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Stefan Vaes (Herentals, 29. Februar1976) ist ein BelgierMathematiker, wenn Ordinarius verbunden mit dem KU Löwen.

Vaes hat studiert Mathematik zum Katholische Universität Löwen, wo er 2001 mit einer Studie zu lokal kompakten Quantengruppen. Sein Förderer war Alfons Van Daele. 2002 begann er als wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut de mathématiques de Jussieu für die Centre National de la Recherche Scientifique im Paris. 2006 wurde er Senior Lecturer an der KU Leuven, 2009 ordentlicher Professor und 2012 ordentlicher Professor.

2015 wurde ihm der Francqui-Preis, die höchste belgische wissenschaftliche Auszeichnung. Die Jury unter dem Vorsitz von David Gross, lobte seine Forschung auf von Neumann-Algebras, deren Ergebnisse auch wichtige Implikationen für andere Bereiche der Mathematik haben, wie z nicht-kommutative Geometrie.