ЧВК 1866621. PMID 10362795.
- Судо Т., Маруяма М., Осада Х (2000). «p62 функционирует как регулятор киназы p38 MAP». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 269 (2): 521–5. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2333. PMID 10708586.
- Санс Л., Диас-Меко М.Т., Накано Х., Москат Дж. (2000). «Атипичный PKC-взаимодействующий белок p62 каналы активации NF-kappaB с помощью пути IL-1-TRAF6». EMBO J. 19 (7): 1576–86. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1576. ЧВК 310227. PMID 10747026.
- Wooten MW, Seibenhener ML, Mamidipudi V, Diaz-Meco MT, Barker PA, Moscat J (2001). «Атипичный протеин-протеинкиназный C-взаимодействующий протеин p62 является основой для активации NF-kappaB фактором роста нервов». J. Biol. Chem. 276 (11): 7709–12. Дои:10.1074 / jbc.C000869200. PMID 11244088.
- Куусисто Э., Салминен А, Алафузов I (2001). «Убиквитин-связывающий белок p62 присутствует в нейрональных и глиальных включениях при таупатиях и синуклеинопатиях человека». NeuroReport. 12 (10): 2085–90. Дои:10.1097/00001756-200107200-00009. PMID 11447312. S2CID 21272705.
- Лорин Н., Браун Дж. П., Лемейн А., Дюшен А., Хуот Д., Лакурсьер И., Драпо Г., Верро Дж., Раймон В., Мориссет Дж. (2001). «Костная болезнь Педжета: картирование двух локусов в 5q35-qter и 5q31». Являюсь. J. Hum. Genet. 69 (3): 528–43. Дои:10.1086/322975. ЧВК 1235483. PMID 11473345.
- Чанг С., Ким Дж. Х., Шин Дж. (2002). «p62 образует тройной комплекс с PKCzeta и PAR-4 и противодействует PAR-4-индуцированному ингибированию PKCzeta». FEBS Lett. 510 (1–2): 57–61. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03224-0. PMID 11755531. S2CID 85579338.
- Feng, Lifeng et al. «Тамоксифен активирует Nrf2-зависимую транскрипцию SQSTM1, способствуя гиперплазии эндометрия» Theranostics vol. 7,7 1890-1900 гг. 10 апреля 2017 г., DOI: 10.7150 / thno.19135
PDB галерея | |
|---|---|
|
