WikiDer > Токсин-антитоксиновая система TxpA-RatA

TxpA-RatA toxin-antitoxin system
РНК антитоксин А
RatA SScons.png
Консервированная вторичная структура мРНК антитоксина RatA.
Идентификаторы
СимволRatA
РфамRF01776
Прочие данные
РНК типАнтисмысловой
Домен (ы)Фирмикуты
PDB структурыPDBe

В Токсин-антитоксиновая система TxpA / RatA был впервые обнаружен в Bacillus subtilis.[1] Он состоит из некодирование 222nt мРНК под названием RatA (РНК аnti-токсин А) и белок токсин под названием TxpA (Токсичный белок А).[2]

RatA была обнаружена в межгенных областях Б. subtilis геном, в 728-нуклеотид область между генами yqdB (позже переименован TxpA) и yqbM. Первоначально, Affymetrix микрочипы использовались для обнаружения транскрипция в этом регионе,[3] Нозерн-блот эксперименты и мутация Затем использовали анализ для характеристики транскрипта РНК.[1]

рата и txpA транскрибируются конвергентно и имеют перекрытие из 75 пар оснований в их 3 'концов, обеспечивая область взаимодополняемости. Транскрипт RatA связывается с TxpA мРНК через дополнительный регион[1] и затем дцРНК разрушается не охарактеризованным РНКаза E эквивалент, предотвращающий перевод токсичного белка TxpA.[2]

Гены рата и txpA находятся в пределах 48kb фаг-подобный элемент называется кожа. Этот элемент прерывает работу гена фактор сигма σK и вырезается во время спороношение. Система токсин-антитоксин, содержащаяся в кожа принудительно наследование этого элемента, который действует как эгоистичный ген.[1]

Механизм, с помощью которого TxpA вызывает лизис и гибель клеток, неизвестен. TxpA недостаточно похож на другие белки с известной функцией, чтобы сделать вывод о связанной функции, однако он имеет предполагаемую трансмембранную область на его N-конце, поэтому возможно, что TxpA повреждает целостность клеточной мембраны или блокирует синтез клеточной стенки. .[1]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c d е Сильваджи Дж. М., Перкинс Дж. Б., Лосик Р. (октябрь 2005 г.). «Малый нетранслируемый антитоксин РНК в Bacillus subtilis». J. Bacteriol. 187 (19): 6641–6650. Дои:10.1128 / JB.187.19.6641-6650.2005. ЧВК 1251590. PMID 16166525.
  2. ^ а б Фозо Е.М., Макарова К.С., Шабалина С.А., Ютин Н., Кунин Е.В., Сторц Г. (июнь 2010 г.). «Изобилие систем токсин-антитоксин типа I у бактерий: поиски новых кандидатов и открытие новых семейств». Нуклеиновые кислоты Res. 38 (11): 3743–3759. Дои:10.1093 / nar / gkq054. ЧВК 2887945. PMID 20156992. Получено 2010-09-16.
  3. ^ Ли Дж. М., Чжан С., Саха С., Санта Анна С., Цзян С., Перкинс Дж. (Декабрь 2001 г.). «Анализ экспрессии РНК с использованием антисмыслового массива генома Bacillus subtilis». J. Bacteriol. 183 (24): 7371–7380. Дои:10.1128 / JB.183.24.7371-7380.2001. ЧВК 95586. PMID 11717296.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка