WikiDer > TP53BP1

TP53BP1
TP53BP1
Белок TP53BP1 PDB 1gzh.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTP53BP1, 53BP1, p202, p53BP1, TP53, TDRD30, опухолевый белок, p53-связывающий белок 1
Внешние идентификаторыOMIM: 605230 MGI: 1351320 ГомолоГен: 4137 Генные карты: TP53BP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение TP53BP1
Геномное расположение TP53BP1
Группа15q15.3Начинать43,403,061 бп[1]
Конец43,510,728 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TP53BP1 203050 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001141979
NM_001141980
NM_005657
NM_001355001

NM_001290830
NM_013735

RefSeq (белок)

NP_001135451
NP_001135452
NP_005648
NP_001341930

NP_001277759
NP_038763

Расположение (UCSC)Chr 15: 43,4 - 43,51 МбChr 2: 121,19 - 121,27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Р53-связывающий белок 1, супрессор опухолей также известен как p53-связывающий белок 1 или же 53BP1 это белок что у людей кодируется TP53BP1 ген.[5][6][7]

Клиническое значение

53BP1 недоэкспрессируется в большинстве случаев тройной отрицательный рак груди.[8]

Ремонт ДНК

Двухцепочечные разрывы ДНК (DSB) представляют собой цитотоксические повреждения, которые могут быть устранены либо гомологичный рекомбинационный пути восстановления (HR) или негомологичное соединение концов (NHEJ) путь. NHEJ, хотя и быстрее HR, менее точен. Ранним этапом расхождения между двумя путями является резекция конца, и этот этап регулируется множеством факторов. Особенно, BRCA1 и 53BP1 играют роль в определении баланса между двумя путями.[9][10] 53BP1 ограничивает резекцию и способствует развитию NHEJ.

Взаимодействия

53BP1 был показан физически взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000067369 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043909 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ивабучи К., Бартель П.Л., Ли Б., Марраччино Р., Филдс С. (июнь 1994 г.). «Два клеточных белка, которые связываются с р53 дикого типа, но не с мутантным». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (13): 6098–102. Дои:10.1073 / пнас.91.13.6098. ЧВК 44145. PMID 8016121.
  6. ^ Ивабучи К., Ли Б., Масса Х. Ф., Траск Б. Дж., Дате Т, Филдс С. (октябрь 1998 г.). «Стимуляция р53-опосредованной активации транскрипции белками, связывающими р53, 53BP1 и 53BP2». Журнал биологической химии. 273 (40): 26061–8. Дои:10.1074 / jbc.273.40.26061. PMID 9748285.
  7. ^ «Ген Entrez: опухолевый белок TP53BP1, связывающий p53 белок 1».
  8. ^ Боуман П., Али А., Эсканделл Дж. М., Питерс М., Барткова Дж., Ван дер Гулден Х., Хиддинг С., Танасула М., Кулкарни А., Ян К., Хафти Б. Г., Томмиска Дж., Бломквист К., Драпкин Р., Адамс Д. Д., Неванлинна Х, Бартек Дж., Тарсунас М., Ганесан С., Йонкерс Дж. (Июнь 2010 г.). «Потеря 53BP1 устраняет дефицит BRCA1 и связана с трижды негативным и BRCA-мутированным раком груди». Структурная и молекулярная биология природы. 17 (6): 688–95. Дои:10.1038 / nsmb.1831. ЧВК 2912507. PMID 20453858.
  9. ^ Панье С., Бултон С.Дж. (2014). «Ремонт двухцепочечных разрывов: в центре внимания 53BP1». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 15 (1): 7–18. Дои:10.1038 / nrm3719. PMID 24326623.
  10. ^ Ли Дж, Сюй Х (2016). «Ремонт двухцепочечных разрывов ДНК: рассказ о выборе пути». Acta Biochim. Биофиз. Грех. (Шанхай). 48 (7): 641–6. Дои:10.1093 / abbs / gmw045. PMID 27217474.
  11. ^ Ботуян М.В., Ли Дж., Уорд И.М., Ким Дж. Э., Томпсон Дж. Р., Чен Дж., Мер Дж. (Декабрь 2006 г.). «Структурная основа для специфического для состояния метилирования распознавания гистона H4-K20 53BP1 и Crb2 в репарации ДНК». Клетка. 127 (7): 1361–73. Дои:10.1016 / j.cell.2006.10.043. ЧВК 1804291. PMID 17190600.
  12. ^ Fradet-Turcotte A, Canny MD, Orthwein A, Leung CC, Huang H, Landry MC, Kitevski-LeBlanc J, Noordermeer SM, Sicheri F, Durocher D (июнь 2013 г.). «53BP1 является считывающим устройством метки убиквитина H2A Lys 15, вызванной повреждением ДНК». Природа. 499 (7456): 50–4. Дои:10.1038 / природа12318. ЧВК 3955401. PMID 23760478.
  13. ^ Дербиширский ди-джей, Басу Б.П., Серпелл Л.К., Джу В.С., Дате Т., Ивабучи К., Доэрти А.Дж. (июль 2002 г.). «Кристаллическая структура доменов BRCT человека 53BP1, связанных с опухолевым супрессором p53». Журнал EMBO. 21 (14): 3863–72. Дои:10.1093 / emboj / cdf383. ЧВК 126127. PMID 12110597.
  14. ^ Экблад С.М., Фридлер А., Вепринцев Д., Вайнберг Р.Л., Ицхаки Л.С. (март 2004 г.). «Сравнение BRCT доменов BRCA1 и 53BP1: биофизический анализ». Белковая наука. 13 (3): 617–25. Дои:10.1110 / пс. 03461404. ЧВК 2286730. PMID 14978302.
  15. ^ Джу В.С., Джеффри П.Д., Кантор С.Б., Финнин М.С., Ливингстон Д.М., Павлетич Н.П. (март 2002 г.). «Структура области 53BP1 BRCT, связанной с p53, и ее сравнение со структурой Brca1 BRCT». Гены и развитие. 16 (5): 583–93. Дои:10.1101 / gad.959202. ЧВК 155350. PMID 11877378.
  16. ^ Дербиширский ди-джей, Басу Б.П., Дате Т., Ивабучи К., Доэрти А.Дж. (октябрь 2002 г.). «Очистка, кристаллизация и предварительный рентгеновский анализ доменов BRCT человеческого 53BP1, связанных с супрессором опухоли p53». Acta Crystallographica Раздел D. 58 (Pt 10 Pt 2): 1826–9. Дои:10.1107 / S0907444902010910. PMID 12351827.
  17. ^ Ло К.В., Кан Х.М., Чан Л.Н., Сюй В.Г., Ван К.П., Ву З., Шэн М., Чжан М. (март 2005 г.). «Легкая цепь динеина 8 кДа связывается с p53-связывающим белком 1 и опосредует накопление ядер p53, вызванное повреждением ДНК». Журнал биологической химии. 280 (9): 8172–9. Дои:10.1074 / jbc.M411408200. PMID 15611139.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q12888 (TP53-связывающий белок 1) на PDBe-KB.