WikiDer > Сирогидрохлорин феррохелатаза
| сирогидрохлорин феррохелатаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 4.99.1.4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
В энзимология, а сирогидрохлорин феррохелатаза (EC 4.99.1.4) является фермент который катализирует то химическая реакция
- сирогидрохлорин + Fe2+ сирохема + 2H+
Таким образом, два субстраты этого фермента сирогидрохлорин и Fe2+, а его два товары находятся сирохем и ЧАС+.[1][2][3]
Этот фермент принадлежит к семейству лиасы, а именно «универсальный» класс лиаз, которые не вписываются ни в какой другой подкласс. В систематическое название этого класса ферментов сирогема ферролиза (образующая сирогидрохлорин). Фермент также известен как SirB и присутствует во всех растениях, а также в бактериях, ассимилирующих / диссимилирующих нитраты и сульфаты. Сирогем является кофактором как ассимиляторных, так и диссимиляционных нитрит- и сульфитредуктаз. Сирогем синтезируется из центральной тетрапиррольной молекулы уропорфириногена III, которая образует первую точку разветвления пути биосинтеза тетрапиррола, а другой ветвью является ветвь гем / хлорофилл. Ветвь сирогема состоит из трех стадий: метилирования, дегидрирования и феррохелирования, причем последняя стадия осуществляется феррохелатазой сирогидрохлорин.
Сирогидрохлоринферрохелатаза является хелатазой класса II, то есть ей не требуется АТФ для своей активности в отличие от хелатаз класса I, таких как Mg-хелатаза. В Кишечная палочка, все три стадии биосинтеза сирогема осуществляются одним многофункциональным ферментом, называемым CysG, тогда как в дрожжах Saccharomyces cerevisiae последние два этапа выполняются бифункциональным ферментом Met8p. CysG и Met8p имеют общие складки, но не связаны с SirB и составляют так называемую хелатазу класса III. SirB принадлежит к белку семейства CbiX, а растение SirB составляет половину длины бактериального SirB и совпадает с его N- и C-концевыми половинами, что позволяет предположить, что более длинная форма возникла в результате дупликации гена и слияния более короткой формы.
Сирогидрохлорин феррохелатаза из всех наземные растения и некоторые зеленые водоросли но нет бактерии или другие водоросли состоят из железосернистый кластер, которые могут переключаться между формами [2Fe-2S] и [4Fe-4S] в зависимости от окислительно-восстановительного статуса клеточной среды. Хотя точно не определено, какую роль может играть это переключение кластера, предполагается, что оно участвует в критической окислительно-восстановительной регуляции биосинтеза сирогема.
Рекомендации
- ^ Саха, Кошик; Уэбб, Майкл Э .; Ригби, Стивен Э. Дж .; Пиявка, Хелен К .; Уоррен, Мартин Дж .; Смит, Элисон Г. (2012). «Характеристика эволюционно законсервированного железо-серного кластера сирогидрохлорин феррохелатазы из Arabidopsis thaliana». Биохимический журнал. 444 (2): 227–237. Дои:10.1042 / BJ20111993. ISSN 0264-6021. PMID 22414210.
- ^ Уоррен MJ; Raux, E; Бриндли, АА; Пиявка, HK; Wilson, KS; Хилл, CP; Уоррен, MJ (2002). «Структура Met8p Saccharomyces cerevisiae, бифункциональной дегидрогеназы и феррохелатазы». EMBO J. 21 (9): 2068–75. Дои:10.1093 / emboj / 21.9.2068. ЧВК 125995. PMID 11980703.
- ^ Уоррен MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC (2002). «Биосинтез аденозилкобаламина (витамин B12)». Nat. Prod. Представитель. 19 (4): 390–412. Дои:10.1039 / b108967f. PMID 12195810.
 | Этот фермент-связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |